<html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">

<head>
<meta http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=utf-8">
<meta name=Generator content="Microsoft Word 12 (filtered medium)">
<style>
<!--
 /* Font Definitions */
 @font-face
        {font-family:"Cambria Math";
        panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Tahoma;
        panose-1:2 11 6 4 3 5 4 4 2 4;}
@font-face
        {font-family:Verdana;
        panose-1:2 11 6 4 3 5 4 4 2 4;}
 /* Style Definitions */
 p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0in;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:12.0pt;
        font-family:"Times New Roman","serif";}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
        color:blue;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {mso-style-priority:99;
        color:purple;
        text-decoration:underline;}
p.MsoListParagraph, li.MsoListParagraph, div.MsoListParagraph
        {mso-style-priority:34;
        margin-top:0in;
        margin-right:0in;
        margin-bottom:0in;
        margin-left:.5in;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:12.0pt;
        font-family:"Times New Roman","serif";}
span.EmailStyle17
        {mso-style-type:personal-reply;
        font-family:"Verdana","sans-serif";
        color:windowtext;}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;}
@page Section1
        {size:8.5in 11.0in;
        margin:1.0in 1.0in 1.0in 1.0in;}
div.Section1
        {page:Section1;}
 /* List Definitions */
 @list l0
        {mso-list-id:519706803;
        mso-list-type:hybrid;
        mso-list-template-ids:1651793672 67698703 67698713 67698715 67698703 67698713 67698715 67698703 67698713 67698715;}
@list l0:level1
        {mso-level-tab-stop:none;
        mso-level-number-position:left;
        text-indent:-.25in;}
ol
        {margin-bottom:0in;}
ul
        {margin-bottom:0in;}
-->
</style>
<!--[if gte mso 9]><xml>
 <o:shapedefaults v:ext="edit" spidmax="1026" />
</xml><![endif]--><!--[if gte mso 9]><xml>
 <o:shapelayout v:ext="edit">
  <o:idmap v:ext="edit" data="1" />
 </o:shapelayout></xml><![endif]-->
</head>

<body lang=EN-US link=blue vlink=purple>

<div class=Section1>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Verdana","sans-serif"'>Thanks
Barry and Jed.  TSSetIFunction and TSSetIJacobian from petsc-dev<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Verdana","sans-serif"'>are
working perfectly.<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Verdana","sans-serif"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Verdana","sans-serif"'>Chetan<o:p></o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Verdana","sans-serif"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<p class=MsoNormal><span style='font-size:11.0pt;font-family:"Verdana","sans-serif"'><o:p>&nbsp;</o:p></span></p>

<div style='border:none;border-left:solid blue 1.5pt;padding:0in 0in 0in 4.0pt'>

<div>

<div style='border:none;border-top:solid #B5C4DF 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in'>

<p class=MsoNormal><b><span style='font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"'>From:</span></b><span
style='font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"'>
petsc-users-bounces@mcs.anl.gov [mailto:petsc-users-bounces@mcs.anl.gov] <b>On
Behalf Of </b>Jed Brown<br>
<b>Sent:</b> Thursday, November 18, 2010 3:49 PM<br>
<b>To:</b> PETSc users list<br>
<b>Subject:</b> Re: [petsc-users] TS with inhomogeneous rhs<o:p></o:p></span></p>

</div>

</div>

<p class=MsoNormal><o:p>&nbsp;</o:p></p>

<div>

<p class=MsoNormal>On Thu, Nov 18, 2010 at 23:14, Chetan Jhurani &lt;<a
href="mailto:chetan.jhurani@gmail.com">chetan.jhurani@gmail.com</a>&gt; wrote:<o:p></o:p></p>

<div id=":1o3">

<p class=MsoNormal>&nbsp; &nbsp; &nbsp;M U_t = -K U + f(t)<br>
<br>
In addition, how can the code be kept nearly identical to allow different<br>
TS types to be used (EULER, BEULER, TSRUNGE_KUTTA, TSCRANK_NICHOLSON,<br>
etc)? &nbsp;I'd also like to take possible advantages of M and K being<br>
constants.<o:p></o:p></p>

</div>

</div>

<p class=MsoNormal><o:p>&nbsp;</o:p></p>

<div>

<p class=MsoNormal>As Barry says, we are transitioning to a better API for
this. &nbsp;You can use TSTHETA (theta=0.5 is Crank-Nicolson, theta=1 is
Backward Euler) with TSSetIFunction and TSSetIJacobian (see the man pages or
read section 6.1.2 of the users manual). &nbsp;Note that an
&quot;explicit&quot; method for your problem above needs to solve with the mass
matrix at every time step. &nbsp;Unless it is very cheap (e.g. block diagonal),
then it may not be worth it. &nbsp;PETSc's explicit methods do not currently
support this, but support for that will be added in the next few months.
&nbsp;At present, you would need to do the solve in your RHSFunction.<o:p></o:p></p>

</div>

<div>

<p class=MsoNormal><o:p>&nbsp;</o:p></p>

</div>

<div>

<p class=MsoNormal>Jed<o:p></o:p></p>

</div>

</div>

</div>

</body>

</html>