<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=UTF-8" http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body bgcolor="#ffffff" text="#000000">
    <br>
    Thanks for the response.<br>
    <br>
    On 12/10/2010 04:18 PM, Jed Brown wrote:
    <blockquote
      cite="mid:AANLkTi=j+NNNKQrqYQJcXVEBtEbSa5_7Q8EZL2LwnAw6@mail.gmail.com"
      type="cite">
      <div class="gmail_quote">On Fri, Dec 10, 2010 at 22:15, Luke Bloy
        <span dir="ltr">&lt;<a moz-do-not-send="true"
            href="mailto:luke.bloy@gmail.com">luke.bloy@gmail.com</a>&gt;</span>
        wrote:<br>
        <blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0pt 0pt 0pt
          0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204);
          padding-left: 1ex;">
          My problem is that i have a large number (~500,000)  of b
          vectors that I would like to find solutions for. My plan is to
          call KSPsolve repeatedly with each b. However I wonder if
          there are any solvers or approaches that might benefit from
          the fact that my A matrix does not change. Are there any
          decompositions that might still be sparse that would offer a
          speed up?</blockquote>
      </div>
      <br>
      <div>1. What is the high-level problem you are trying to solve?
         There might be a better way.</div>
      <div><br>
      </div>
    </blockquote>
    I'm solving a diffusion problem. essentially I have 2,000,000
    possible states for my system to be in. The system evolves based on
    a markov matrix M, which describes the probability the system moves
    from one state to another. This matrix is extremely sparse on the
    &lt; 100,000,000 nonzero elements. The problem is to pump
    mass/energy into the system at certain states. What I'm interested
    in is the steady state behavior of the system.<br>
    <br>
    basically the dynamics can be summarized as <br>
    <br>
    d_{t+1} = M d_{t} + d_i<br>
    <br>
    Where d_t is the state vector at time t and d_i shows the states I
    am pumping energy into. I want to find d_t as t goes to infinity.<br>
    <br>
    My current approach is to solve the following system.<br>
    <br>
    (I-M) d = d_i<br>
    <br>
    I'm certainly open to any suggestions you might have.<br>
    <br>
    <blockquote
      cite="mid:AANLkTi=j+NNNKQrqYQJcXVEBtEbSa5_7Q8EZL2LwnAw6@mail.gmail.com"
      type="cite">
      <div>2. If you can afford the memory, a direct solve probably
        makes sense.</div>
    </blockquote>
    <br>
    My understanding is the inverses would generally be dense. I
    certainly don't have any memory to hold a 2 million by 2 million
    dense matrix, I have about 40G to play with. So perhaps a
    decomposition might work? Which might you suggest?<br>
    <br>
    Thanks<br>
    Luke<br>
    <br>
  </body>
</html>