<div class="gmail_quote">On Sun, Jul 22, 2012 at 9:49 AM, Umut Tabak <span dir="ltr"><<a href="mailto:u.tabak@tudelft.nl" target="_blank">u.tabak@tudelft.nl</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Dear all,<br>
<br>
I am testing some iterative methods with MATLAB and aside with PETSc however I have a question which might be answered in the documentation however I could not find that?<br>
<br>
In MATLAB, at least on recent versions, one can specify a drop tolerance for the incomplete cholesky preconditioner, I was wondering if the same is possible with PETSc or not?<br></blockquote><div><br></div><div>You can get an ILUT using MatSuperluSetILUDropTol (-mat_superlu_ilu_droptol) or from Hypre's PILUT (-pc_hypre_pilut_tol).</div>
<div><br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><br>
One more question, is the condition number order 1e+6(estimated with condest in MATLAB) rather high for an iterative method? With icc, with a drop tolerance of 1e-3 or 1e-4, as a preconditioner to pcg, I can get decent iteration numbers to convergence in MATLAB, it is sometimes even faster than solving the system with the available factorization information and I was wondering if I can make it faster with some other options in PETSc or not?<br>
</blockquote><div><br></div><div>What continuum equations are you solving? What discretization?</div></div>