<div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Mon, Sep 1, 2014 at 12:56 PM, Matthew Knepley <span dir="ltr"><<a href="mailto:knepley@gmail.com" target="_blank">knepley@gmail.com</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote"><div class="">On Mon, Sep 1, 2014 at 3:56 AM, Christophe Ortiz <span dir="ltr"><<a href="mailto:christophe.ortiz@ciemat.es" target="_blank">christophe.ortiz@ciemat.es</a>></span> wrote:<br>

<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hi all,<div><br></div><div>Thanks a lot for your answers.<br>

<div><br></div><div>I followed Satish's advice and downloaded pets-dev. Then I tried to configure it with CUDA 6.0. It complained because I did not have flex installed, no big deal. Then it complained because it prefers GNU compilers than Intel ones, no big deal.</div>


<div><br></div><div>This being fixed, I was able to configure and compile pets-dev with CUDA 6.0. There was no problem due to deprecated arch or thrust directory.</div><div><br></div><div>I configured it with the following options:</div>


<div><br></div><div><div>--with-x=1 --with-mpi=0 --with-cc=gcc --with-cxx=g++ --with-clanguage=cxx --with-fc=gfortran --with-cuda=1 --with-cuda-dir=/usr/local/cuda-6.0 --with-cuda-arch=sm_35 --with-thrust=1 --with-thrust-dir=/usr/local/cuda-6.0/include/thrust --with-cusp=1 --with-cusp-dir=/usr/local/cuda-6.0/include/cusp --with-debugging=1 --with-scalar-type=real --with-precision=double --download-fblaslapack</div>


</div><div><br></div><div><br></div><div>Now this is done, how should I port my code to use it with CUDA ? Should I change something and include some CUDA directives in the code ? Is there some examples of makefile with nvcc that I could use ?</div>

</div></div></blockquote><div><br></div></div><div>You just change the types of objects to those that use the GPU.</div><div>See here: <a href="http://www.mcs.anl.gov/petsc/features/gpus.html" target="_blank">http://www.mcs.anl.gov/petsc/features/gpus.html</a></div>

<div><br></div></div></div></div></blockquote><div><br></div><div>Thanks.</div><div><br></div><div>I will have a look at it. I also found the examples in the /src/. Will try to inspire from what is done.</div><div><br></div>
<div>Christophe</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote"><div></div><div>  Thanks,</div>
<div><br></div><div>   Matt</div><div class=""><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">

<div dir="ltr"><div><div>Thanks in advance.</div><div>Christophe</div><div><br></div><div><br></div></div></div></blockquote></div></div></div></div></blockquote></div></div></div>