<div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote">On Fri, May 8, 2015 at 4:14 PM, Ganesh Vijayakumar <span dir="ltr"><<a href="mailto:ganesh.iitm@gmail.com" target="_blank">ganesh.iitm@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div><div>Hello,<br><br></div>  Thanks. Looks like I could set all the possible entries I'll use to zero and selectively overwrite them. <br><br></div>  Can I overwrite any entries without incurring additional cost in memory? I currently use MatSetValue with the option INSERT_VALUES? Does Petsc have an option to OVERWRITE the existing value?<br></div></div></blockquote><div><br></div><div>Here INSERT means the same as overwrite. You only incur costs if you have not previously set the element.</div><div><br></div><div>  Thanks,</div><div><br></div><div>    Natt</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div></div>ganesh<br></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Fri, May 8, 2015 at 5:10 PM, Jed Brown <span dir="ltr"><<a href="mailto:jed@jedbrown.org" target="_blank">jed@jedbrown.org</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><span>Ganesh Vijayakumar <<a href="mailto:ganesh.iitm@gmail.com" target="_blank">ganesh.iitm@gmail.com</a>> writes:<br>
<br>
> Hello,<br>
><br>
>   I have a CFD application where some entries of the matrix change every<br>
> time step.<br>
<br>
</span>The entries change value or the set of nonzero entries changes?  If the<br>
former, just MatSetValues and carry on.  If the latter, either allocate<br>
for the union of all possible nonzeros (storing some explicit zeros) or<br>
reallocate the matrix each time.<br>
<div><div><br>
> However, the total number of non-zero elements never changes. Is there<br>
> anyway I can efficiently do this. My current attempts at doing this<br>
> results in running over the total initial memory allocation very soon.<br>
><br>
> ganesh<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br>
</font></span></div></div></blockquote></div><span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br><br clear="all"><br>-- <br><div>ganesh<br></div>
</font></span></div>
</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature">What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>-- Norbert Wiener</div>
</div></div>