<div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote">On Mon, Jul 11, 2016 at 3:13 AM, Marco Zocca <span dir="ltr"><<a href="mailto:zocca.marco@gmail.com" target="_blank">zocca.marco@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-style:solid;border-left-color:rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Sorry for the previous mail, I hadn't fully read  ./configure --help :<br>
all external package options are listed there, including HDF5<br>
<br>
As far as I can see in<br>
<a href="https://www.mcs.anl.gov/petsc/miscellaneous/external.html" rel="noreferrer" target="_blank">https://www.mcs.anl.gov/petsc/miscellaneous/external.html</a> and on the<br>
PDF manual, not all external packages are mentioned, and this tripped<br>
me initially.<br>
<br>
So my question becomes: please synchronize the output of ./configure<br>
--help with manpages and pdf manual :)<br></blockquote><div><br></div><div>Done.</div><div><br></div><div><a href="https://bitbucket.org/petsc/petsc/commits/b6541ed63645a657daaf31a0efc9fb29a825bfaf">https://bitbucket.org/petsc/petsc/commits/b6541ed63645a657daaf31a0efc9fb29a825bfaf</a><br></div><div><br></div><div>   Matt</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-style:solid;border-left-color:rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
Thanks again,<br>
Marco<br>
<div class=""><div class="h5"><br>
<br>
On 11 July 2016 at 09:57, Marco Zocca <<a href="mailto:zocca.marco@gmail.com">zocca.marco@gmail.com</a>> wrote:<br>
> Good morning,<br>
><br>
>    Does the HDF5 functionality need to be explicitly requested at<br>
> configure time? I just noticed that my default configuration on a<br>
> single-node machine does not compile any relevant symbol.<br>
><br>
> I do not have HDF5 installed on my system yet, but I assumed PETSc<br>
> includes it by default, or automagically pulls the dependency in at<br>
> config time, since the manual doesn't mention anything about it. Do I<br>
> have to install HDF5 from source and rebuild PETSc then?<br>
><br>
> Thanks in advance,<br>
> Marco<br>
><br>
><br>
><br>
> --- config options and architecture :<br>
><br>
> Configure Options: --configModules=PETSc.Configure<br>
> --optionsModule=config.compilerOptions --with-cc=gcc --with-cxx=g++<br>
> --with-fc=gfortran --download-fblaslapack --download-mpich<br>
> Working directory: /Users/ocramz/petsc-3.7.2<br>
> Machine platform:<br>
> ('Darwin', 'fermi.local', '13.4.0', 'Darwin Kernel Version 13.4.0: Sun<br>
> Aug 17 19:50:11 PDT 2014; root:xnu-2422.115.4~1/RELEASE_X86_64',<br>
> 'x86_64', 'i386')<br>
> Python version:<br>
> 2.7.5 (default, Mar  9 2014, 22:15:05)<br>
> [GCC 4.2.1 Compatible Apple LLVM 5.0 (clang-500.0.68)]<br>
</div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature">What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>-- Norbert Wiener</div>
</div></div>