<div class="gmail_quote">On Wed, Aug 8, 2012 at 1:00 PM, Jinquan Zhong <span dir="ltr"><<a href="mailto:jzhong@scsolutions.com" target="_blank">jzhong@scsolutions.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d">This makes sense to me.  I thought the preallocation only applies to MatCreateMPIAIJwithArrays(…) and other more complicate functions.<u></u><u></u></span></p>

<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d"><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d">The matrix coming out from ScaLAPACK will be repopulated into a sparse matrix in a much large scale. </span></p>
</blockquote><div><br></div><div>I don't understand this exactly. You are taking the entries of the dense matrix and putting them into a much larger sparse matrix? In that case, you probably never need Elemental, but you definitely need to preallocate.</div>
<div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1f497d"> Do I need to install elemental package in PETSc in order
 to use MATELEMENTAL? </span></p></blockquote></div><br><div>Yes, just configure petsc-dev with --download-elemental.</div>