On Wed, Jun 13, 2012 at 6:27 AM, Gaetano Esposito <span dir="ltr"><<a href="mailto:gaetano@email.virginia.edu" target="_blank">gaetano@email.virginia.edu</a>></span> wrote:<br><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
On petsc-3.3, using the same code that I reported earlier, I get the<br>
following error:<br>
<br>
HDF5-DIAG: Error detected in HDF5 (1.8.8) MPI-process 0:<br>
  #000: H5D.c line 1102 in H5Dset_extent(): unable to set extend dataset<br>
    major: Dataset<br>
    minor: Unable to initialize object<br>
  #001: H5Dint.c line 2152 in H5D_set_extent(): dataset has contiguous storage<br>
    major: Invalid arguments to routine<br>
    minor: Out of range<br>
[0]PETSC ERROR: VecView_MPI_HDF5_DA() line 330 in src/dm/impls/da/gr2.c<br>
[0]PETSC ERROR: VecView_MPI_DA() line 486 in src/dm/impls/da/gr2.c<br>
[0]PETSC ERROR: VecView() line 776 in src/vec/vec/interface/vector.c<br>
[0]PETSC ERROR: main() line 137 in /archive03/test_petsc/c++laplace.cpp<br>
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, -1) - process 0<br>
</blockquote></div><br>Now it depends on exactly what you are doing here, since the error is from HDF5<div>which thinks that something is inconsistent. Please send a small example that</div><div>reproduces this error to <a href="mailto:petsc-maint@mcs.anl.gov">petsc-maint@mcs.anl.gov</a>.</div>
<div><br></div><div>  Thanks,</div><div><br></div><div>     Matt<br><div><div><br></div>-- <br>What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>
-- Norbert Wiener<br>
</div></div>