<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
    <div class="moz-cite-prefix">Dear Dr. Brown, <br>
          I was trying to use PETSc to mimic something like Chombo. The
      figure in this website represents my thought very well.  (<a
href="https://commons.lbl.gov/display/chombo/Chombo+-+Software+for+Adaptive+Solutions+of+Partial+Differential+Equations">https://commons.lbl.gov/display/chombo/Chombo+-+Software+for+Adaptive+Solutions+of+Partial+Differential+Equations</a>).
      My code simulates a flow over a objective, i.e. 2D cylinder. Finer
      resolution is needed near the objective. I can manually define
      where the finer resolution is needed.<br>
          BTW, I wonder if there is any examples for the Vec/Mat
      interface. Also, is there any examples for PETSc for GPU. <br>
      <br>
      thanks,<br>
      Alan<br>
    </div>
    <blockquote
cite="mid:CAMYG4GnJDWko3Swp8-s=H=aaSTfb-oVqaT1jeu9OVdkXaSDaEA@mail.gmail.com"
      type="cite">On Sat, Oct 6, 2012 at 10:47 PM, Alan <span dir="ltr"><<a
          moz-do-not-send="true" href="mailto:zhenglun.wei@gmail.com"
          target="_blank">zhenglun.wei@gmail.com</a>></span> wrote:<br>
      <div class="gmail_quote">
        <blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0
          .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
          <div bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
            <div>Dear Dr. Brown, <br>
                   Thanks for your reply and sorry for confusing you. <br>
                   I was trying to ask if there is an alternative way
              that I can replace the DMDACreate3d in
              /src/ksp/ksp/example/tutorials/ex45.c with something from
              outside of the PETSc (i.e. HYPRE). DMDACreate3d generates
              a 3D Cartesian grid with uniform grid size. However, I'm
              trying to import a local refined grid from outside of the
              PETSc (i.e. HYPRE) to replace this 3D Cartesian grid with
              unifrom grid size. Is there any examples for me to refer?<br>
            </div>
          </div>
        </blockquote>
        <div><br>
        </div>
        <div>Do we have automatic support for this? No. You could of
          course just use the Vec/Mat interface, but</div>
        <div>
          it sounds like a lot of coding on your part. I plan to do this
          eventually by specifying the data layout over</div>
        <div>the grid using PetscSection. However, the really important
          question here is, what do you need from the</div>
        <div>grid? If you don't need topological queries, just make the
          Vec/Mat and be done with it. If you do (which</div>
        <div>I imagine), then you need to be specific about what you
          need.</div>
        <div><br>
        </div>
        <div>   Matt</div>
        <div> </div>
        <blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0
          .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
          <div bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
            <div> thanks,<br>
              Alan<br>
              <br>
            </div>
            <blockquote type="cite">Run any example with -pc_type hypre.
              I'm not sure what you're asking for.<br>
              <br>
              <div class="gmail_quote">On Sat, Oct 6, 2012 at 8:04 PM,
                Alan <span dir="ltr"><<a moz-do-not-send="true"
                    href="mailto:zhenglun.wei@gmail.com" target="_blank">zhenglun.wei@gmail.com</a>></span>
                wrote:<br>
                <blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0
                  .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Dear
                  Folks,<br>
                  I hope you're having a nice day.<br>
                  I'm trying to couple HYPRE with PETSc in order to use
                  PETSc solvers to<br>
                  obtain solutions (Poisson Equation) with local refined
                  grid from HYPRE.<br>
                  Is there any examples in PETSc that I can refer? or is
                  there any<br>
                  examples in PETSc which introduce such a way that the
                  Matrix is imported<br>
                  from external software rather than generated by PETSc.<br>
                  <br>
                  thanks,<br>
                  Alan<br>
                  <br>
                </blockquote>
              </div>
              <br>
            </blockquote>
            <br>
          </div>
        </blockquote>
      </div>
      <br>
      <br clear="all">
      <div><br>
      </div>
      -- <br>
      What most experimenters take for granted before they begin their
      experiments is infinitely more interesting than any results to
      which their experiments lead.<br>
      -- Norbert Wiener<br>
    </blockquote>
    <br>
  </body>
</html>