Hi Matt and Satish,<br>
Thank you very much for pointing this out. I almost forgot this.  I will pay more attention to -log-summary.  <br>
<br>
Yan<br><br><div class="gmail_quote">On Wed, Jun 24, 2009 at 6:18 PM, Satish Balay <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:balay@mcs.anl.gov">balay@mcs.anl.gov</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
Have you tried running with -log_summary?<br>
<br>
[I still need to check tau]<br>
<div><div></div><div class="h5"><br>
Satish<br>
<br>
On Wed, 24 Jun 2009, Ryan Yan wrote:<br>
<br>
&gt;  Hi Satish,<br>
&gt; What I am tring to do is using TAU to profile a solver using PETSc  function<br>
&gt; calls on a Sicortex cluster. Now I am just building on a desktop.<br>
&gt;<br>
&gt; I tried tauex, it can run. But it did not provide me any explicit profiling<br>
&gt; about PETSc function calls. Instead, it only gave me profiling on the TAU<br>
&gt; application and MPI routines.<br>
&gt;<br>
&gt; I have send email inquiries to TAU developer. They suggestted me rebuild<br>
&gt; PETSc with TAU if I want those profiles on PETSc function calls.<br>
&gt;<br>
&gt; Frankly, I do not have experience with profiling or performance analysis on<br>
&gt; a solver.  Do you have any suggestion or pointers to other source on doing<br>
&gt; performance analysis for PETSc solvers, considering the option of using TAU<br>
&gt; may need lots of workarounds when I rebuilt PETSC with TAU on the cluster.<br>
&gt;<br>
&gt; Thank you very much,<br>
&gt;<br>
&gt; Yan<br>
&gt;<br>
&gt;  On Wed, Jun 24, 2009 at 5:52 PM, Satish Balay &lt;<a href="mailto:balay@mcs.anl.gov">balay@mcs.anl.gov</a>&gt; wrote:<br>
&gt;<br>
&gt; &gt; TAU isn&#39;t tested with petsc in the past few years. So thing could be<br>
&gt; &gt; broken. I&#39;ll have to check on this.<br>
&gt; &gt;<br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt; Hi Satish,<br>
&gt; What I am tring to do is using TAU to profile a solver using PETSc  function<br>
&gt; calls on a Sicortex cluster.<br>
&gt;<br>
&gt; I tried tauex, it can run. But it did not provide me any explicit profiling<br>
&gt; about PETSc function calls. Instead, it just give me an profiling on the TAU<br>
&gt; application and MPI routines.<br>
&gt;<br>
&gt; I have send inquiryies to TAU developer. They suggestted me rebuild PETSc<br>
&gt; with TAU if I want those profiles on PETSc function calls.<br>
&gt;<br>
&gt; Frankly, I do not have experience with profiling or performance analysis on<br>
&gt; a solver. Do you have any suggestion on doing performance analysis for PETSc<br>
&gt; solvers?<br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt; &gt;<br>
&gt; &gt; One comment though.. If you have tau built with mpi - you should use<br>
&gt; &gt; that mpi &amp; wrappers with tau and not use --download-mpich. [but this<br>
&gt; &gt; is also likely broken]<br>
&gt; &gt;<br>
&gt; &gt; Satish<br>
&gt; &gt;<br>
&gt; &gt; On Wed, 24 Jun 2009, Ryan Yan wrote:<br>
&gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; Hi all,<br>
&gt; &gt; &gt; I got configuration errors, when I trying to built PETSC with Tau.<br>
&gt; &gt; &gt; Basically, I followed the instruction on the installation webpage of<br>
&gt; &gt; PETSc.<br>
&gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; In the attached file, please find the configure log.<br>
&gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; I do built TAU and PDT seperately, and TAU with mpi and PDT.<br>
&gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; If any more information is needed, please let me know.<br>
&gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; Thanks,<br>
&gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; Yan<br>
&gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt;<br>
&gt; &gt;<br>
&gt;<br>
<br>
</div></div></blockquote></div><br>