<p dir="ltr"><br>
On Feb 18, 2014 10:12 AM, "Jed Brown" <<a href="mailto:jed@jedbrown.org">jed@jedbrown.org</a>> wrote:<br>
><br>
> Qin Lu <<a href="mailto:lu_qin_2000@yahoo.com">lu_qin_2000@yahoo.com</a>> writes:<br>
><br>
> > RCM did not help much for my case. This case represents some strong<br>
> > connectivities in channels. I am wondering if PETSc has some<br>
> > reordering algorithm or solver that is not based on connectivity<br>
> > graph, but is based on connectivity strength (such as percolation type<br>
> > of reordering). Any information is appreciated.    Thanks, Qin<br>
><br>
> There isn't such an ordering, but it would be a welcome contribution.</p>
<p dir="ltr">Not exactly. You can try 'wbm' in next.</p>
<p dir="ltr">   Matt</p>
<p dir="ltr">> One challenge is that features like anisotropy are not necessarily<br>
> apparent in the matrix entries.  In that case, and for vector-valued<br>
> problems, you would ideally use a better strength-of-connection measure.<br>
> If you computed a strength-of-connection, then thresholded (or used edge<br>
> weights as a "priority"), followed by something like an RCM ordering,<br>
> you could find something good for low-fill incomplete factorization in<br>
> problems with hidden anisotropy.<br>
</p>