<div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><br>
> GAMG: createProl       6 1.0 1.0036e+01 1.0 3.68e+07 1.2 1.5e+06 2.7e+03 1.3e+03  1  0 23  1 31   1  0 23  1 31  1332<br>
>   Graph               12 1.0 6.0783e+00 1.0 4.52e+06 1.1 3.8e+05 9.0e+02 2.5e+02  1  0  6  0  6   1  0  6  0  6   279<br>
>   MIS/Agg              6 1.0 9.5831e-02 1.2 0.00e+00 0.0 2.6e+05 1.1e+03 4.1e+01  0  0  4  0  1   0  0  4  0  1     0<br>
>   SA: col data         6 1.0 7.7358e-01 1.0 0.00e+00 0.0 6.7e+05 2.9e+03 7.8e+02  0  0 10  0 19   0  0 10  0 19     0<br>
>   SA: frmProl0         6 1.0 1.0759e+00 1.0 0.00e+00 0.0 6.2e+04 7.6e+03 6.0e+01  0  0  1  0  1   0  0  1  0  1     0<br>
> GAMG: partLevel        6 1.0 3.8136e+01 1.0 9.09e+08 1.1 3.8e+05 5.0e+04 5.4e+02  6  3  6  4 13   6  3  6  4 14  9013<br>
>   repartition          6 1.0 2.7910e+00 1.0 0.00e+00 0.0 4.6e+04 1.3e+02 1.6e+02  0  0  1  0  4   0  0  1  0  4     0<br>
>   Invert-Sort          6 1.0 2.5045e+00 2.0 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 2.4e+01  0  0  0  0  1   0  0  0  0  1     0<br>
>   Move A               6 1.0 1.4832e+01 1.0 0.00e+00 0.0 8.5e+04 1.7e+05 1.1e+02  2  0  1  3  3   2  0  1  3  3     0<br>
>   Move P               6 1.0 1.2023e+01 1.0 0.00e+00 0.0 2.4e+04 3.8e+03 1.1e+02  2  0  0  0  3   2  0  0  0  3     0<br></blockquote><div><br></div><div><br></div><div>THe number of these calls (eg, 6) is the number of grids that are setup.</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
> PCSetUp              100 1.0 1.1212e+02 1.0 1.84e+10 1.1 3.2e+06 1.3e+05 2.2e+03 17 52 49 84 54  17 52 49 84 54 62052<br>
> PCSetUpOnBlocks       40 1.0 1.0386e+00 1.2 1.95e+08 1.2 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00  0  1  0  0  0   0  1  0  0  0 67368<br>
> PCApply              380 1.0 2.0034e+01 1.1 8.60e+09 1.1 1.5e+06 9.9e+03 6.0e+01  3 24 22  3  1   3 24 22  3  1 161973<br>
> SFSetGraph            12 1.0 4.9813e-0310.2 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00  0  0  0  0  0   0  0  0  0  0     0<br>
> SFBcastBegin          47 1.0 3.3110e-02 2.6 0.00e+00 0.0 2.6e+05 1.1e+03 6.0e+00  0  0  4  0  0   0  0  4  0  0     0<br>
> SFBcastEnd            47 1.0 1.3497e-02 3.6 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00  0  0  0  0  0   0  0  0  0  0     0<br>
> SFReduceBegin          6 1.0 1.8593e-02 4.2 0.00e+00 0.0 7.2e+04 4.9e+02 6.0e+00  0  0  1  0  0   0  0  1  0  0     0<br>
> SFReduceEnd            6 1.0 7.1628e-0318.5 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00  0  0  0  0  0   0  0  0  0  0     0<br>
> BuildTwoSided         12 1.0 3.5771e-02 2.5 0.00e+00 0.0 5.0e+04 4.0e+00 1.2e+01  0  0  1  0  0   0  0  1  0  0     0<br>
> ----------------------------------------------------------------------<br>
> --------------------------------------------------<br>
><br>
> Memory usage is given in bytes:<br>
><br>
> Object Type          Creations   Destructions     Memory  Descendants' Mem.<br>
> Reports information only for process 0.<br>
><br>
> --- Event Stage 0: Main Stage<br>
><br>
>               Matrix   302            299   1992700700     0.<br>
> Matrix Partitioning     6              6         3888     0.<br>
>       Matrix Coarsen     6              6         3768     0.<br>
>               Vector   600            600   1582204168     0.<br>
>       Vector Scatter    87             87      5614432     0.<br>
>        Krylov Solver    11             11        59472     0.<br>
>       Preconditioner    11             11        11120     0.<br>
>          PetscRandom     1              1          638     0.<br>
>               Viewer     1              0            0     0.<br>
>            Index Set   247            247      9008420     0.<br>
> Star Forest Bipartite Graph    12             12        10176     0.<br>
> ======================================================================<br>
> ==================================================<br>
><br>
> And for  petsc 3.6.1:<br>
><br>
> Using Petsc Development GIT revision: v3.6.1-307-g26c82d3  GIT Date:<br>
> 2015-08-06 11:50:34 -0500<br>
><br>
>                          Max       Max/Min        Avg      Total<br>
> Time (sec):           5.515e+02      1.00001   5.515e+02<br>
> Objects:              1.231e+03      1.00490   1.226e+03<br>
> Flops:                3.431e+10      1.12609   3.253e+10  1.301e+13<br>
> Flops/sec:            6.222e+07      1.12609   5.899e+07  2.359e+10<br>
> MPI Messages:         4.432e+04      7.84165   1.504e+04  6.016e+06<br>
> MPI Message Lengths:  2.236e+09     12.61261   5.027e+04  3.024e+11<br>
> MPI Reductions:       4.012e+03      1.00150<br>
><br>
> Flop counting convention: 1 flop = 1 real number operation of type (multiply/divide/add/subtract)<br>
>                             e.g., VecAXPY() for real vectors of length N --> 2N flops<br>
>                             and VecAXPY() for complex vectors of<br>
> length N --> 8N flops<br>
><br>
> Summary of Stages:   ----- Time ------  ----- Flops -----  --- Messages ---  -- Message Lengths --  -- Reductions --<br>
>                         Avg     %Total     Avg     %Total   counts   %Total     Avg         %Total   counts   %Total<br>
> 0:      Main Stage: 5.5145e+02 100.0%  1.3011e+13 100.0%  6.007e+06  99.9%  5.020e+04       99.9%  3.999e+03  99.7%<br>
><br>
> ----------------------------------------------------------------------<br>
> --------------------------------------------------<br>
> See the 'Profiling' chapter of the users' manual for details on interpreting output.<br>
> Phase summary info:<br>
>    Count: number of times phase was executed<br>
>    Time and Flops: Max - maximum over all processors<br>
>                    Ratio - ratio of maximum to minimum over all processors<br>
>    Mess: number of messages sent<br>
>    Avg. len: average message length (bytes)<br>
>    Reduct: number of global reductions<br>
>    Global: entire computation<br>
>    Stage: stages of a computation. Set stages with PetscLogStagePush() and PetscLogStagePop().<br>
>       %T - percent time in this phase         %F - percent flops in this phase<br>
>       %M - percent messages in this phase     %L - percent message lengths in this phase<br>
>       %R - percent reductions in this phase<br>
>    Total Mflop/s: 10e-6 * (sum of flops over all processors)/(max time<br>
> over all processors)<br>
> ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------<br>
> Event                Count      Time (sec)     Flops                             --- Global ---  --- Stage ---   Total<br>
>                    Max Ratio  Max     Ratio   Max  Ratio  Mess   Avg len Reduct  %T %F %M %L %R  %T %F %M %L %R Mflop/s<br>
> ----------------------------------------------------------------------<br>
> --------------------------------------------------<br>
><br>
> --- Event Stage 0: Main Stage<br>
><br>
> MatMult              500 1.0 1.0172e+01 1.2 6.68e+09 1.1 1.9e+06 9.9e+03 0.0e+00  2 19 31  6  0   2 19 31  6  0 247182<br>
> MatMultTranspose     120 1.0 6.9889e-01 1.2 3.56e+08 1.1 2.5e+05 1.4e+04 0.0e+00  0  1  4  1  0   0  1  4  1  0 197492<br>
> MatSolve             380 1.0 3.9310e+00 1.1 1.17e+09 1.1 1.3e+04 5.7e+01 6.0e+01  1  3  0  0  1   1  3  0  0  2 112069<br>
> MatSOR               120 1.0 1.3915e+01 1.1 6.73e+09 1.1 9.5e+05 7.4e+03 0.0e+00  2 20 16  2  0   2 20 16  2  0 182405<br>
> MatLUFactorSym         2 1.0 2.1180e-01 1.8 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 1.0e+01  0  0  0  0  0   0  0  0  0  0     0<br>
> MatLUFactorNum        60 1.0 7.9378e+00 1.0 1.95e+08 1.2 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00  1  1  0  0  0   1  1  0  0  0  8814<br>
> MatILUFactorSym        1 1.0 2.3076e-02 1.5 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00  0  0  0  0  0   0  0  0  0  0     0<br>
> MatConvert             6 1.0 3.2693e-02 1.5 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 1.8e+01  0  0  0  0  0   0  0  0  0  0     0<br>
> MatScale               6 1.0 2.1923e-02 1.7 4.50e+06 1.1 2.4e+04 1.5e+03 0.0e+00  0  0  0  0  0   0  0  0  0  0 77365<br>
> MatAssemblyBegin     266 1.0 1.0337e+01 4.4 0.00e+00 0.0 1.8e+05 3.8e+03 4.2e+02  1  0  3  0 10   1  0  3  0 10     0<br>
> MatAssemblyEnd       266 1.0 3.0336e+00 1.0 0.00e+00 0.0 4.1e+05 8.6e+02 4.7e+02  1  0  7  0 12   1  0  7  0 12     0<br>
> MatGetRow        6730366 1.1 8.6473e-01 1.2 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00  0  0  0  0  0   0  0  0  0  0     0<br>
> MatGetRowIJ            3 3.0 5.2931e-035550.2 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00  0  0  0  0  0   0  0  0  0  0     0<br>
> MatGetSubMatrix       12 1.0 2.2689e+01 1.0 0.00e+00 0.0 1.1e+05 1.3e+05 1.9e+02  4  0  2  5  5   4  0  2  5  5     0<br>
> MatGetOrdering         3 3.0 6.5000e-03 5.4 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00  0  0  0  0  0   0  0  0  0  0     0<br>
> MatPartitioning        6 1.0 2.9801e+00 1.0 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 1.4e+01  1  0  0  0  0   1  0  0  0  0     0<br>
> MatCoarsen             6 1.0 9.5374e-02 1.1 0.00e+00 0.0 2.5e+05 1.1e+03 3.8e+01  0  0  4  0  1   0  0  4  0  1     0<br>
> MatZeroEntries        22 1.0 6.1185e-01 1.2 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00  0  0  0  0  0   0  0  0  0  0     0<br>
> MatTranspose           6 1.0 1.9780e-01 1.1 0.00e+00 0.0 1.9e+05 8.6e+02 7.8e+01  0  0  3  0  2   0  0  3  0  2     0<br>
> MatPtAP              120 1.0 5.2996e+01 1.0 1.70e+10 1.1 9.7e+05 2.1e+05 4.2e+02 10 49 16 67 10  10 49 16 67 11 120900<br>
> MatPtAPSymbolic       12 1.0 5.8209e+00 1.0 0.00e+00 0.0 2.2e+05 3.7e+04 8.4e+01  1  0  4  3  2   1  0  4  3  2     0<br>
> MatPtAPNumeric       120 1.0 4.7185e+01 1.0 1.70e+10 1.1 7.6e+05 2.6e+05 3.4e+02  9 49 13 64  8   9 49 13 64  8 135789<br>
> MatTrnMatMult          3 1.0 1.1679e+00 1.0 3.22e+07 1.2 8.2e+04 8.0e+03 5.7e+01  0  0  1  0  1   0  0  1  0  1  9997<br>
> MatTrnMatMultSym       3 1.0 6.8366e-01 1.0 0.00e+00 0.0 6.9e+04 3.9e+03 5.1e+01  0  0  1  0  1   0  0  1  0  1     0<br>
> MatTrnMatMultNum       3 1.0 4.8513e-01 1.0 3.22e+07 1.2 1.3e+04 3.0e+04 6.0e+00  0  0  0  0  0   0  0  0  0  0 24069<br>
> MatGetLocalMat       126 1.0 1.1939e+00 1.3 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00  0  0  0  0  0   0  0  0  0  0     0<br>
> MatGetBrAoCol        120 1.0 5.9887e-01 2.7 0.00e+00 0.0 5.7e+05 3.3e+04 0.0e+00  0  0  9  6  0   0  0  9  6  0     0<br>
> MatGetSymTrans        24 1.0 1.4878e-01 1.4 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00  0  0  0  0  0   0  0  0  0  0     0<br>
> VecDot               320 1.0 1.5860e+00 1.5 2.04e+08 1.1 0.0e+00 0.0e+00 3.2e+02  0  1  0  0  8   0  1  0  0  8 49574<br>
> VecMDot              260 1.0 1.8154e+00 2.5 3.70e+08 1.1 0.0e+00 0.0e+00 2.6e+02  0  1  0  0  6   0  1  0  0  7 78497<br>
> VecNorm              440 1.0 2.8876e+00 1.8 5.88e+08 1.1 0.0e+00 0.0e+00 4.4e+02  0  2  0  0 11   0  2  0  0 11 78281<br>
> VecScale             320 1.0 2.2738e-01 1.2 7.88e+07 1.1 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00  0  0  0  0  0   0  0  0  0  0 133517<br>
> VecCopy              220 1.0 7.1162e-01 1.2 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00  0  0  0  0  0   0  0  0  0  0     0<br>
> VecSet               862 1.0 7.0683e-01 1.5 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00  0  0  0  0  0   0  0  0  0  0     0<br>
> VecAXPY              440 1.0 9.0657e-01 1.2 3.83e+08 1.1 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00  0  1  0  0  0   0  1  0  0  0 162612<br>
> VecAYPX              280 1.0 5.8935e-01 1.5 1.92e+08 1.1 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00  0  1  0  0  0   0  1  0  0  0 125070<br>
> VecMAXPY             300 1.0 9.7644e-01 1.2 4.98e+08 1.1 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00  0  1  0  0  0   0  1  0  0  0 196269<br>
> VecAssemblyBegin     234 1.0 5.0308e+00 5.5 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 6.8e+02  1  0  0  0 17   1  0  0  0 17     0<br>
> VecAssemblyEnd       234 1.0 1.8253e-03 8.8 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00  0  0  0  0  0   0  0  0  0  0     0<br>
> VecScatterBegin     1083 1.0 2.8195e-01 4.7 0.00e+00 0.0 3.8e+06 8.4e+03 2.0e+01  0  0 64 11  0   0  0 64 11  1     0<br>
> VecScatterEnd       1063 1.0 3.4924e+00 6.9 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00  0  0  0  0  0   0  0  0  0  0     0<br>
> KSPGMRESOrthog        20 1.0 1.5598e+00 3.2 1.28e+08 1.1 0.0e+00 0.0e+00 2.0e+01  0  0  0  0  0   0  0  0  0  1 31503<br>
> KSPSetUp             222 1.0 9.7521e-02 1.6 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 1.2e+01  0  0  0  0  0   0  0  0  0  0     0<br>
> KSPSolve              60 1.0 1.3742e+02 1.0 3.42e+10 1.1 5.7e+06 4.4e+04 3.2e+03 25100 95 83 79  25100 95 83 79 94396<br>
> PCGAMGGraph_AGG        6 1.0 5.7683e+00 1.0 4.50e+06 1.1 3.8e+05 9.1e+02 2.5e+02  1  0  6  0  6   1  0  6  0  6   294<br>
> PCGAMGCoarse_AGG       6 1.0 1.4101e+00 1.0 3.22e+07 1.2 4.0e+05 3.2e+03 1.4e+02  0  0  7  0  4   0  0  7  0  4  8280<br>
> PCGAMGProl_AGG         6 1.0 1.8976e+00 1.0 0.00e+00 0.0 7.2e+05 3.4e+03 8.6e+02  0  0 12  1 22   0  0 12  1 22     0<br>
> PCGAMGPOpt_AGG         6 1.0 5.7220e-06 0.0 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00  0  0  0  0  0   0  0  0  0  0     0<br>
> GAMG: createProl       6 1.0 9.0840e+00 1.0 3.67e+07 1.2 1.5e+06 2.7e+03 1.3e+03  2  0 25  1 31   2  0 25  1 31  1472<br>
>   Graph               12 1.0 5.7669e+00 1.0 4.50e+06 1.1 3.8e+05 9.1e+02 2.5e+02  1  0  6  0  6   1  0  6  0  6   294<br>
>   MIS/Agg              6 1.0 9.5481e-02 1.1 0.00e+00 0.0 2.5e+05 1.1e+03 3.8e+01  0  0  4  0  1   0  0  4  0  1     0<br>
>   SA: col data         6 1.0 8.5414e-01 1.0 0.00e+00 0.0 6.6e+05 3.0e+03 7.8e+02  0  0 11  1 19   0  0 11  1 20     0<br>
>   SA: frmProl0         6 1.0 1.0123e+00 1.0 0.00e+00 0.0 6.2e+04 7.6e+03 6.0e+01  0  0  1  0  1   0  0  1  0  2     0<br>
> GAMG: partLevel        6 1.0 3.6150e+01 1.0 8.41e+08 1.1 3.5e+05 5.0e+04 5.3e+02  7  2  6  6 13   7  2  6  6 13  8804<br>
>   repartition          6 1.0 3.8351e+00 1.0 0.00e+00 0.0 4.7e+04 1.3e+02 1.6e+02  1  0  1  0  4   1  0  1  0  4     0<br>
>   Invert-Sort          6 1.0 4.4953e+00 1.8 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 2.4e+01  1  0  0  0  1   1  0  0  0  1     0<br>
>   Move A               6 1.0 1.0806e+01 1.0 0.00e+00 0.0 8.5e+04 1.6e+05 1.0e+02  2  0  1  5  3   2  0  1  5  3     0<br>
>   Move P               6 1.0 1.1953e+01 1.0 0.00e+00 0.0 2.5e+04 3.6e+03 1.0e+02  2  0  0  0  3   2  0  0  0  3     0<br>
> PCSetUp              100 1.0 1.0166e+02 1.0 1.72e+10 1.1 2.7e+06 8.3e+04 2.2e+03 18 50 44 73 54  18 50 44 73 54 63848<br>
> PCSetUpOnBlocks       40 1.0 1.0812e+00 1.2 1.95e+08 1.2 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00  0  1  0  0  0   0  1  0  0  0 64711<br>
> PCApply              380 1.0 1.9359e+01 1.1 8.58e+09 1.1 1.4e+06 9.6e+03 6.0e+01  3 25 24  5  1   3 25 24  5  2 167605<br>
> SFSetGraph            12 1.0 3.5203e-03 6.8 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00  0  0  0  0  0   0  0  0  0  0     0<br>
> SFBcastBegin          44 1.0 2.4242e-02 3.0 0.00e+00 0.0 2.5e+05 1.1e+03 6.0e+00  0  0  4  0  0   0  0  4  0  0     0<br>
> SFBcastEnd            44 1.0 3.0994e-02 8.6 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00  0  0  0  0  0   0  0  0  0  0     0<br>
> SFReduceBegin          6 1.0 1.6784e-02 3.8 0.00e+00 0.0 7.1e+04 5.0e+02 6.0e+00  0  0  1  0  0   0  0  1  0  0     0<br>
> SFReduceEnd            6 1.0 8.6989e-0332.0 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00  0  0  0  0  0   0  0  0  0  0     0<br>
> ----------------------------------------------------------------------<br>
> --------------------------------------------------<br>
><br>
> Memory usage is given in bytes:<br>
><br>
> Object Type          Creations   Destructions     Memory  Descendants' Mem.<br>
> Reports information only for process 0.<br>
><br>
> --- Event Stage 0: Main Stage<br>
><br>
>               Matrix   246            243   1730595756     0<br>
> Matrix Partitioning     6              6         3816     0<br>
>       Matrix Coarsen     6              6         3720     0<br>
>               Vector   602            602   1603749672     0<br>
>       Vector Scatter    87             87      4291136     0<br>
>        Krylov Solver    12             12        60416     0<br>
>       Preconditioner    12             12        12040     0<br>
>               Viewer     1              0            0     0<br>
>            Index Set   247            247      9018060     0<br>
> Star Forest Bipartite Graph    12             12        10080     0<br>
> ======================================================================<br>
> ==================================================<br>
><br>
> Any idea why there are more matrix created with version 3.7.2? I only have 2 MatCreate calls and 4 VecCreate calls in my code!, so I assume the others are internally created.<br>
><br>
><br>
> Thank you,<br>
><br>
><br>
> Hassan Raiesi, PhD<br>
><br>
> Advanced Aerodynamics Department<br>
> Bombardier Aerospace<br>
><br>
> <a href="mailto:hassan.raiesi@aero.bombardier.com">hassan.raiesi@aero.bombardier.com</a><br>
><br>
> 2351 boul. Alfred-Nobel (BAN1)<br>
> Ville Saint-Laurent, Québec, H4S 2A9<br>
><br>
><br>
><br>
> Tél.<br>
>   514-855-5001    # 62204<br>
><br>
><br>
><br>
> <image001.png><br>
><br>
><br>
> CONFIDENTIALITY NOTICE - This communication may contain privileged or confidential information.<br>
> If you are not the intended recipient or received this communication<br>
> by error, please notify the sender and delete the message without copying, forwarding and/or disclosing it.<br>
<br>
<br>
</blockquote></div><br></div></div>