<div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote">On Tue, Apr 8, 2014 at 3:18 PM, Xiangdong <span dir="ltr"><<a href="mailto:epscodes@gmail.com" target="_blank">epscodes@gmail.com</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hello everyone,<div><br></div><div>I have a question about the usage of SNESGetJacobian().</div><div><br>
</div><div>When I added the following three lines to the snes Monitor function in ex3 for viewing the Jacobian matrix:</div>
<div><br></div><div>Mat Jmat;</div><div>ierr = SNESGetJacobian(snes,&Jmat,NULL,NULL,NULL); CHKERRQ(ierr);</div><div>ierr = MatView(Jamt, PETSC_VIEWER_STDOUT_WORLD); CHKERRQ(ierr); </div><div><br></div><div> I got error message complaining:<br>

</div><div>Operation done in wrong order!</div><div>Must call MatAssemblyBegin/End() before viewing matrix!</div><div> MatView() line 812 in matrix.c<br></div><div><br></div><div><br></div><div>Is the Jmat returned by SNESGetJacobian supposed to be assembled? </div>
</div></blockquote><div><br></div><div>We do not control assembly. You have put values in the Jacobian without assembling.</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div dir="ltr"><div>Even if I add MatAssemblyBegin/End(), it still crashes by reporting argument out of range in MatSetValues_SeqAIJ() or MatSetValues_MPIAIJ().</div></div></blockquote><div><br></div><div>Always always always send the full error log.</div>
<div><br></div><div>   Matt</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div>Any suggestions?</div><div><br></div>
<div>Thank you.</div><span class="HOEnZb"><font color="#888888"><div><br></div><div>Xiangdong</div><div><br></div><div><br></div></font></span></div>
</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br>What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>
-- Norbert Wiener
</div></div>