<html dir="ltr">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style type="text/css" id="owaParaStyle"></style>
</head>
<body fpstyle="1" ocsi="0">
<div style="direction: ltr;font-family: Tahoma;color: #000000;font-size: 10pt;">No I don't think I'm using fieldsplitting although I want to use it. The output of 
<div><span style="font-family: Menlo; font-size: 11px;"><br>
</span></div>
<div><span style="font-family: Menlo; font-size: 11px;">./ex70 -nx 32 -ny 48 -fieldsplit_1_pc_type jacobi -ksp_view</span></div>
<div><br>
</div>
<div>is the following: <span style="font-family: 'Segoe UI', Helvetica, Arial, sans-serif; font-size: medium;"> </span>
<div><br>
</div>
<div>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;">
KSP Object: 1 MPI processes</p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;">
  type: gmres</p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;">
    GMRES: restart=30, using Classical (unmodified) Gram-Schmidt Orthogonalization with no iterative refinement</p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;">
    GMRES: happy breakdown tolerance 1e-30</p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;">
  maximum iterations=10000, initial guess is zero</p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;">
  tolerances:  relative=1e-05, absolute=1e-50, divergence=10000</p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;">
  left preconditioning</p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;">
  using PRECONDITIONED norm type for convergence test</p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;">
PC Object: 1 MPI processes</p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;">
  type: none</p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;">
  linear system matrix = precond matrix:</p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;">
  Matrix Object:   1 MPI processes</p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;">
    type: nest</p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;">
    rows=4608, cols=4608</p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;">
      Matrix object: </p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;">
        type=nest, rows=2, cols=2 </p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;">
        MatNest structure: </p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;">
        (0,0) : prefix="a00_", type=mpiaij, rows=3072, cols=3072 </p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;">
        (0,1) : prefix="a01_", type=mpiaij, rows=3072, cols=1536 </p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;">
        (1,0) : prefix="a10_", type=mpiaij, rows=1536, cols=3072 </p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;">
        (1,1) : prefix="a11_", type=mpiaij, rows=1536, cols=1536 </p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;">
 residual u = 2.6315e-05</p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;">
 residual p = 0.000229872</p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;">
 residual [u,p] = 0.000231373</p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;">
 discretization error u = 0.00633503</p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;">
 discretization error p = 0.121534</p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;">
 discretization error [u,p] = 0.121699</p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;">
WARNING! There are options you set that were not used!</p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;">
WARNING! could be spelling mistake, etc!</p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;">
</p>
<p style="margin-right: 0px; margin-left: 0px; font-size: 11px; font-family: Menlo;">
Option left: name:-fieldsplit_1_pc_type value: jacobi</p>
<div><br>
</div>
<div><br>
<div style="font-family: Times New Roman; color: #000000; font-size: 16px">
<hr tabindex="-1">
<div id="divRpF530243" style="direction: ltr;"><font face="Tahoma" size="2" color="#000000"><b>From:</b> Sun, Hui<br>
<b>Sent:</b> Wednesday, July 16, 2014 2:40 PM<br>
<b>To:</b> Matthew Knepley<br>
<b>Cc:</b> petsc-users@mcs.anl.gov<br>
<b>Subject:</b> RE: [petsc-users] why a certain option cannot be used<br>
</font><br>
</div>
<div></div>
<div>
<div style="direction:ltr; font-family:Tahoma; color:#000000; font-size:10pt">Thank you Matt. I've corrected it to 
<div><br>
</div>
<div>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo">./ex70 -nx 32 -ny 48 -fieldsplit_1_pc_type jacobi</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"><br>
</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px">However the output is still:</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px"><br>
</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo">residual u = 2.6315e-05</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"> residual p = 0.000229872</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"> residual [u,p] = 0.000231373</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"> discretization error u = 0.00633503</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"> discretization error p = 0.121534</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"> discretization error [u,p] = 0.121699</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo">WARNING! There are options you set that were not used!</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo">WARNING! could be spelling mistake, etc!</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px"></p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo">Option left: name:-fieldsplit_1_pc_type value: jacobi</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"><br>
</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"><span style="font-family:Tahoma; font-size:13px">If I type</span></p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"><span style="font-family:Tahoma; font-size:13px"><br>
</span></p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo">./ex70 -help | grep fieldsplit_1_</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"><span style="font-family:Tahoma; font-size:13px"><br>
</span></p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"><span style="font-family:Tahoma; font-size:13px">the output is that nothing coming out. </span></p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"><span style="font-family:Tahoma; font-size:13px"><br>
</span></p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"><span style="font-family:Tahoma; font-size:13px"><br>
</span></p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"><br>
</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"><br>
</p>
<div style="font-family:Times New Roman; color:#000000; font-size:16px">
<hr tabindex="-1">
<div id="divRpF516901" style="direction:ltr"><font face="Tahoma" size="2" color="#000000"><b>From:</b> Matthew Knepley [knepley@gmail.com]<br>
<b>Sent:</b> Wednesday, July 16, 2014 2:32 PM<br>
<b>To:</b> Sun, Hui<br>
<b>Cc:</b> petsc-users@mcs.anl.gov<br>
<b>Subject:</b> Re: [petsc-users] why a certain option cannot be used<br>
</font><br>
</div>
<div></div>
<div>
<div dir="ltr">
<div class="gmail_extra">
<div class="gmail_quote">On Wed, Jul 16, 2014 at 4:25 PM, Matthew Knepley <span dir="ltr">
<<a href="mailto:knepley@gmail.com" target="_blank">knepley@gmail.com</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex; border-left:1px #ccc solid; padding-left:1ex">
<div dir="ltr">
<div class="gmail_extra">
<div class="gmail_quote">
<div class="">On Wed, Jul 16, 2014 at 4:22 PM, Sun, Hui <span dir="ltr"><<a href="mailto:hus003@ucsd.edu" target="_blank">hus003@ucsd.edu</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex; border-left:1px #ccc solid; padding-left:1ex">
<div>
<div style="direction:ltr; font-family:Tahoma; color:#000000; font-size:10pt">Thank you Matt for answering, however even with that I don't think it works. For example, the command 
<div><br>
</div>
<div>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo">./ex70 -nx 32 -ny 48 -fieldsplit_1_type jacobi</p>
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
<div><br>
</div>
</div>
<div>You have mistyped. Look carefully at my last message:</div>
<div><br>
</div>
<div>  -fieldsplit_1_pc_type jacobi</div>
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
<div><br>
</div>
<div>I also want to note that you can see all the available options with -help. It does produce</div>
<div>a lot of output, but you can segregate it by prefix ("fieldsplit_1_"). You can also see the</div>
<div>prefix of each solver component using -ksp_view.</div>
<div><br>
</div>
<div>  Matt</div>
<div> </div>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex; border-left:1px #ccc solid; padding-left:1ex">
<div dir="ltr">
<div class="gmail_extra">
<div class="gmail_quote">
<div>     Matt</div>
<div>
<div class="h5">
<div> </div>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex; border-left:1px #ccc solid; padding-left:1ex">
<div>
<div style="direction:ltr; font-family:Tahoma; color:#000000; font-size:10pt">
<div>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"><span style="font-family:Tahoma; font-size:13px">gives me the following output</span></p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"><span style="font-family:Tahoma; font-size:13px"><br>
</span></p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo">residual u = 2.6315e-05</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"> residual p = 0.000229872</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"> residual [u,p] = 0.000231373</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"> discretization error u = 0.00633503</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"> discretization error p = 0.121534</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"> discretization error [u,p] = 0.121699</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo">WARNING! There are options you set that were not used!</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo">WARNING! could be spelling mistake, etc!</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"></p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo">Option left: name:-fieldsplit_1_type value: jacobi</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"><br>
</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px">Furthermore, if I look into the possible options with keyword fieldsplit involved by the command:</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"><br>
</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo">./ex70 -help | grep -A5 fieldsplit</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"><span style="font-family:Tahoma; font-size:13px"><br>
</span></p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"><span style="font-family:Tahoma; font-size:13px">I get this output:</span></p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"><span style="font-family:Tahoma; font-size:13px"><br>
</span></p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo">eisenstat ilu icc cholesky asm gasm ksp composite redundant nn mat fieldsplit galerkin exotic hmpi asa cp lsc redistribute svd gamg tfs (PCSetType)</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo">  -pc_use_amat: <FALSE> use Amat (instead of Pmat) to define preconditioner in nested inner solves (PCSetUseAmat)</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo">Krylov Method (KSP) options -------------------------------------------------</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo">  -ksp_type <gmres>: Krylov method (one of) cg groppcg pipecg cgne nash stcg gltr richardson</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo">      chebyshev gmres tcqmr bcgs ibcgs fbcgs fbcgsr bcgsl cgs tfqmr cr pipecr lsqr preonly qcg bicg fgmres minres symmlq lgmres lcd gcr pgmres specest dgmres (KSPSetType)</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"></p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo">  -ksp_max_it <10000>: Maximum number of iterations (KSPSetTolerances)</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"><br>
</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"><span style="font-family:Tahoma; font-size:13px">So I don't see any option that's similar to -fieldsplit_1_type. </span></p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"><span style="font-family:Tahoma; font-size:13px"><br>
</span></p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"><span style="font-family:Tahoma; font-size:13px">Hui</span></p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"><span style="font-family:Tahoma; font-size:13px"><br>
</span></p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"><br>
</p>
<div style="font-family:Times New Roman; color:#000000; font-size:16px">
<hr>
<div style="direction:ltr"><font face="Tahoma" color="#000000"><b>From:</b> Matthew Knepley [<a href="mailto:knepley@gmail.com" target="_blank">knepley@gmail.com</a>]<br>
<b>Sent:</b> Wednesday, July 16, 2014 2:16 PM<br>
<b>To:</b> Sun, Hui<br>
<b>Cc:</b> <a href="mailto:petsc-users@mcs.anl.gov" target="_blank">petsc-users@mcs.anl.gov</a><br>
<b>Subject:</b> Re: [petsc-users] why a certain option cannot be used<br>
</font><br>
</div>
<div></div>
<div>
<div dir="ltr">
<div class="gmail_extra">
<div class="gmail_quote">On Wed, Jul 16, 2014 at 4:09 PM, Sun, Hui <span dir="ltr">
<<a href="mailto:hus003@ucsd.edu" target="_blank">hus003@ucsd.edu</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex; border-left:1px #ccc solid; padding-left:1ex">
<div>
<div style="direction:ltr; font-family:Tahoma; color:#000000; font-size:10pt">I want to solve Stokes equation using user defined schur complement preconditioner. So I'm reading and testing snes/examples/tutorial/ex55.c, and ex70.c. In these examples, there
 are comments about the usage, for example: 
<div><span style="color:rgb(215,57,30); font-family:Menlo; font-size:11px"><br>
</span></div>
<div><span style="color:rgb(215,57,30); font-family:Menlo; font-size:11px">mpiexec -n 2 ./stokes -nx 32 -ny 48 -fieldsplit_1_user_pc. </span>
<div><span style="font-size:10pt"><br>
</span></div>
<div><span style="font-size:10pt">However the option </span><span style="color:rgb(215,57,30); font-family:Menlo; font-size:11px">-fieldsplit_1_user_pc</span><span style="font-size:10pt"> is not recognized by the executable. The output of the above command
 is:</span></div>
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
<div><br>
</div>
<div>This ("user_pc") is just a mnemonic. What it means is that you can use any PC in this slot. What he should have written is</div>
<div><br>
</div>
<div>  -fieldsplit_1_pc_type <user pc></div>
<div><br>
</div>
<div>  Thanks,</div>
<div><br>
</div>
<div>     Matt</div>
<div> </div>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex; border-left:1px #ccc solid; padding-left:1ex">
<div>
<div style="direction:ltr; font-family:Tahoma; color:#000000; font-size:10pt">
<div>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"> residual u = 2.6315e-05</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"> residual p = 0.000229872</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"> residual [u,p] = 0.000231373</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"> discretization error u = 0.00633503</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"> discretization error p = 0.121534</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"> discretization error [u,p] = 0.121699</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo">WARNING! There are options you set that were not used!</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo">WARNING! could be spelling mistake, etc!</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo">Option left: name:-fieldsplit_1_user_pc (no value)</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px; font-size:11px; font-family:Menlo"><br>
</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px">I'm wondering what's going on. Is that because I need some specific options during my configuring of the package? By the way, the version of PETSc I'm using is 3.4.4. </p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px"><br>
</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px">Best,</p>
<p style="margin-right:0px; margin-left:0px">Hui</p>
<span><font color="#888888"></font></span></div>
<span><font color="#888888"></font></span></div>
<span><font color="#888888"></font></span></div>
<span><font color="#888888"></font></span></blockquote>
<span><font color="#888888"></font></span></div>
<span><font color="#888888"><br>
<br clear="all">
<div><br>
</div>
-- <br>
What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>
-- Norbert Wiener </font></span></div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
</div>
</div>
</div>
<div>
<div class="h5"><br>
<br clear="all">
<div><br>
</div>
-- <br>
What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>
-- Norbert Wiener </div>
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
</div>
<br>
<br clear="all">
<div><br>
</div>
-- <br>
What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>
-- Norbert Wiener </div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>