
<html>

<head>

<style>

.hmmessage P

{

margin:0px;

padding:0px

}

body.hmmessage

{

font-size: 10pt;

font-family:Verdana

}

</style>

</head>

<body class='hmmessage'>

Here is my -log_summary:<br>Something looks a bit strange to me; its the MPI Reductions below.<br>Other than that, i dont see anything relevant.<br>What do you think?<br>Thanks<br><br><br><br>---------------------------------------------- PETSc Performance Summary: ----------------------------------------------<br><br>./diff-conv-opt on a linux-gnu named linux-stchouan with 1 processor, by stephane Tue Feb 24 13:54:35 2009<br>Using Petsc Release Version 2.3.3, Patch 13, Thu May 15 17:29:26 CDT 2008 HG revision: 4466c6289a0922df26e20626fd4a0b4dd03c8124<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp; Max&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Max/Min&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Avg&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Total <br>Time (sec):&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp; &nbsp; 2.937e+03&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1.00000&nbsp;&nbsp; 2.937e+03<br>Objects:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp; 3.420e+03&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1.00000&nbsp;&nbsp; 3.420e+03<br>Flops:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp; 2.690e+09&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1.00000&nbsp;&nbsp; 2.690e+09&nbsp; 2.690e+09<br>Flops/sec:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 9.161e+05&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1.00000&nbsp;&nbsp; 9.161e+05&nbsp; 9.161e+05<br>MPI Messages:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.000e+00&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.00000&nbsp;&nbsp; 0.000e+00&nbsp; 0.000e+00<br>MPI Message Lengths:&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.000e+00&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.00000&nbsp;&nbsp; 0.000e+00&nbsp; 0.000e+00<br>MPI Reductions:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1.189e+05&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1.00000<br><br>Flop counting convention: 1 flop = 1 real number operation of type (multiply/divide/add/subtract)<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; e.g., VecAXPY() for real vectors of length N --&gt; 2N flops<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; and VecAXPY() for complex vectors of length N --&gt; 8N flops<br><br>Summary of Stages:&nbsp;&nbsp; ----- Time ------&nbsp; ----- Flops -----&nbsp; --- Messages ---&nbsp; -- Message Lengths --&nbsp; -- Reductions --<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Avg&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; %Total&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Avg&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; %Total&nbsp;&nbsp; counts&nbsp;&nbsp; %Total&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Avg&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; %Total&nbsp;&nbsp; counts&nbsp;&nbsp; %Total <br>&nbsp;0:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Main Stage: 2.9367e+03 100.0%&nbsp; 2.6905e+09 100.0%&nbsp; 0.000e+00&nbsp;&nbsp; 0.0%&nbsp; 0.000e+00&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.0%&nbsp; 1.106e+03&nbsp;&nbsp; 0.9% <br><br>------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------<br>See the 'Profiling' chapter of the users' manual for details on interpreting output.<br>Phase summary info:<br>&nbsp;&nbsp; Count: number of times phase was executed<br>&nbsp;&nbsp; Time and Flops/sec: Max - maximum over all processors<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Ratio - ratio of maximum to minimum over all processors<br>&nbsp;&nbsp; Mess: number of messages sent<br>&nbsp;&nbsp; Avg. len: average message length<br>&nbsp;&nbsp; Reduct: number of global reductions<br>&nbsp;&nbsp; Global: entire computation<br>&nbsp;&nbsp; Stage: stages of a computation. Set stages with PetscLogStagePush() and PetscLogStagePop().<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; %T - percent time in this phase&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; %F - percent flops in this phase<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; %M - percent messages in this phase&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; %L - percent message lengths in this phase<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; %R - percent reductions in this phase<br>&nbsp;&nbsp; Total Mflop/s: 10e-6 * (sum of flops over all processors)/(max time over all processors)<br>------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------<br><br>Event&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Count&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Time (sec)&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Flops/sec&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; --- Global ---&nbsp; --- Stage ---&nbsp;&nbsp; Total<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Max Ratio&nbsp; Max&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Ratio&nbsp;&nbsp; Max&nbsp; Ratio&nbsp; Mess&nbsp;&nbsp; Avg len Reduct&nbsp; %T %F %M %L %R&nbsp; %T %F %M %L %R Mflop/s<br>------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------<br><br>--- Event Stage 0: Main Stage<br><br>VecDot&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 202 1.0 3.0360e-02 1.0 3.96e+08 1.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 396<br>VecMDot&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 202 1.0 3.0552e-02 1.0 3.94e+08 1.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 394<br>VecNorm&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1110 1.0 1.2257e+00 1.0 5.40e+07 1.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00&nbsp; 0&nbsp; 2&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 0&nbsp; 2&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 54<br>VecScale&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 404 1.0 3.5342e-02 1.0 3.41e+08 1.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 341<br>VecCopy&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 507 1.0 8.4626e-02 1.0 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<br>VecSet&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1408 1.0 1.1664e-01 1.0 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<br>VecAXPY&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 202 1.0 2.6221e-02 1.0 4.59e+08 1.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 459<br>VecWAXPY&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 202 1.0 4.4239e-02 1.0 1.36e+08 1.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 136<br>VecMAXPY&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 404 1.0 7.3515e-02 1.0 3.27e+08 1.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00&nbsp; 0&nbsp; 1&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 0&nbsp; 1&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 327<br>VecAssemblyBegin&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 302 1.0 9.2960e-04 1.0 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<br>VecAssemblyEnd&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 302 1.0 5.5790e-04 1.0 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<br>VecScatterBegin&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 603 1.0 1.9933e-01 1.0 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<br>VecNormalize&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 404 1.0 5.5408e-01 1.0 6.52e+07 1.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00&nbsp; 0&nbsp; 1&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 0&nbsp; 1&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 65<br>MatMult&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 404 1.0 2.6457e+00 1.0 2.26e+08 1.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00&nbsp; 0 22&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 0 22&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 226<br>MatSolve&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 404 1.0 4.6454e+00 1.0 1.28e+08 1.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00&nbsp; 0 22&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 0 22&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 128<br>MatLUFactorNum&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 202 1.0 1.5211e+01 1.0 8.85e+07 1.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00&nbsp; 1 50&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 1 50&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 89<br>MatILUFactorSym&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 100 1.0 1.9993e+00 1.0 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 1.0e+02&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 9&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<br>MatAssemblyBegin&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 404 1.0 9.6217e-04 1.0 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<br>MatAssemblyEnd&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 404 1.0 1.4601e+00 1.0 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<br>MatGetRowIJ&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 100 1.0 2.4641e-04 1.0 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<br>MatGetOrdering&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 100 1.0 7.6755e-02 1.0 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 2.0e+02&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0 18&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<br>MatZeroEntries&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 99 1.0 3.6160e-01 1.0 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<br>SNESSolve&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 100 1.0 2.9339e+03 1.0 9.17e+05 1.0 0.0e+00 0.0e+00 1.0e+03100100&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 1 100100&nbsp; 0&nbsp; 0 91&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1<br>SNESLineSearch&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 202 1.0 7.9707e+02 1.0 4.35e+05 1.0 0.0e+00 0.0e+00 4.0e+02 27 13&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 27 13&nbsp; 0&nbsp; 0 37&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<br>SNESFunctionEval&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 302 1.0 1.1836e+03 1.0 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 3.0e+02 40&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 40&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0 27&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<br>SNESJacobianEval&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 202 1.0 1.7238e+03 1.0 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 2.0e+02 59&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 59&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0 18&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<br>KSPGMRESOrthog&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 202 1.0 7.0303e-02 1.0 3.42e+08 1.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00&nbsp; 0&nbsp; 1&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 0&nbsp; 1&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 342<br>KSPSetup&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 202 1.0 4.6391e-02 1.0 0.00e+00 0.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<br>KSPSolve&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 202 1.0 2.4101e+01 1.0 9.65e+07 1.0 0.0e+00 0.0e+00 3.0e+02&nbsp; 1 86&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 1 86&nbsp; 0&nbsp; 0 27&nbsp;&nbsp;&nbsp; 97<br>PCSetUp&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 202 1.0 1.7296e+01 1.0 7.78e+07 1.0 0.0e+00 0.0e+00 3.0e+02&nbsp; 1 50&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 1 50&nbsp; 0&nbsp; 0 27&nbsp;&nbsp;&nbsp; 78<br>PCApply&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 404 1.0 4.6487e+00 1.0 1.28e+08 1.0 0.0e+00 0.0e+00 0.0e+00&nbsp; 0 22&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 0 22&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp; 0&nbsp;&nbsp; 128<br>------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------<br><br>Memory usage is given in bytes:<br><br>Object Type&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Creations&nbsp;&nbsp; Destructions&nbsp;&nbsp; Memory&nbsp; Descendants' Mem.<br><br>--- Event Stage 0: Main Stage<br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Index Set&nbsp;&nbsp; 904&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 901&nbsp;&nbsp; 107564984&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Vec &nbsp; &nbsp; 1511&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1497&nbsp; 357441684&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Vec Scatter&nbsp;&nbsp; 604&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 604&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Matrix&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 101&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 99&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 942432084&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; SNES&nbsp;&nbsp; 100&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 99&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 12276&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Krylov Solver&nbsp;&nbsp; 100&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 99&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1671120&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Preconditioner&nbsp;&nbsp; 100&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 99&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 14256&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<br>========================================================================================================================<br>Average time to get PetscTime(): 1.49164e-06<br>OptionTable: -snes_converged_reason<br>OptionTable: -snes_max_it 20<br>OptionTable: -snes_rtol 0.0000001<br>OptionTable: -snes_stol 0.001<br>Compiled without FORTRAN kernels<br>Compiled with full precision matrices (default)<br>sizeof(short) 2 sizeof(int) 4 sizeof(long) 4 sizeof(void*) 4 sizeof(PetscScalar) 8<br>Configure run at: Mon Feb 23 23:01:43 2009<br>Configure options: --with-debugging=no -with-shared --download-mpich=1<br>-----------------------------------------<br><br><br><br><br>&gt; <br>&gt; Message: 7<br>&gt; Date: Tue, 24 Feb 2009 18:05:38 +0100<br>&gt; From: STEPHANE TCHOUANMO &lt;tchouanm@msn.com&gt;<br>&gt; Subject: Petsc slowness on a single processor machine?<br>&gt; To: &lt;petsc-users@mcs.anl.gov&gt;<br>&gt; Message-ID: &lt;BAY107-W5D076FE1F3A7037240F88C2AF0@phx.gbl&gt;<br>&gt; Content-Type: text/plain; charset="windows-1256"<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; Dear all,<br>&gt; <br>&gt; I use petsc to solve a nonlinear convection-diffusion type equation in porous media.<br>&gt; The built linear system's size is 30000 and its resolution lasts about a hour on a single processor machine (my laptop...).<br>&gt; I<br>&gt; run for that a hundred time steps and have in average 4 Newton<br>&gt; iterations per time step. So a hour seems huge to me with the optimized<br>&gt; version of Petsc.<br>&gt; I tryed to profile my code with the options<br>&gt; "-log_summary" and "-info". What i get out of it is that the first time<br>&gt; step lasts about 15min representing 25% of the total time and i think<br>&gt; its not normal.<br>&gt; The thing is, these 15min happen at the second call<br>&gt; of the petsc routine "VecScatterCreate()" right after the first Newton residual.<br>&gt; <br>&gt; Any idea?<br>&gt; Thanks.<br>&gt; <br>&gt; Stephane<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; _________________________________________________________________<br>&gt; Show them the way! Add maps and directions to your party invites. <br>&gt; http://www.microsoft.com/windows/windowslive/products/events.aspx<br>&gt; -------------- next part --------------<br>&gt; An HTML attachment was scrubbed...<br>&gt; URL: &lt;http://lists.mcs.anl.gov/pipermail/petsc-users/attachments/20090224/c695a2bf/attachment-0001.htm&gt;<br>&gt; <br>&gt; ------------------------------<br>&gt; <br>&gt; Message: 8<br>&gt; Date: Tue, 24 Feb 2009 11:22:18 -0600<br>&gt; From: Matthew Knepley &lt;knepley@gmail.com&gt;<br>&gt; Subject: Re: Petsc slowness on a single processor machine?<br>&gt; To: PETSc users list &lt;petsc-users@mcs.anl.gov&gt;<br>&gt; Message-ID:<br>&gt;         &lt;a9f269830902240922y6751b40aqf8ea84257c139fd9@mail.gmail.com&gt;<br>&gt; Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"<br>&gt; <br>&gt; 2009/2/24 STEPHANE TCHOUANMO &lt;tchouanm@msn.com&gt;<br>&gt; <br>&gt; &gt;  Dear all,<br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt; I use petsc to solve a nonlinear convection-diffusion type equation in<br>&gt; &gt; porous media.<br>&gt; &gt; The built linear system's size is 30000 and its resolution lasts about a<br>&gt; &gt; hour on a single processor machine (my laptop...).<br>&gt; &gt; I run for that a hundred time steps and have in average 4 Newton iterations<br>&gt; &gt; per time step. So a hour seems huge to me with the optimized version of<br>&gt; &gt; Petsc.<br>&gt; &gt; I tryed to profile my code with the options "-log_summary" and "-info".<br>&gt; &gt; What i get out of it is that the first time step lasts about 15min<br>&gt; &gt; representing 25% of the total time and i think its not normal.<br>&gt; &gt; The thing is, these 15min happen at the second call of the petsc routine<br>&gt; &gt; "VecScatterCreate()" right after the first Newton residual.<br>&gt; &gt;<br>&gt; <br>&gt; We can't say anything without seeing the entire output of -log_summary.<br>&gt; <br>&gt;    Matt<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt; Any idea?<br>&gt; &gt; Thanks.<br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt; Stephane<br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt; &lt;http://www.live.com/getstarted.aspx&gt;<br>&gt; &gt; &lt;http://www.microsoft.com/windows/windowslive/default.aspx&gt;<br>&gt; &gt; ------------------------------<br>&gt; &gt; See all the ways you can stay connected to friends and family&lt;http://www.microsoft.com/windows/windowslive/default.aspx&gt;<br>&gt; &gt;<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; -- <br>&gt; What most experimenters take for granted before they begin their experiments<br>&gt; is infinitely more interesting than any results to which their experiments<br>&gt; lead.<br>&gt; -- Norbert Wiener<br>&gt; -------------- next part --------------<br>&gt; An HTML attachment was scrubbed...<br>&gt; URL: &lt;http://lists.mcs.anl.gov/pipermail/petsc-users/attachments/20090224/cd1ffccb/attachment-0001.htm&gt;<br>&gt; <br>&gt; ------------------------------<br>&gt; <br>&gt; _______________________________________________<br>&gt; petsc-users mailing list<br>&gt; petsc-users@mcs.anl.gov<br>&gt; https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/petsc-users<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; End of petsc-users Digest, Vol 2, Issue 32<br>&gt; ******************************************<br><br /><hr />Get news, entertainment and everything you care about at Live.com. <a href='http://www.live.com/getstarted.aspx ' target='_new'>Check it out!</a></body>

</html>