<div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote">Gideon :<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex"><div style="word-wrap:break-word"><div><br></div><div>I ran with that flag because, while solving a SNES with MUMPS, the code would just sit there as though it had died, and never seem to recover.  I tried using that flag just to determine where it had stalled, which was at the "ordering based on METIS” bit.</div></div></blockquote><div> </div><div>If you suspect  METIS/ParMetis hangs,</div><div>then turn to other sequential matrix orderings, e.g., </div><div>' -mat_mumps_icntl_29 0 -mat_mumps_icntl_7 2', which I found the most robust ordering.</div><div>Run your code with '-help |grep mumps', it will display mumps options.</div><div><br></div><div>Hong</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex"><div style="word-wrap:break-word"><div><span class=""><font color="#888888"><br><div>
<span style="border-collapse:separate;color:rgb(0,0,0);font-family:Helvetica;font-style:normal;font-variant:normal;font-weight:normal;letter-spacing:normal;line-height:normal;text-align:-webkit-auto;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px">-gideon</span>

</div></font></span><div><div class="h5">
<br><div><blockquote type="cite"><div>On Aug 25, 2015, at 12:24 PM, Hong <<a href="mailto:hzhang@mcs.anl.gov" target="_blank">hzhang@mcs.anl.gov</a>> wrote:</div><br><div><div dir="ltr"><div>Gideon:<br></div>-mat_mumps_icntl_4 <0>: ICNTL(4): level of printing (0 to 4) (None)<div>This is for algorithmic diagnosis, not for regular runs. Use default '0' for it.</div><div><br></div><div>Hong<br><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Tue, Aug 25, 2015 at 9:06 AM, Gideon Simpson <span dir="ltr"><<a href="mailto:gideon.simpson@gmail.com" target="_blank">gideon.simpson@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">Regarding the MUMPS issue, I’m not sure if this is useful, but when I run with the mumps flags  -mat_mumps_icntl_4 4, to see the progress, it hangs at this point:<br>
<br>
<br>
 ... Structural symmetry (in percent)=   75<br>
 Density: NBdense, Average, Median   =    2    9    7<br>
 Ordering based on METIS<br>
<span><br>
-gideon<br>
<br>
> On Aug 22, 2015, at 5:12 PM, Barry Smith <<a href="mailto:bsmith@mcs.anl.gov" target="_blank">bsmith@mcs.anl.gov</a>> wrote:<br>
><br>
><br>
</span><div><div>>> On Aug 22, 2015, at 4:04 PM, Gideon Simpson <<a href="mailto:gideon.simpson@gmail.com" target="_blank">gideon.simpson@gmail.com</a>> wrote:<br>
>><br>
>> I’m having issues with both SuperLU dist and MUMPS, as compiled by PETsc, in the following sense:<br>
>><br>
>> 1.  For large enough systems, which seems to vary depending on which computer I’m on, MUMPS seems to just die and never start, when it’s used as the linear solver within a SNES.    There’s no error message, it just sits there and doesn’t do anything.<br>
><br>
>  You will need to use a debugger to figure out where it is "hanging"; we haven't heard reports about this.<br>
>><br>
>> 2.  When running with SuperLU dist, I got the following error, with no further information:<br>
><br>
>  The last release of SuperLU_DIST had some pretty nasty bugs, memory corruption that caused crashes etc. We think they are now fixed if you use the maint branch of the PETSc repository and --download-superlu_dist  If you stick with the PETSc release and SuperLU_Dist you are using you will keep seeing these crashes<br>
><br>
>   Barry<br>
><br>
><br>
>><br>
>> [3]PETSC ERROR: ------------------------------------------------------------------------<br>
>> [3]PETSC ERROR: Caught signal number 11 SEGV: Segmentation Violation, probably memory access out of range<br>
>> [3]PETSC ERROR: Try option -start_in_debugger or -on_error_attach_debugger<br>
>> [3]PETSC ERROR: or see <a href="http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html#valgrind" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html#valgrind</a><br>
>> [3]PETSC ERROR: or try <a href="http://valgrind.org/" rel="noreferrer" target="_blank">http://valgrind.org</a> on GNU/linux and Apple Mac OS X to find memory corruption errors<br>
>> [3]PETSC ERROR: likely location of problem given in stack below<br>
>> [3]PETSC ERROR: ---------------------  Stack Frames ------------------------------------<br>
>> [3]PETSC ERROR: Note: The EXACT line numbers in the stack are not available,<br>
>> [3]PETSC ERROR:       INSTEAD the line number of the start of the function<br>
>> [3]PETSC ERROR:       is given.<br>
>> [3]PETSC ERROR: [3] SuperLU_DIST:pdgssvx line 161 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/src/mat/impls/aij/mpi/superlu_dist/superlu_dist.c<br>
>> [3]PETSC ERROR: [3] MatSolve_SuperLU_DIST line 121 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/src/mat/impls/aij/mpi/superlu_dist/superlu_dist.c<br>
>> [3]PETSC ERROR: [3] MatSolve line 3104 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/src/mat/interface/matrix.c<br>
>> [3]PETSC ERROR: [3] PCApply_LU line 194 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/src/ksp/pc/impls/factor/lu/lu.c<br>
>> [3]PETSC ERROR: [3] KSP_PCApplyBAorAB line 258 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/include/petsc-private/kspimpl.h<br>
>> [3]PETSC ERROR: --------------------- Error Message --------------------------------------------------------------<br>
>> [3]PETSC ERROR: Signal received<br>
>> [3]PETSC ERROR: See <a href="http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html</a> for trouble shooting.<br>
>> [3]PETSC ERROR: Petsc Release Version 3.5.4, May, 23, 2015<br>
>> [3]PETSC ERROR: ./blowup_batch2 on a arch-linux2-c-debug named proteusi01 by simpson Sat Aug 22 17:01:41 2015<br>
>> [3]PETSC ERROR: Configure options --with-mpi-dir=/mnt/HA/opt/openmpi/intel/64/1.8.1-mlnx-ofed --with-blas-lib=/mnt/HA/opt/blas/gcc/64/20110419/libblas.a --with-lapack-lib=/liblapack.a --download-suitesparse=yes --download-superlu=yes --download-superlu_dist=yes --download-mumps=yes --download-metis=yes --download-parmetis=yes --download-scalapack=yes<br>
>> [3]PETSC ERROR: #1 User provided function() line 0 in  unknown file<br>
>> --------------------------------------------------------------------------<br>
>> MPI_ABORT was invoked on rank 3 in communicator MPI_COMM_WORLD<br>
>> with errorcode 59.<br>
>><br>
>> NOTE: invoking MPI_ABORT causes Open MPI to kill all MPI processes.<br>
>> You may or may not see output from other processes, depending on<br>
>> exactly when Open MPI kills them.<br>
>> --------------------------------------------------------------------------<br>
>> [proteusi01:14037] 1 more process has sent help message help-mpi-api.txt / mpi-abort<br>
>> [proteusi01:14037] Set MCA parameter "orte_base_help_aggregate" to 0 to see all help / error messages<br>
>> [6]PETSC ERROR: ------------------------------------------------------------------------<br>
>> [6]PETSC ERROR: Caught signal number 15 Terminate: Some process (or the batch system) has told this process to end<br>
>> [6]PETSC ERROR: Try option -start_in_debugger or -on_error_attach_debugger<br>
>> [6]PETSC ERROR: or see <a href="http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html#valgrind" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html#valgrind</a><br>
>> [6]PETSC ERROR: or try <a href="http://valgrind.org/" rel="noreferrer" target="_blank">http://valgrind.org</a> on GNU/linux and Apple Mac OS X to find memory corruption errors<br>
>> [6]PETSC ERROR: likely location of problem given in stack below<br>
>> [6]PETSC ERROR: ---------------------  Stack Frames ------------------------------------<br>
>> [6]PETSC ERROR: Note: The EXACT line numbers in the stack are not available,<br>
>> [6]PETSC ERROR:       INSTEAD the line number of the start of the function<br>
>> [6]PETSC ERROR:       is given.<br>
>> [6]PETSC ERROR: [6] SuperLU_DIST:pdgssvx line 161 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/src/mat/impls/aij/mpi/superlu_dist/superlu_dist.c<br>
>> [6]PETSC ERROR: [6] MatSolve_SuperLU_DIST line 121 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/src/mat/impls/aij/mpi/superlu_dist/superlu_dist.c<br>
>> [6]PETSC ERROR: [6] MatSolve line 3104 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/src/mat/interface/matrix.c<br>
>> [6]PETSC ERROR: [6] PCApply_LU line 194 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/src/ksp/pc/impls/factor/lu/lu.c<br>
>> [6]PETSC ERROR: [6] KSP_PCApplyBAorAB line 258 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/include/petsc-private/kspimpl.h<br>
>> [6]PETSC ERROR: --------------------- Error Message --------------------------------------------------------------<br>
>> [6]PETSC ERROR: Signal received<br>
>> [6]PETSC ERROR: See <a href="http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html</a> for trouble shooting.<br>
>> [6]PETSC ERROR: Petsc Release Version 3.5.4, May, 23, 2015<br>
>> [6]PETSC ERROR: ./blowup_batch2 on a arch-linux2-c-debug named proteusi01 by simpson Sat Aug 22 17:01:41 2015<br>
>> [6]PETSC ERROR: Configure options --with-mpi-dir=/mnt/HA/opt/openmpi/intel/64/1.8.1-mlnx-ofed --with-blas-lib=/mnt/HA/opt/blas/gcc/64/20110419/libblas.a --with-lapack-lib=/liblapack.a --download-suitesparse=yes --download-superlu=yes --download-superlu_dist=yes --download-mumps=yes --download-metis=yes --download-parmetis=yes --download-scalapack=yes<br>
>> [6]PETSC ERROR: #1 User provided function() line 0 in  unknown file<br>
>> [7]PETSC ERROR: ------------------------------------------------------------------------<br>
>> [7]PETSC ERROR: Caught signal number 15 Terminate: Some process (or the batch system) has told this process to end<br>
>> [7]PETSC ERROR: Try option -start_in_debugger or -on_error_attach_debugger<br>
>> [7]PETSC ERROR: or see <a href="http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html#valgrind" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html#valgrind</a><br>
>> [7]PETSC ERROR: or try <a href="http://valgrind.org/" rel="noreferrer" target="_blank">http://valgrind.org</a> on GNU/linux and Apple Mac OS X to find memory corruption errors<br>
>> [7]PETSC ERROR: likely location of problem given in stack below<br>
>> [7]PETSC ERROR: ---------------------  Stack Frames ------------------------------------<br>
>> [7]PETSC ERROR: Note: The EXACT line numbers in the stack are not available,<br>
>> [7]PETSC ERROR:       INSTEAD the line number of the start of the function<br>
>> [7]PETSC ERROR:       is given.<br>
>> [7]PETSC ERROR: [7] SuperLU_DIST:pdgssvx line 161 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/src/mat/impls/aij/mpi/superlu_dist/superlu_dist.c<br>
>> [7]PETSC ERROR: [7] MatSolve_SuperLU_DIST line 121 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/src/mat/impls/aij/mpi/superlu_dist/superlu_dist.c<br>
>> [7]PETSC ERROR: [7] MatSolve line 3104 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/src/mat/interface/matrix.c<br>
>> [7]PETSC ERROR: [7] PCApply_LU line 194 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/src/ksp/pc/impls/factor/lu/lu.c<br>
>> [7]PETSC ERROR: [7] KSP_PCApplyBAorAB line 258 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/include/petsc-private/kspimpl.h<br>
>> [7]PETSC ERROR: --------------------- Error Message --------------------------------------------------------------<br>
>> [7]PETSC ERROR: Signal received<br>
>> [7]PETSC ERROR: See <a href="http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html</a> for trouble shooting.<br>
>> [7]PETSC ERROR: Petsc Release Version 3.5.4, May, 23, 2015<br>
>> [7]PETSC ERROR: ./blowup_batch2 on a arch-linux2-c-debug named proteusi01 by simpson Sat Aug 22 17:01:41 2015<br>
>> [7]PETSC ERROR: Configure options --with-mpi-dir=/mnt/HA/opt/openmpi/intel/64/1.8.1-mlnx-ofed --with-blas-lib=/mnt/HA/opt/blas/gcc/64/20110419/libblas.a --with-lapack-lib=/liblapack.a --download-suitesparse=yes --download-superlu=yes --download-superlu_dist=yes --download-mumps=yes --download-metis=yes --download-parmetis=yes --download-scalapack=yes<br>
>> [7]PETSC ERROR: #1 User provided function() line 0 in  unknown file<br>
>> [0]PETSC ERROR: ------------------------------------------------------------------------<br>
>> [0]PETSC ERROR: Caught signal number 15 Terminate: Some process (or the batch system) has told this process to end<br>
>> [0]PETSC ERROR: Try option -start_in_debugger or -on_error_attach_debugger<br>
>> [0]PETSC ERROR: or see <a href="http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html#valgrind" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html#valgrind</a><br>
>> [0]PETSC ERROR: or try <a href="http://valgrind.org/" rel="noreferrer" target="_blank">http://valgrind.org</a> on GNU/linux and Apple Mac OS X to find memory corruption errors<br>
>> [0]PETSC ERROR: likely location of problem given in stack below<br>
>> [0]PETSC ERROR: ---------------------  Stack Frames ------------------------------------<br>
>> [0]PETSC ERROR: Note: The EXACT line numbers in the stack are not available,<br>
>> [0]PETSC ERROR:       INSTEAD the line number of the start of the function<br>
>> [0]PETSC ERROR:       is given.<br>
>> [0]PETSC ERROR: [0] SuperLU_DIST:pdgssvx line 161 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/src/mat/impls/aij/mpi/superlu_dist/superlu_dist.c<br>
>> [0]PETSC ERROR: [0] MatSolve_SuperLU_DIST line 121 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/src/mat/impls/aij/mpi/superlu_dist/superlu_dist.c<br>
>> [0]PETSC ERROR: [0] MatSolve line 3104 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/src/mat/interface/matrix.c<br>
>> [0]PETSC ERROR: [0] PCApply_LU line 194 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/src/ksp/pc/impls/factor/lu/lu.c<br>
>> [0]PETSC ERROR: [0] KSP_PCApplyBAorAB line 258 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/include/petsc-private/kspimpl.h<br>
>> [0]PETSC ERROR: --------------------- Error Message --------------------------------------------------------------<br>
>> [0]PETSC ERROR: Signal received<br>
>> [0]PETSC ERROR: See <a href="http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html</a> for trouble shooting.<br>
>> [0]PETSC ERROR: Petsc Release Version 3.5.4, May, 23, 2015<br>
>> [0]PETSC ERROR: ./blowup_batch2 on a arch-linux2-c-debug named proteusi01 by simpson Sat Aug 22 17:01:41 2015<br>
>> [0]PETSC ERROR: Configure options --with-mpi-dir=/mnt/HA/opt/openmpi/intel/64/1.8.1-mlnx-ofed --with-blas-lib=/mnt/HA/opt/blas/gcc/64/20110419/libblas.a --with-lapack-lib=/liblapack.a --download-suitesparse=yes --download-superlu=yes --download-superlu_dist=yes --download-mumps=yes --download-metis=yes --download-parmetis=yes --download-scalapack=yes<br>
>> [0]PETSC ERROR: #1 User provided function() line 0 in  unknown file<br>
>> [1]PETSC ERROR: ------------------------------------------------------------------------<br>
>> [1]PETSC ERROR: Caught signal number 15 Terminate: Some process (or the batch system) has told this process to end<br>
>> [1]PETSC ERROR: Try option -start_in_debugger or -on_error_attach_debugger<br>
>> [1]PETSC ERROR: or see <a href="http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html#valgrind" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html#valgrind</a><br>
>> [1]PETSC ERROR: or try <a href="http://valgrind.org/" rel="noreferrer" target="_blank">http://valgrind.org</a> on GNU/linux and Apple Mac OS X to find memory corruption errors<br>
>> [1]PETSC ERROR: likely location of problem given in stack below<br>
>> [1]PETSC ERROR: ---------------------  Stack Frames ------------------------------------<br>
>> [1]PETSC ERROR: Note: The EXACT line numbers in the stack are not available,<br>
>> [1]PETSC ERROR:       INSTEAD the line number of the start of the function<br>
>> [1]PETSC ERROR:       is given.<br>
>> [1]PETSC ERROR: [1] SuperLU_DIST:pdgssvx line 161 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/src/mat/impls/aij/mpi/superlu_dist/superlu_dist.c<br>
>> [1]PETSC ERROR: [1] MatSolve_SuperLU_DIST line 121 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/src/mat/impls/aij/mpi/superlu_dist/superlu_dist.c<br>
>> [1]PETSC ERROR: [1] MatSolve line 3104 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/src/mat/interface/matrix.c<br>
>> [1]PETSC ERROR: [1] PCApply_LU line 194 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/src/ksp/pc/impls/factor/lu/lu.c<br>
>> [1]PETSC ERROR: [1] KSP_PCApplyBAorAB line 258 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/include/petsc-private/kspimpl.h<br>
>> [1]PETSC ERROR: --------------------- Error Message --------------------------------------------------------------<br>
>> [1]PETSC ERROR: Signal received<br>
>> [1]PETSC ERROR: See <a href="http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html</a> for trouble shooting.<br>
>> [1]PETSC ERROR: Petsc Release Version 3.5.4, May, 23, 2015<br>
>> [1]PETSC ERROR: ./blowup_batch2 on a arch-linux2-c-debug named proteusi01 by simpson Sat Aug 22 17:01:41 2015<br>
>> [1]PETSC ERROR: Configure options --with-mpi-dir=/mnt/HA/opt/openmpi/intel/64/1.8.1-mlnx-ofed --with-blas-lib=/mnt/HA/opt/blas/gcc/64/20110419/libblas.a --with-lapack-lib=/liblapack.a --download-suitesparse=yes --download-superlu=yes --download-superlu_dist=yes --download-mumps=yes --download-metis=yes --download-parmetis=yes --download-scalapack=yes<br>
>> [1]PETSC ERROR: #1 User provided function() line 0 in  unknown file<br>
>> [2]PETSC ERROR: ------------------------------------------------------------------------<br>
>> [2]PETSC ERROR: Caught signal number 15 Terminate: Some process (or the batch system) has told this process to end<br>
>> [2]PETSC ERROR: Try option -start_in_debugger or -on_error_attach_debugger<br>
>> [2]PETSC ERROR: or see <a href="http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html#valgrind" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html#valgrind</a><br>
>> [2]PETSC ERROR: or try <a href="http://valgrind.org/" rel="noreferrer" target="_blank">http://valgrind.org</a> on GNU/linux and Apple Mac OS X to find memory corruption errors<br>
>> [2]PETSC ERROR: likely location of problem given in stack below<br>
>> [2]PETSC ERROR: ---------------------  Stack Frames ------------------------------------<br>
>> [2]PETSC ERROR: Note: The EXACT line numbers in the stack are not available,<br>
>> [2]PETSC ERROR:       INSTEAD the line number of the start of the function<br>
>> [2]PETSC ERROR:       is given.<br>
>> [2]PETSC ERROR: [2] SuperLU_DIST:pdgssvx line 161 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/src/mat/impls/aij/mpi/superlu_dist/superlu_dist.c<br>
>> [2]PETSC ERROR: [2] MatSolve_SuperLU_DIST line 121 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/src/mat/impls/aij/mpi/superlu_dist/superlu_dist.c<br>
>> [2]PETSC ERROR: [2] MatSolve line 3104 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/src/mat/interface/matrix.c<br>
>> [2]PETSC ERROR: [2] PCApply_LU line 194 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/src/ksp/pc/impls/factor/lu/lu.c<br>
>> [2]PETSC ERROR: [2] KSP_PCApplyBAorAB line 258 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/include/petsc-private/kspimpl.h<br>
>> [2]PETSC ERROR: --------------------- Error Message --------------------------------------------------------------<br>
>> [2]PETSC ERROR: Signal received<br>
>> [2]PETSC ERROR: See <a href="http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html</a> for trouble shooting.<br>
>> [2]PETSC ERROR: Petsc Release Version 3.5.4, May, 23, 2015<br>
>> [2]PETSC ERROR: ./blowup_batch2 on a arch-linux2-c-debug named proteusi01 by simpson Sat Aug 22 17:01:41 2015<br>
>> [2]PETSC ERROR: Configure options --with-mpi-dir=/mnt/HA/opt/openmpi/intel/64/1.8.1-mlnx-ofed --with-blas-lib=/mnt/HA/opt/blas/gcc/64/20110419/libblas.a --with-lapack-lib=/liblapack.a --download-suitesparse=yes --download-superlu=yes --download-superlu_dist=yes --download-mumps=yes --download-metis=yes --download-parmetis=yes --download-scalapack=yes<br>
>> [2]PETSC ERROR: #1 User provided function() line 0 in  unknown file<br>
>> [4]PETSC ERROR: ------------------------------------------------------------------------<br>
>> [4]PETSC ERROR: Caught signal number 15 Terminate: Some process (or the batch system) has told this process to end<br>
>> [4]PETSC ERROR: Try option -start_in_debugger or -on_error_attach_debugger<br>
>> [4]PETSC ERROR: or see <a href="http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html#valgrind" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html#valgrind</a><br>
>> [4]PETSC ERROR: or try <a href="http://valgrind.org/" rel="noreferrer" target="_blank">http://valgrind.org</a> on GNU/linux and Apple Mac OS X to find memory corruption errors<br>
>> [4]PETSC ERROR: likely location of problem given in stack below<br>
>> [4]PETSC ERROR: ---------------------  Stack Frames ------------------------------------<br>
>> [4]PETSC ERROR: Note: The EXACT line numbers in the stack are not available,<br>
>> [4]PETSC ERROR:       INSTEAD the line number of the start of the function<br>
>> [4]PETSC ERROR:       is given.<br>
>> [4]PETSC ERROR: [4] SuperLU_DIST:pdgssvx line 161 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/src/mat/impls/aij/mpi/superlu_dist/superlu_dist.c<br>
>> [4]PETSC ERROR: [4] MatSolve_SuperLU_DIST line 121 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/src/mat/impls/aij/mpi/superlu_dist/superlu_dist.c<br>
>> [4]PETSC ERROR: [4] MatSolve line 3104 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/src/mat/interface/matrix.c<br>
>> [4]PETSC ERROR: [4] PCApply_LU line 194 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/src/ksp/pc/impls/factor/lu/lu.c<br>
>> [4]PETSC ERROR: [4] KSP_PCApplyBAorAB line 258 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/include/petsc-private/kspimpl.h<br>
>> [4]PETSC ERROR: --------------------- Error Message --------------------------------------------------------------<br>
>> [4]PETSC ERROR: Signal received<br>
>> [4]PETSC ERROR: See <a href="http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html</a> for trouble shooting.<br>
>> [4]PETSC ERROR: Petsc Release Version 3.5.4, May, 23, 2015<br>
>> [4]PETSC ERROR: ./blowup_batch2 on a arch-linux2-c-debug named proteusi01 by simpson Sat Aug 22 17:01:41 2015<br>
>> [4]PETSC ERROR: Configure options --with-mpi-dir=/mnt/HA/opt/openmpi/intel/64/1.8.1-mlnx-ofed --with-blas-lib=/mnt/HA/opt/blas/gcc/64/20110419/libblas.a --with-lapack-lib=/liblapack.a --download-suitesparse=yes --download-superlu=yes --download-superlu_dist=yes --download-mumps=yes --download-metis=yes --download-parmetis=yes --download-scalapack=yes<br>
>> [4]PETSC ERROR: #1 User provided function() line 0 in  unknown file<br>
>> [5]PETSC ERROR: ------------------------------------------------------------------------<br>
>> [5]PETSC ERROR: Caught signal number 15 Terminate: Some process (or the batch system) has told this process to end<br>
>> [5]PETSC ERROR: Try option -start_in_debugger or -on_error_attach_debugger<br>
>> [5]PETSC ERROR: or see <a href="http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html#valgrind" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html#valgrind</a><br>
>> [5]PETSC ERROR: or try <a href="http://valgrind.org/" rel="noreferrer" target="_blank">http://valgrind.org</a> on GNU/linux and Apple Mac OS X to find memory corruption errors<br>
>> [5]PETSC ERROR: likely location of problem given in stack below<br>
>> [5]PETSC ERROR: ---------------------  Stack Frames ------------------------------------<br>
>> [5]PETSC ERROR: Note: The EXACT line numbers in the stack are not available,<br>
>> [5]PETSC ERROR:       INSTEAD the line number of the start of the function<br>
>> [5]PETSC ERROR:       is given.<br>
>> [5]PETSC ERROR: [5] SuperLU_DIST:pdgssvx line 161 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/src/mat/impls/aij/mpi/superlu_dist/superlu_dist.c<br>
>> [5]PETSC ERROR: [5] MatSolve_SuperLU_DIST line 121 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/src/mat/impls/aij/mpi/superlu_dist/superlu_dist.c<br>
>> [5]PETSC ERROR: [5] MatSolve line 3104 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/src/mat/interface/matrix.c<br>
>> [5]PETSC ERROR: [5] PCApply_LU line 194 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/src/ksp/pc/impls/factor/lu/lu.c<br>
>> [5]PETSC ERROR: [5] KSP_PCApplyBAorAB line 258 /home/simpson/software/petsc-3.5.4/include/petsc-private/kspimpl.h<br>
>> [5]PETSC ERROR: --------------------- Error Message --------------------------------------------------------------<br>
>> [5]PETSC ERROR: Signal received<br>
>> [5]PETSC ERROR: See <a href="http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html</a> for trouble shooting.<br>
>> [5]PETSC ERROR: Petsc Release Version 3.5.4, May, 23, 2015<br>
>> [5]PETSC ERROR: ./blowup_batch2 on a arch-linux2-c-debug named proteusi01 by simpson Sat Aug 22 17:01:41 2015<br>
>> [5]PETSC ERROR: Configure options --with-mpi-dir=/mnt/HA/opt/openmpi/intel/64/1.8.1-mlnx-ofed --with-blas-lib=/mnt/HA/opt/blas/gcc/64/20110419/libblas.a --with-lapack-lib=/liblapack.a --download-suitesparse=yes --download-superlu=yes --download-superlu_dist=yes --download-mumps=yes --download-metis=yes --download-parmetis=yes --download-scalapack=yes<br>
>> [5]PETSC ERROR: #1 User provided function() line 0 in  unknown file<br>
>><br>
>> -gideon<br>
>><br>
>><br>
><br>
<br>
</div></div></blockquote></div><br></div></div></div>
</div></blockquote></div><br></div></div></div></div></blockquote></div><br></div></div>