On Sat, Oct 6, 2012 at 10:47 PM, Alan <span dir="ltr"><<a href="mailto:zhenglun.wei@gmail.com" target="_blank">zhenglun.wei@gmail.com</a>></span> wrote:<br><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">

  
    
  
  <div bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
    <div>Dear Dr. Brown, <br>
           Thanks for your reply and sorry for confusing you. <br>
           I was trying to ask if there is an alternative way that I can
      replace the DMDACreate3d in /src/ksp/ksp/example/tutorials/ex45.c
      with something from outside of the PETSc (i.e. HYPRE).
      DMDACreate3d generates a 3D Cartesian grid with uniform grid size.
      However, I'm trying to import a local refined grid from outside of
      the PETSc (i.e. HYPRE) to replace this 3D Cartesian grid with
      unifrom grid size. Is there any examples for me to refer?<br></div></div></blockquote><div><br></div><div>Do we have automatic support for this? No. You could of course just use the Vec/Mat interface, but</div><div>
it sounds like a lot of coding on your part. I plan to do this eventually by specifying the data layout over</div><div>the grid using PetscSection. However, the really important question here is, what do you need from the</div>
<div>grid? If you don't need topological queries, just make the Vec/Mat and be done with it. If you do (which</div><div>I imagine), then you need to be specific about what you need.</div><div><br></div><div>   Matt</div>
<div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div bgcolor="#FFFFFF" text="#000000"><div>
      thanks,<br>
      Alan<br>
      <br>
    </div>
    <blockquote type="cite">Run any example with -pc_type hypre. I'm not sure what
      you're asking for.<br>
      <br>
      <div class="gmail_quote">On Sat, Oct 6, 2012 at 8:04 PM, Alan <span dir="ltr"><<a href="mailto:zhenglun.wei@gmail.com" target="_blank">zhenglun.wei@gmail.com</a>></span>
        wrote:<br>
        <blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Dear Folks,<br>
          I hope you're having a nice day.<br>
          I'm trying to couple HYPRE with PETSc in order to use PETSc
          solvers to<br>
          obtain solutions (Poisson Equation) with local refined grid
          from HYPRE.<br>
          Is there any examples in PETSc that I can refer? or is there
          any<br>
          examples in PETSc which introduce such a way that the Matrix
          is imported<br>
          from external software rather than generated by PETSc.<br>
          <br>
          thanks,<br>
          Alan<br>
          <br>
        </blockquote>
      </div>
      <br>
    </blockquote>
    <br>
  </div>

</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br>What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>
-- Norbert Wiener<br>