<div dir="ltr"><div><div><div><div>Dear Petsc users<br><br></div>my aim is to parallelize the solution of a linear<br>system into a finite elements<br></div>ocean model.<br><br></div><div>The model has been almost entirely parallelized, with<br></div><div>a partitioning of the domain made element-wise through<br></div><div>the use of Zoltan libraries, so the subdomains<br></div><div>share the nodes lying on the edges.<br><br></div><div>The linear system includes node-to-node dependencies<br></div><div>so my guess is that I need to create an halo surrounding <br></div><div>each subdomain, to allow connections of edge nodes with<br></div><div>neighbour subdomains ones<br></div><div><br></div><div>Apart from that, my question is if Petsc accept a<br></div><div>previously made partitioning (maybe taking into account of halo)<br></div><div>using the data structures coming out of it<br></div><div><br></div><div>Has anybody of you ever faced a similar problem?<br><br></div><div>Thanks in advance<br></div><div>Ivano <br></div></div><br></div>