<div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote">On Wed, Aug 5, 2015 at 3:51 PM, Justin Chang <span dir="ltr"><<a href="mailto:jychang48@gmail.com" target="_blank">jychang48@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">no this is being built on my macbook laptop. The difference between yesterday and today is that I updated my gcc compiler (downloaded via brew) to gcc-5.0 and reinstalled openmpi accordingly</div></blockquote><div><br></div><div>Can you go to the directory and execute it manually?</div><div><br></div><div>  cd /Users/justin/Software/petsc/arch-darwin-c-opt-firedrake/externalpackages/hdf5-1.8.12 && /usr/bin/make -j 4</div><div><br></div><div>Maybe there is a problem using multiple make threads on this machine...</div><div><br></div><div>  Thanks,</div><div><br></div><div>     Matt</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div class="HOEnZb"><div class="h5"><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote">On Wed, Aug 5, 2015 at 3:49 PM, Matthew Knepley <span dir="ltr"><<a href="mailto:knepley@gmail.com" target="_blank">knepley@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote"><span>On Wed, Aug 5, 2015 at 3:43 PM, Justin Chang <span dir="ltr"><<a href="mailto:jychang48@gmail.com" target="_blank">jychang48@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hi everyone,<br><br>Not sure how related this may be, but I am also having trouble installing petsc 3.6.1 with hdf5. In fact ./configure hangs at "Running make on HDF5; this may take several minutes". I grew impatient after 30 minutes so I had to kill it.<br><br>Attached is the configure.log. Can y'all figure out what's going on here?<br></div></blockquote><div><br></div></span><div>Is this being built on a system with nonlocal disk? This can make builds take forever. The timeout on this operation is</div><div>100 minutes.</div><div><br></div><div>  Thanks,</div><div><br></div><div>    Matt</div><span><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Thanks,<br>Justin</div><div><div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Wed, Aug 5, 2015 at 3:11 PM, Barry Smith <span dir="ltr"><<a href="mailto:bsmith@mcs.anl.gov" target="_blank">bsmith@mcs.anl.gov</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div><div><br>
> On Aug 5, 2015, at 2:26 PM, Jed Brown <<a href="mailto:jed@jedbrown.org" target="_blank">jed@jedbrown.org</a>> wrote:<br>
><br>
> Barry Smith <<a href="mailto:bsmith@mcs.anl.gov" target="_blank">bsmith@mcs.anl.gov</a>> writes:<br>
>>   Our approach is always to work around bugs and stupidity in other packages design,<br>
><br>
> Do we report it to them as a bug?<br>
<br>
</div></div>  When there is a place to report them then we should and sometimes do.<br>
<span><font color="#888888"><br>
  Barry<br>
<br>
<br>
</font></span></blockquote></div><br></div>
</div></div></blockquote></span></div><br><br clear="all"><span><div><br></div>-- <br><div>What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>-- Norbert Wiener</div>
</span></div></div>
</blockquote></div><br></div>
</div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature">What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>-- Norbert Wiener</div>
</div></div>