<div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote">On Wed, Feb 24, 2016 at 1:54 AM, TAY wee-beng <span dir="ltr"><<a href="mailto:zonexo@gmail.com" target="_blank">zonexo@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
  
    
  
  <div bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
    <br>
    <pre cols="72"></pre>
    <div>On 24/2/2016 10:28 AM, Matthew Knepley
      wrote:<br>
    </div>
    <blockquote type="cite">
      <div dir="ltr">
        <div class="gmail_extra">
          <div class="gmail_quote">On Tue, Feb 23, 2016 at 7:50 PM, TAY
            wee-beng <span dir="ltr"><<a href="mailto:zonexo@gmail.com" target="_blank">zonexo@gmail.com</a>></span>
            wrote:<br>
            <blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi,<br>
              <br>
              I got this error (also attached, full) when running my
              code. It happens after a few thousand time steps.<br>
              <br>
              The strange thing is that for 2 different clusters, it
              stops at 2 different time steps.<br>
              <br>
              I wonder if it's related to DM since this happens after I
              added DM into my code.<br>
              <br>
              In this case, how can I find out the error? I'm thinking
              valgrind may take very long and gives too many false
              errors.</blockquote>
            <div><br>
            </div>
            <div>It is very easy to find leaks. You just run a few steps
              with -malloc_dump and see what is left over.</div>
            <div><br>
            </div>
            <div>   Matt</div>
          </div>
        </div>
      </div>
    </blockquote>
    Hi Matt, <br>
    <br>
    Do you mean running my a.out with the -malloc_dump and stop after a
    few time steps?<br>
    <br>
    What and how should I "see" then?</div></blockquote><div><br></div><div>-malloc_dump outputs all unfreed memory to the screen after PetscFinalize(), so you should see the leak.</div><div>I guess it might be possible to keep creating things that you freed all at once at the end, but that is less likely.</div><div><br></div><div>   Matt</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div bgcolor="#FFFFFF" text="#000000"> <blockquote type="cite"><div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote">
            <blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><span><font color="#888888"><br><span class="HOEnZb"><font color="#888888">
                  -- <br>
                  Thank you<br>
                  <br>
                  Yours sincerely,<br>
                  <br>
                  TAY wee-beng<br>
                  <br>
                </font></span></font></span></blockquote><span class="HOEnZb"><font color="#888888">
          </font></span></div><span class="HOEnZb"><font color="#888888">
          <br>
          <br clear="all">
          <div><br>
          </div>
          -- <br>
          <div>What most experimenters take for
            granted before they begin their experiments is infinitely
            more interesting than any results to which their experiments
            lead.<br>
            -- Norbert Wiener</div>
        </font></span></div>
      </div>
    </blockquote>
    <br>
  </div>

</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature">What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>-- Norbert Wiener</div>
</div></div>