<div dir="ltr">Hi All,<div><br></div><div>Thanks for all the suggestions! I took Satish's advice, removed the source, and did a fresh built. </div><div><br></div><div>It got through the test compiling, but the tests failed as follow:</div>
<div>==================</div>Running test examples to verify correct installation<br>Using PETSC_DIR=/clusterfs/voltaire/home/software/modules/petsc/3.5.0 and PETSC_ARCH=arch-linux2-c-debug<br>Possible error running C/C++ src/snes/examples/tutorials/ex19 with 1 MPI process<br>
See <a href="http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html">http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html</a><br>lid velocity = 0.0016, prandtl # = 1, grashof # = 1<br>Number of SNES iterations = 2<br>Possible error running C/C++ src/snes/examples/tutorials/ex19 with 2 MPI processes<br>
See <a href="http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html">http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html</a><div>...<br>==================<div><br></div></div><div>I tried to go into src/snes/examples/tutorials/ex19, but didn't find any logs. Is this error for the test Okay?</div>
<div><br></div><div>Thanks,</div><div><br></div><div>Kai</div><div><br></div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Fri, Jul 25, 2014 at 11:06 AM, Satish Balay <span dir="ltr"><<a href="mailto:balay@mcs.anl.gov" target="_blank">balay@mcs.anl.gov</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Its probably best to do a fresh build with the latest petsc-3.5.1 tarball and see<br>
if the problem is reproduceable [with --with-shared-libraries=0]<br>
<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br>
Satish<br>
</font></span><div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
On Fri, 25 Jul 2014, Jed Brown wrote:<br>
<br>
> Matthew Knepley <<a href="mailto:knepley@gmail.com">knepley@gmail.com</a>> writes:<br>
><br>
> > On Thu, Jul 24, 2014 at 5:33 PM, Kai Song <<a href="mailto:ksong@lbl.gov">ksong@lbl.gov</a>> wrote:<br>
> ><br>
> >> Hi Satish,<br>
> >><br>
> >> Thanks for the quick response. I attached the make.log in this email, and<br>
> >> a quick glance, I didn't see any obvious errors.<br>
> >><br>
> ><br>
> > This never built the MUMPS directory, even though you have PETSC_HAVE_MUMPS<br>
> > defined. I can see two<br>
> > possible reasons for this:<br>
> ><br>
> >   1) You distribution as missing files<br>
> ><br>
> >   2) You have two copies of PETSc fighting each other here (old PETSC_DIR?)<br>
> ><br>
> > Can you make sure you have the file mumps.c in<br>
> ><br>
> >   src/mat/impls/aij/mpi/mumps<br>
> ><br>
> > Jed, how do we check what make is doing here?<br>
><br>
> mumps.c should be listed in $PETSC_ARCH/conf/files after the code<br>
> generator runs.  Possibly a file system problem or tinkering caused it<br>
> to appear up-to-date after reconfiguring?  (Just speculating because we<br>
> haven't seen this problem before.)<br>
><br>
<br>
</div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br>Kai Song<br><<a href="mailto:ksong@lbl.gov" target="_blank">ksong@lbl.gov</a>> 1.510.495.2180<br>1 Cyclotron Rd. Berkeley, CA94720, MS-50B 3209<br>
High Performance Computing Services (HPCS) <br>Lawrence Berkeley National Laboratory - <a href="http://scs.lbl.gov" target="_blank">http://scs.lbl.gov</a>
</div>