<div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote">On Thu, Jan 16, 2014 at 3:55 PM, Jones,Martin Alexander <span dir="ltr"><<a href="mailto:MAJones2@mdanderson.org" target="_blank">MAJones2@mdanderson.org</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">




<div>
<div style="direction:ltr;font-size:10pt;font-family:Tahoma">Thanks!<br></div></div></blockquote><div><br></div><div>You built with PETSC_ARCH=arch-linux2-cxx-debug</div><div><br></div><div>   Matt</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">
<div><div style="direction:ltr;font-size:10pt;font-family:Tahoma">
<div style="font-size:16px;font-family:'Times New Roman'">
<hr>
<div style="direction:ltr"><font color="#000000" face="Tahoma"><b>From:</b> Matthew Knepley [<a href="mailto:knepley@gmail.com" target="_blank">knepley@gmail.com</a>]<br>
<b>Sent:</b> Thursday, January 16, 2014 3:31 PM<br>
<b>To:</b> Jones,Martin Alexander<br>
<b>Cc:</b> <a href="mailto:petsc-users@mcs.anl.gov" target="_blank">petsc-users@mcs.anl.gov</a><br>
<b>Subject:</b> Re: [petsc-users] Problems running ex12.c<br>
</font><br>
</div>
<div></div>
<div>
<div dir="ltr">
<div class="gmail_extra">
<div class="gmail_quote">On Thu, Jan 16, 2014 at 3:11 PM, Jones,Martin Alexander <span dir="ltr">
<<a href="mailto:MAJones2@mdanderson.org" target="_blank">MAJones2@mdanderson.org</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">
<div lang="EN-US">
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:rgb(31,73,125)">Now I went to the directory where ex12.c sits and just did a ‘make ex12.c’ with the following error if this helps?  :<u></u><u></u></span></p>

<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:rgb(31,73,125)"><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:rgb(31,73,125)">mjonesa@maeda:~/PETSc/petsc-3.4.3/src/snes/examples/tutorials$ make ex12.c<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:rgb(31,73,125)">/home/mjonesa/PETSc/petsc-3.4.3/conf/variables:108: /home/mjonesa/PETSc/petsc-3.4.3/linux-gnu-cxx-debug/conf/petscvariables: No such file or directory<u></u><u></u></span></p>

<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:rgb(31,73,125)">/home/mjonesa/PETSc/petsc-3.4.3/conf/rules:962: /home/mjonesa/PETSc/petsc-3.4.3/linux-gnu-cxx-debug/conf/petscrules: No such file or directory<u></u><u></u></span></p>

<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:rgb(31,73,125)">make: *** No rule to make target `/home/mjonesa/PETSc/petsc-3.4.3/linux-gnu-cxx-debug/conf/petscrules'.  Stop.</span></p>

</div>
</div>
</blockquote>
<div><br>
</div>
<div>1) You would type 'make ex12'</div>
<div><br>
</div>
<div>2) Either you PETSC_DIR (<span style="color:rgb(31,73,125);font-family:Calibri,sans-serif;font-size:14.44444465637207px">/home/mjonesa/PETSc/petsc-3.</span><span style="color:rgb(31,73,125);font-family:Calibri,sans-serif;font-size:14.44444465637207px">4.3</span>)
 or PETSC_ARCH (<span style="color:rgb(31,73,125);font-family:Calibri,sans-serif;font-size:14.44444465637207px">linux-gnu-cxx-debug</span>) environment variables</div>
<div>    do not match what you built. Please send configure.log and make.log</div>
<div><br>
</div>
<div>3) Since it was only recently added, if you want to use the FEM functionality, you must use the development version:</div>
<div><br>
</div>
<div>   <a href="http://www.mcs.anl.gov/petsc/developers/index.html" target="_blank">http://www.mcs.anl.gov/petsc/developers/index.html</a></div>
<div><br>
</div>
<div>  Thanks,</div>
<div><br>
</div>
<div>      Matt</div>
<div> </div>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">
<div lang="EN-US">
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="color:rgb(31,73,125);font-family:Calibri,sans-serif;font-size:11pt"> </span></p>
<div>
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:10pt;font-family:Tahoma,sans-serif">From:</span></b><span style="font-size:10pt;font-family:Tahoma,sans-serif"> Matthew Knepley [mailto:<a href="mailto:knepley@gmail.com" target="_blank">knepley@gmail.com</a>]
<br>
<b>Sent:</b> Thursday, January 16, 2014 2:48 PM<br>
<b>To:</b> Jones,Martin Alexander<br>
<b>Cc:</b> <a href="mailto:petsc-users@mcs.anl.gov" target="_blank">petsc-users@mcs.anl.gov</a><br>
<b>Subject:</b> Re: [petsc-users] Problems running ex12.c<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<div>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal">On Thu, Jan 16, 2014 at 2:35 PM, Jones,Martin Alexander <<a href="mailto:MAJones2@mdanderson.org" target="_blank">MAJones2@mdanderson.org</a>> wrote:<u></u><u></u></p>
<div>
<div>
<p class="MsoNormal">Hello To Whom it Concerns,<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"> <u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">I am trying to run the tutorial ex12.c by running <span style="color:rgb(178,34,34)">
'bin/pythonscripts/PetscGenerateFEMQuadrature.py dim order dim 1 laplacian dim order dim 1 boundary src/snes/examples/tutorials/ex12.h'</span><br>
but getting the following error:<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"> <u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">$ bin/pythonscripts/PetscGenerateFEMQuadrature.py dim order dim 1 laplacian dim order dim 1 boundary src/snes/examples/tutorials/ex12.h<br>
Traceback (most recent call last):<br>
  File "bin/pythonscripts/PetscGenerateFEMQuadrature.py", line 15, in <module><br>
    from FIAT.reference_element import default_simplex<br>
ImportError: No module named FIAT.reference_element<u></u><u></u></p>
</div>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal"><br>
I have removed the requirement of generating the header file (its now all handled in C). I thought<u></u><u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">I changed the documentation everywhere (including the latest tutorial slides). Can you try running<u></u><u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">with 'master' (or 'next'), and point me toward the old docs?<u></u><u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">  Thanks,<u></u><u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal">    Matt<br clear="all">
<u></u><u></u></p>
<div>
<p class="MsoNormal"><u></u> <span class=""><font color="#888888"><u></u></font></span></p><span class=""><font color="#888888">
</font></span></div><span class=""><font color="#888888">
<p class="MsoNormal">-- <br>
What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>
-- Norbert Wiener <u></u><u></u></p>
</font></span></div><span class=""><font color="#888888">
</font></span></div><span class=""><font color="#888888">
</font></span></div><span class=""><font color="#888888">
</font></span></div><span class=""><font color="#888888">
</font></span></div><span class=""><font color="#888888">
</font></span></blockquote><span class=""><font color="#888888">
</font></span></div><span class=""><font color="#888888">
<br>
<br clear="all">
<div><br>
</div>
-- <br>
What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>
-- Norbert Wiener </font></span></div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>

</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br>What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>
-- Norbert Wiener
</div></div>