<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">
<br>
<div>
<div>On Mar 24, 2013, at 12:28 PM, Matthew Knepley <<a href="mailto:knepley@gmail.com">knepley@gmail.com</a>></div>
<div> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<blockquote type="cite">
<div dir="ltr">On Mon, Mar 25, 2013 at 12:42 AM, Blaise A Bourdin <span dir="ltr">
<<a href="mailto:bourdin@lsu.edu" target="_blank">bourdin@lsu.edu</a>></span> wrote:<br>
<div class="gmail_extra">
<div class="gmail_quote">
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div>
<div style="word-wrap:break-word"><br>
<div>
<div>On Mar 23, 2013, at 11:50 PM, Matthew Knepley <<a href="mailto:knepley@gmail.com" target="_blank">knepley@gmail.com</a>></div>
<div> wrote:</div>
<br>
<blockquote type="cite">
<div dir="ltr">On Sun, Mar 24, 2013 at 12:24 PM, Blaise A Bourdin <span dir="ltr">
<<a href="mailto:bourdin@lsu.edu" target="_blank">bourdin@lsu.edu</a>></span> wrote:<br>
<div>
<div>
<blockquote style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Hi,<br>
<br>
I am trying to do some scaling tests but can't figure out something about LogSummary: When no custom stages / events are defined, how come "Main Stage" is not 100% of the time? What is not counted? Here is a example of what I get:<br>
</blockquote>
<div><br>
</div>
<div>Library loading?</div>
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
Really? Is there anything I can do to test if it really is library loading or to reduce loading time? I am attaching the full log summary</div>
<div></div>
</div>
<div style="word-wrap:break-word">
<div></div>
<div>Blaise</div>
<div><br>
</div>
<div>
<blockquote type="cite">
<div dir="ltr">
<div>
<div>
<div><br>
</div>
<div>   Matt</div>
<div> </div>
<blockquote style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Summary of Stages:   ----- Time ------  ----- Flops -----  --- Messages ---  -- Message Lengths --  -- Reductions --<br>
                        Avg     %Total     Avg     %Total   counts   %Total     Avg         %Total   counts   %Total<br>
 0:      Main Stage: 2.5763e+03  65.1%  3.2380e+15 100.0%  1.230e+11 100.0%  8.493e+02      100.0%  7.013e+06  97.0%<br>
<br>
Where is the missing 35% of the time? I call PetscLogBegin right after PetscInitialize.</blockquote>
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
<div><br>
</div>
<div style="">Okay, the total time is the time between PetscLogBegin() and the first several lines of PetscLogView(), before all the reductions.</div>
<div style="">Thus it does not look like library loading is responsible.</div>
<div style=""><br>
</div>
<div style="">In this log, the main routine seems to be KSPSolve which takes 1.5e3. It looks like some time in this app is just not</div>
<div style="">being logged. That would take popping the current stage and then pushing it again afterwards I think. We would have</div>
<div style="">to know more about the code.</div>
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
<div><br>
</div>
<div>That's what bugs me... I removed all custom logging and custom events from the code. The code does not call any external library. Basically, it iterates assembling a matrix, calling KSPSolve, assembling another matrix, calling TAOSolve, and writing results
 in exodus format.</div>
<div><br>
</div>
<div>Is there a command line options that would give me some informations on the log level operations?</div>
<div><br>
</div>
<div>Blaise</div>
<div><br>
</div>
<div><br>
</div>
</div>
<div apple-content-edited="true"><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; ">
<div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">
<span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; ">
<div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">
<span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; -webkit-text-decorations-in-effect: none; text-indent: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto; text-transform: none; orphans: 2; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; ">
<div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">
<div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">
-- </div>
<div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">
Department of Mathematics and Center for Computation & Technology</div>
<div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">
Louisiana State University, Baton Rouge, LA 70803, USA</div>
<div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">
Tel. +1 (225) 578 1612, Fax  +1 (225) 578 4276 <a href="http://www.math.lsu.edu/~bourdin">
http://www.math.lsu.edu/~bourdin</a></div>
<div><br class="khtml-block-placeholder">
</div>
<div><br class="khtml-block-placeholder">
</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
</div>
</span></div>
</span><br class="Apple-interchange-newline">
</div>
</span><br class="Apple-interchange-newline">
</span><br class="Apple-interchange-newline">
</div>
<br>
</body>
</html>