<div dir="ltr"><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr"><div><div><div><div>I ran into following errors while trying to build PETSc-dev on Intrepid @ALCF.  (configure.log attached)<br><br>*******************************************************************************<br>

         UNABLE to CONFIGURE with GIVEN OPTIONS    (see configure.log for details):<br>-------------------------------------------------------------------------------<br>Cannot run executable to determine size of char. If this machine uses a batch system <br>

to submit jobs you will need to configure using ./configure with the additional option  --with-batch.<br> Otherwise there is problem with the compilers. Can you compile and run code with your C/C++ (and maybe Fortran) compilers?<br>

*******************************************************************************<br>  File "/gpfs/home/jkumar/lib/petsc/config/configure.py", line 293, in petsc_configure<br>    framework.configure(out = sys.stdout)<br>

  File "/gpfs/home/jkumar/lib/petsc/config/BuildSystem/config/framework.py", line 933, in configure<br>    child.configure()<br>  File "/gpfs/home/jkumar/lib/petsc/config/BuildSystem/config/types.py", line 386, in configure<br>

    map(lambda type: self.executeTest(self.checkSizeof, type), ['char','void *', 'short', 'int', 'long', 'long long', 'float', 'double', 'size_t'])<br>

  File "/gpfs/home/jkumar/lib/petsc/config/BuildSystem/config/types.py", line 386, in <lambda><br>    map(lambda type: self.executeTest(self.checkSizeof, type), ['char','void *', 'short', 'int', 'long', 'long long', 'float', 'double', 'size_t'])<br>

  File "/gpfs/home/jkumar/lib/petsc/config/BuildSystem/config/base.py", line 115, in executeTest<br>    ret = apply(test, args,kargs)<br>  File "/gpfs/home/jkumar/lib/petsc/config/BuildSystem/config/types.py", line 296, in checkSizeof<br>

    raise RuntimeError(msg)<br><br></div>This is what my configuration looks like (adapted from config/examples/arch-bgp-ibm-opt.py)<br>configure_options = [<br>  '--with-cc=mpixlc',<br>  '--with-fc=mpixlf90',<br>

  '--with-cxx=mpixlcxx',<br>  'COPTFLAGS=-O3',<br>  'FOPTFLAGS=-O3',<br>  '--with-debugging=0',<br>  '--with-cmake=/soft/apps/fen/cmake-2.8.3/bin/cmake',<br>#  '--with-hdf5=/soft/apps/hdf5-1.8.0',<br>

  '--download-parmetis=1',<br>  '--download-metis=1',<br>  '--download-plapack=1',<br>  '--download-hdf5=1'<br>  ]<br><br></div>I would appreciate any help building the llbrary there. <br>
<br>
</div>Thanks,<br></div>Jitu<br></div>
</div><br></div>