<div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote">On Wed, Jan 22, 2014 at 5:37 PM, David Liu <span dir="ltr"><<a href="mailto:daveliu@mit.edu" target="_blank">daveliu@mit.edu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div dir="ltr">Hi, I'm running a very simple code, consisting of just PetscFinalize and PetscInitialize and nothing else.<div><br></div><div>I'm running it with valgrind using the command</div><div>"valgrind ./run"</div>

<div><br>I also tried (as the petsc homepage suggests)</div><div>${PETSC_DIR}/bin/petscmpiexec -valgrind -n 1 ./run -malloc off</div><div><br></div><div>For both cases, I get tons of error messages like</div><div>"Conditional jump or move depends on uninitialised value(s)"</div>

<div>"Use of uninitialised value of size 8"</div><div>"Invalid read of size 8"</div><div>"Address 0xc15a998 is 40 bytes inside a block of size 47 alloc'd"</div><div><br></div><div>with a final valgrind summary that includes things like</div>

<div><div>==29401==    definitely lost: 5,956 bytes in 55 blocks</div><div>==29401==    indirectly lost: 3,722 bytes in 22 blocks</div><div>==29401== ERROR SUMMARY: 619 errors from 8 contexts (suppressed: 4 from 4)</div>
</div>
<div><br></div><div>Is this normal or is there something wrong with my petsc/valgrind installation? For the record, valgrind was already there when I compiled petsc.</div>































</div>
</blockquote></div><br>You could include the log so we could verify, but this is common due to MPI which is rarely valgrind clean.</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">   Matt<br clear="all"><div>
<br></div>-- <br>What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>-- Norbert Wiener
</div></div>