<div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote">On Tue, Aug 26, 2014 at 1:33 AM, Nicola Creati <span dir="ltr"><<a href="mailto:ncreati@inogs.it" target="_blank">ncreati@inogs.it</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">Hello,<br>
I'm writing a large application in Python that uses petsc4py to solve some equations. Running my code I note that PETSc detects errors in sections (I believe in Cython extensions and packages) where petsc4py is not imported or used. I do not need to fix the problem, I already did it. Is there a way to avoid petsc4py/PETSc to catch errors in not PETSc sections of the code?<br>

This is an example of the error message I got:<br>
<br>
[0]PETSC ERROR: ------------------------------<u></u>------------------------------<u></u>------------<br>
[0]PETSC ERROR: Caught signal number 11 SEGV: Segmentation Violation, probably memory access out of range<br>
[0]PETSC ERROR: Try option -start_in_debugger or -on_error_attach_debugger<br>
[0]PETSC ERROR: or see <a href="http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html#valgrind[0]PETSC" target="_blank">http://www.mcs.anl.gov/petsc/<u></u>documentation/faq.html#<u></u>valgrind[0]PETSC</a> ERROR: or try <a href="http://valgrind.org" target="_blank">http://valgrind.org</a> on GNU/linux and Apple Mac OS X to find memory corruption errors<br>

[0]PETSC ERROR: likely location of problem given in stack below<br>
[0]PETSC ERROR: ---------------------  Stack Frames ------------------------------<u></u>------<br>
[0]PETSC ERROR: Note: The EXACT line numbers in the stack are not available,<br>
[0]PETSC ERROR:       INSTEAD the line number of the start of the function<br>
[0]PETSC ERROR:       is given.<br>
------------------------------<u></u>------------------------------<u></u>--------------<br>
mpiexec noticed that process rank 0 with PID 25694 on node daisy exited on signal 11 (Segmentation fault).<br>
------------------------------<u></u>------------------------------<u></u>--------------<br>
<br>
I'm using Python 2.7.6, petsc4py 3.4 and PETSc 3.4.3.<br></blockquote><div><br></div><div><a href="http://www.mcs.anl.gov/petsc/petsc-current/docs/manualpages/Sys/PetscPopSignalHandler.html">http://www.mcs.anl.gov/petsc/petsc-current/docs/manualpages/Sys/PetscPopSignalHandler.html</a><br>
</div><div><br></div><div>  Thanks,</div><div><br></div><div>    Matt</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">

Thanks.<span class=""><font color="#888888"><br>
<br>
Nicola<br>
<br>
-- <br>
______________________________<u></u>______________________________<u></u>_________<br>
Nicola Creati<br>
Istituto Nazionale di Oceanografia e di Geofisica Sperimentale - OGS<br>
IRI (Ricerca Teconologica e Infrastrutture) Department<br>
B.go Grotta Gigante - Brisciki 42/c<br>
34010 Sgonico - Zgonik (TS) - Italy<br>
Tel. <a href="tel:%2B39-0402140213" value="+390402140213" target="_blank">+39-0402140213</a><br>
Fax  <a href="tel:%2B39-040327307" value="+39040327307" target="_blank">+39-040327307</a><br>
<br>
</font></span></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br>What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>
-- Norbert Wiener
</div></div>