<br><font size=2 face="sans-serif">Thanks for your answer, Matt.</font>
<br><font size=2 face="sans-serif">The problem is that I am using ML as
a preconditioner and it does not support 64 bit indices (information reported
in the PETSc configure phase).</font>
<br><font size=2 face="sans-serif">I am afraid I am stuck with this wrong
nonzeros number.<br>
<br>
Nicolas<br>
</font>
<table>
<tr valign=top>
<td rowspan=2><font size=2 face="sans-serif"> </font><img src=cid:_1_088A8CD0088A89140034035FC1257A40><font size=2 face="sans-serif">
</font>
<td><font size=1 face="sans-serif"> </font>
<tr valign=top>
<td><font size=1 color=#ff8100 face="Arial"><b>Nicolas TARDIEU</b></font><font size=1 color=#ff8100 face="Arial"><b><br>
Ing. Chercheur</b></font><font size=1 color=#0062e1 face="Arial"><br>
EDF - R&D Dpt AMA</font><font size=1 color=#0062e1 face="sans-serif"><br>
</font>
<br><font size=1 color=#0062e1 face="Arial"><b>nicolas.tardieu@edf.fr</b></font>
<br><font size=1 color=#0062e1 face="Arial">Tél. : 01 47 65 39 05</font>
<tr>
<td valign=top><font size=2 face="sans-serif"> </font><img src=cid:_1_088A9B8C088A97D00034035FC1257A40><font size=2 face="sans-serif">
</font>
<td><font size=1 color=#0062e1 face="Arial">Un geste simple pour l'environnement,
n'imprimez ce message que si vous en avez l'utilité.</font></table>
<br>
<br>
<br>
<br>
<table width=100%>
<tr valign=top>
<td width=40%><font size=1 face="sans-serif"><b>knepley@gmail.com</b> </font>
<br><font size=1 face="sans-serif">Envoyé par : petsc-users-bounces@mcs.anl.gov</font>
<p><font size=1 face="sans-serif">17/07/2012 16:59</font>
<table border>
<tr valign=top>
<td bgcolor=white>
<div align=center><font size=1 face="sans-serif">Veuillez répondre à<br>
petsc-users@mcs.anl.gov</font></div></table>
<br>
<td width=59%>
<table width=100%>
<tr valign=top>
<td>
<div align=right><font size=1 face="sans-serif">A</font></div>
<td><font size=1 face="sans-serif">petsc-users@mcs.anl.gov</font>
<tr valign=top>
<td>
<div align=right><font size=1 face="sans-serif">cc</font></div>
<td>
<tr valign=top>
<td>
<div align=right><font size=1 face="sans-serif">Objet</font></div>
<td><font size=1 face="sans-serif">Re: [petsc-users] Number of nonzeros
> 2^31-1</font></table>
<br>
<table>
<tr valign=top>
<td>
<td></table>
<br></table>
<br>
<br>
<br><font size=3>On Tue, Jul 17, 2012 at 6:20 AM, Nicolas TARDIEU <</font><a href=mailto:nicolas.tardieu@edf.fr target=_blank><font size=3 color=blue><u>nicolas.tardieu@edf.fr</u></font></a><font size=3>>
wrote:</font>
<br><font size=3 face="sans-serif"><br>
Dear PETSc users,</font><font size=3> <br>
</font><font size=3 face="sans-serif"><br>
I am solving an unstructured finite element-based problem with 500 millions
unkwowns with PETSc.<br>
The number of nonzeros is greater than 2^31-1. </font><font size=3>
</font><font size=3 face="sans-serif"><br>
Here is the KSPView I get : </font><font size=3 face="Courier New"><br>
----------------------------------------------------------------------------------------------------------------</font><font size=3>
</font><font size=3 face="Courier New"><br>
Matrix Object: 700 MPI processes </font><font size=3>
</font><font size=3 face="Courier New"><br>
type: mpiaij</font><font size=3> </font><font size=3 face="Courier New"><br>
rows=499125000, cols=499125000</font><font size=3> </font><font size=3 face="Courier New"><br>
total: nonzeros=-</font><a href=tel:2147483648 target=_blank><font size=3 color=blue face="Courier New"><u>2147483648</u></font></a><font size=3 face="Courier New">,
allocated nonzeros=-</font><a href=tel:2147483648 target=_blank><font size=3 color=blue face="Courier New"><u>2147483648</u></font></a><font size=3>
</font><font size=3 face="Courier New"><br>
total number of mallocs used during MatSetValues calls =0</font><font size=3>
</font><font size=3 face="Courier New"><br>
using I-node (on process 0) routines: found 242923
nodes, limit used is 5</font><font size=3> </font><font size=3 face="Courier New"><br>
----------------------------------------------------------------------------------------------------------------</font><font size=3><br>
</font><font size=3 face="sans-serif"><br>
As you can see, The number of nonzeros is <0.</font><font size=3> </font><font size=3 face="sans-serif"><br>
I would like to check that this is due to the number of nonzeros being
greater than 2^31-1.</font><font size=3> <br>
</font><font size=3 face="sans-serif"><br>
Here is a short description of the size of differents types : </font><font size=3 face="Courier New"><br>
----------------------------------------------------------------------------------------------------------------</font><font size=3>
</font><font size=3 face="Courier New"><br>
Compiled with full precision matrices (default)</font><font size=3> </font><font size=3 face="Courier New"><br>
sizeof(short) 2 sizeof(int) 4 sizeof(long) 8 sizeof(void*) 8 sizeof(PetscScalar)
8</font><font size=3> </font><font size=3 face="Courier New"><br>
----------------------------------------------------------------------------------------------------------------</font><font size=3>
<br>
</font><font size=3 face="sans-serif"><br>
Is there a workaround? Should I worry about the result of my simulation?</font><font size=3>
</font>
<br>
<br><font size=3>You could configure using --with-64-bit-indices.</font>
<br>
<br><font size=3> Matt</font>
<br><font size=3> </font>
<br><font size=3 face="sans-serif">Thanks in advance,</font><font size=3>
</font><font size=3 face="sans-serif"><br>
Nicolas</font><font size=3> </font>
<table>
<tr valign=top>
<td rowspan=2><font size=3 face="sans-serif"> </font><img src=cid:_1_09C38BB009C387C80034035FC1257A40><font size=3 face="sans-serif">
</font>
<td><font size=1 face="sans-serif"> </font><font size=3> </font>
<tr valign=top>
<td><font size=1 color=#ff8100 face="Arial"><b>Nicolas TARDIEU<br>
Ing. Chercheur</b></font><font size=1 color=#0062e1 face="Arial"><br>
EDF - R&D Dpt AMA</font><font size=3><br>
</font><font size=1 color=blue face="Arial"><b><u><br>
</u></b></font><a href=mailto:nicolas.tardieu@edf.fr target=_blank><font size=1 color=blue face="Arial"><b><u>nicolas.tardieu@edf.fr</u></b></font></a><font size=3>
</font><font size=1 color=#0062e1 face="Arial"><br>
Tél. : 01 47 65 39 05</font><font size=3> </font>
<tr>
<td valign=top><font size=3 face="sans-serif"> </font><img src=cid:_1_09C3987809C394900034035FC1257A40><font size=3 face="sans-serif">
</font>
<td><font size=1 color=#0062e1 face="Arial">Un geste simple pour l'environnement,
n'imprimez ce message que si vous en avez l'utilité.</font></table>
<br>
<p><font size=3><br>
Ce message et toutes les pièces jointes (ci-après le 'Message') sont établis
à l'intention exclusive des destinataires et les informations qui y figurent
sont strictement confidentielles. Toute utilisation de ce Message non conforme
à sa destination, toute diffusion ou toute publication totale ou partielle,
est interdite sauf autorisation expresse.</font>
<p><font size=3>Si vous n'êtes pas le destinataire de ce Message, il vous
est interdit de le copier, de le faire suivre, de le divulguer ou d'en
utiliser tout ou partie. Si vous avez reçu ce Message par erreur, merci
de le supprimer de votre système, ainsi que toutes ses copies, et de n'en
garder aucune trace sur quelque support que ce soit. Nous vous remercions
également d'en avertir immédiatement l'expéditeur par retour du message.</font>
<p><font size=3>Il est impossible de garantir que les communications par
messagerie électronique arrivent en temps utile, sont sécurisées ou dénuées
de toute erreur ou virus.<br>
____________________________________________________</font>
<p><font size=3>This message and any attachments (the 'Message') are intended
solely for the addressees. The information contained in this Message is
confidential. Any use of information contained in this Message not in accord
with its purpose, any dissemination or disclosure, either whole or partial,
is prohibited except formal approval.</font>
<p><font size=3>If you are not the addressee, you may not copy, forward,
disclose or use any part of it. If you have received this message in error,
please delete it and all copies from your system and notify the sender
immediately by return message.</font>
<p><font size=3>E-mail communication cannot be guaranteed to be timely
secure, error or virus-free.</font>
<p><font size=3><br>
</font>
<br>
<br><font size=3>-- <br>
What most experimenters take for granted before they begin their experiments
is infinitely more interesting than any results to which their experiments
lead.<br>
-- Norbert Wiener</font>
<br><p></p>
<p><br>
Ce message et toutes les pièces jointes (ci-après le 'Message') sont établis à l'intention exclusive des destinataires et les informations qui y figurent sont strictement confidentielles. Toute utilisation de ce Message non conforme à sa destination, toute diffusion ou toute publication totale ou partielle, est interdite sauf autorisation expresse.</p>
<p>Si vous n'êtes pas le destinataire de ce Message, il vous est interdit de le copier, de le faire suivre, de le divulguer ou d'en utiliser tout ou partie. Si vous avez reçu ce Message par erreur, merci de le supprimer de votre système, ainsi que toutes ses copies, et de n'en garder aucune trace sur quelque support que ce soit. Nous vous remercions également d'en avertir immédiatement l'expéditeur par retour du message.</p>
<p>Il est impossible de garantir que les communications par messagerie électronique arrivent en temps utile, sont sécurisées ou dénuées de toute erreur ou virus.<br>
____________________________________________________</p>
<p>This message and any attachments (the 'Message') are intended solely for the addressees. The information contained in this Message is confidential. Any use of information contained in this Message not in accord with its purpose, any dissemination or disclosure, either whole or partial, is prohibited except formal approval.</p>
<p>If you are not the addressee, you may not copy, forward, disclose or use any part of it. If you have received this message in error, please delete it and all copies from your system and notify the sender immediately by return message.</p>
<p>E-mail communication cannot be guaranteed to be timely secure, error or virus-free.</p>