<div dir="ltr"><div><div>Thanks Satish. I tried using the configuration you pointed me to with the addition of --download-hdf5=1 and got error "Compression library [libz.a or equivalent] not found<br>" <br><br></div>
Do I need to load some package to get this?<br><br></div>Jitu<br></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Tue, Jul 16, 2013 at 11:59 AM, Satish Balay <span dir="ltr"><<a href="mailto:balay@mcs.anl.gov" target="_blank">balay@mcs.anl.gov</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">As the message indicates you need '--with-batch' option on this machine<br>
<br>
Check one of the default builds on intrepid for configure options to use..<br>
<br>
[perhaps /soft/apps/libraries/petsc/3.3-p6/xl-opt/conf/reconfigure-arch-bgp-ibm-opt.py]<br>
<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br>
Satish<br>
</font></span><div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
On Tue, 16 Jul 2013, Jitendra Kumar wrote:<br>
<br>
> I ran into following errors while trying to build PETSc-dev on Intrepid<br>
> @ALCF.  (configure.log attached)<br>
><br>
> *******************************************************************************<br>
>          UNABLE to CONFIGURE with GIVEN OPTIONS    (see configure.log for<br>
> details):<br>
> -------------------------------------------------------------------------------<br>
> Cannot run executable to determine size of char. If this machine uses a<br>
> batch system<br>
> to submit jobs you will need to configure using ./configure with the<br>
> additional option  --with-batch.<br>
>  Otherwise there is problem with the compilers. Can you compile and run<br>
> code with your C/C++ (and maybe Fortran) compilers?<br>
> *******************************************************************************<br>
>   File "/gpfs/home/jkumar/lib/petsc/config/configure.py", line 293, in<br>
> petsc_configure<br>
>     framework.configure(out = sys.stdout)<br>
>   File<br>
> "/gpfs/home/jkumar/lib/petsc/config/BuildSystem/config/framework.py", line<br>
> 933, in configure<br>
>     child.configure()<br>
>   File "/gpfs/home/jkumar/lib/petsc/config/BuildSystem/config/types.py",<br>
> line 386, in configure<br>
>     map(lambda type: self.executeTest(self.checkSizeof, type),<br>
> ['char','void *', 'short', 'int', 'long', 'long long', 'float', 'double',<br>
> 'size_t'])<br>
>   File "/gpfs/home/jkumar/lib/petsc/config/BuildSystem/config/types.py",<br>
> line 386, in <lambda><br>
>     map(lambda type: self.executeTest(self.checkSizeof, type),<br>
> ['char','void *', 'short', 'int', 'long', 'long long', 'float', 'double',<br>
> 'size_t'])<br>
>   File "/gpfs/home/jkumar/lib/petsc/config/BuildSystem/config/base.py",<br>
> line 115, in executeTest<br>
>     ret = apply(test, args,kargs)<br>
>   File "/gpfs/home/jkumar/lib/petsc/config/BuildSystem/config/types.py",<br>
> line 296, in checkSizeof<br>
>     raise RuntimeError(msg)<br>
><br>
> This is what my configuration looks like (adapted from<br>
> config/examples/arch-bgp-ibm-opt.py)<br>
> configure_options = [<br>
>   '--with-cc=mpixlc',<br>
>   '--with-fc=mpixlf90',<br>
>   '--with-cxx=mpixlcxx',<br>
>   'COPTFLAGS=-O3',<br>
>   'FOPTFLAGS=-O3',<br>
>   '--with-debugging=0',<br>
>   '--with-cmake=/soft/apps/fen/cmake-2.8.3/bin/cmake',<br>
> #  '--with-hdf5=/soft/apps/hdf5-1.8.0',<br>
>   '--download-parmetis=1',<br>
>   '--download-metis=1',<br>
>   '--download-plapack=1',<br>
>   '--download-hdf5=1'<br>
>   ]<br>
><br>
> I would appreciate any help building the llbrary there.<br>
><br>
> Thanks,<br>
> Jitu<br>
><br>
<br>
</div></div></blockquote></div><br></div>