<div dir="ltr">Hi Petsc community,<div><br></div><div>I just installed petsc/3.5.0 on our RHEL-6 system, with gcc/4.4.7 and openmpi/1.6.5</div><div><br></div>The program built and installed fine, but make test failed on the following error:<br>
================<div>...<br>mpicc -Wall -Wwrite-strings -Wno-strict-aliasing -Wno-unknown-pragmas -g3 -O0  -o ex19  ex19.o -L/clusterfs/voltaire/home/software/modules/petsc/3.5.0/lib  -lpetsc -Wl,-rpath,/clusterfs/voltaire/home/software/modules/petsc/3.5.0/lib -lcmumps -ldmumps -lsmumps -lzmumps -lmumps_common -lpord -lscalapack -lflapack -lfblas -lparmetis -lmetis -lX11 -lssl -lcrypto -lpthread -L/global/software/sl-6.x86_64/modules/gcc/4.4.7/openmpi/1.6.5-gcc/lib -L/usr/lib/gcc/x86_64-redhat-linux/4.4.7 -lmpi_f90 -lmpi_f77 -lgfortran -lm -lmpi_cxx -lstdc++ -lmpi_cxx -lstdc++ -ldl -lmpi -lnuma -lrt -lnsl -lutil -lgcc_s -lpthread -ldl <br>
/clusterfs/voltaire/home/software/modules/petsc/3.5.0/lib/libpetsc.so: undefined reference to `MatGetFactor_aij_mumps'<br>/clusterfs/voltaire/home/software/modules/petsc/3.5.0/lib/libpetsc.so: undefined reference to `MatGetFactor_baij_mumps'<br>
/clusterfs/voltaire/home/software/modules/petsc/3.5.0/lib/libpetsc.so: undefined reference to `MatPartitioningCreate_Parmetis'<br>/clusterfs/voltaire/home/software/modules/petsc/3.5.0/lib/libpetsc.so: undefined reference to `MatGetFactor_sbaij_mumps'<br>
collect2: ld returned 1 exit status<br>gmake[3]: [ex19] Error 1 (ignored)</div><div>...<br><div>================</div><div><br></div><div>I used the following configure line:</div>./configure --prefix=/software/modules/petsc/3.5.0  --download-fblaslapack=1 --download-mumps=1 --download-parmetis=1 --download-scalapack --download-metis=1 --with-mpi-dir=/global/software/sl-6.x86_64/modules/gcc/4.4.7/openmpi/1.6.5-gcc/<div>
<br></div><div>Is there anything that I am missing in the built process? Any help would be great appreciated!</div><div><br></div><div>Thanks in advance!</div><div><br></div><div>Kai</div><div><br></div><div>-- <br>Kai Song<br>
<<a href="mailto:ksong@lbl.gov" target="_blank">ksong@lbl.gov</a>> 1.510.495.2180<br>1 Cyclotron Rd. Berkeley, CA94720, MS-50B 3209<br>High Performance Computing Services (HPCS) <br>Lawrence Berkeley National Laboratory - <a href="http://scs.lbl.gov" target="_blank">http://scs.lbl.gov</a>
</div></div></div>