<div dir="ltr">On Thu, Aug 8, 2013 at 1:29 PM, Roc Wang <span dir="ltr"><<a href="mailto:pengxwang@hotmail.com" target="_blank">pengxwang@hotmail.com</a>></span> wrote:<br><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote">
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">


<div><div dir="ltr">Hi,<br><br>    I am working on multi-level grid for Poisson equation.  I need to refine some sub-region in the computational domain. To this, I plan to build  some boxes (patches) based on the coarsest level. I am using DM to manage the data. I found there is a new function DMPatachCreate() in the version 3.4.  Is this function the right one I should use for the refined region?  If it is not, which ones I should use?<br>
</div></div></blockquote><div><br></div><div>That is an experiment and does not work.</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">
<div><div dir="ltr">    My proposed approach is to start with  code dm/impls/patch/examples/tests/ex1.c. And then follow the code /dm/examples/tutorials/ex65dm.c. Is this approach the right way to my goal?<br><br>    In addition, I need to use not only the nodes but also the cells including nodes.  Should I use DMMesh to create the cells? I noticed DMMesh is mainly for unstructured grid, but I didn't find other class that implements structured cells.  Can anybody give me some suggestions on multi-level grid or let me know which examples I should start with? Thanks.<br>
                                          </div></div>
</blockquote></div><br>No, that is not appropriate.</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">It sounds like you want structured AMR. PETSc does not do this, and there are packages that do it.:</div>
<div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">a) Chombo</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">b) SAMRAI</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">which are both patch-based AMR. If you want octree-style AMR you could use p4est, but it would mean</div>
<div class="gmail_extra">a lot of coding along the lines of <a href="http://arxiv.org/abs/1308.1472">http://arxiv.org/abs/1308.1472</a>, or Deal.II which is a complete package.</div><div class="gmail_extra">I think Deal is the closest to using PETSc solvers.</div>
<div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">  Thanks,</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">     Matt<br clear="all"><div><br></div>-- <br>What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>
-- Norbert Wiener
</div></div>