Hello Matt...<br><br>1) configure.log attached<br><br>2) Yes, I am online. <br><br>3) At the moment I want to develop &amp; run PARALLEL codes on my FC6 Desktop (single machine). Should I use the option --download-mpich=1 or --download-mpich=0
<br><br>regards,<br>Amjad Ali.<br><br><div><span class="gmail_quote">On 9/4/07, <b class="gmail_sendername">Matthew Knepley</b> &lt;<a href="mailto:petsc-maint@mcs.anl.gov">petsc-maint@mcs.anl.gov</a>&gt; wrote:</span><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
1) Always send configure.log<br><br>2) It appears that you cannot reach the PETSc ftp site. Are you online?<br><br>&nbsp;&nbsp; Matt<br><br>On 9/4/07, amjad ali &lt;<a href="mailto:amjad11@gmail.com">amjad11@gmail.com</a>&gt; wrote:
<br>&gt; Hello all in PETSc team and others,<br>&gt;<br>&gt; I tried to install/configure PETSc 2.3.3-p5 on my FC6 desktop computer.<br>&gt; Following Happend:<br>&gt;<br>&gt; [petsc1@localhost petsc-2.3.3-p5]$ ./config/configure.py --with-cc=gcc
<br>&gt; --with-fc=gfortran --with-cxx=g++ --download-f-blas-lapack=1<br>&gt; --download-mpich=1 --with-scalar-type=complex --with-clanguage=cxx<br>&gt; =================================================================================
<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;Configuring PETSc to compile on your system<br>&gt;<br>&gt; =================================================================================<br>&gt; TESTING: configureLibrary from<br>&gt; config.packages.BlasLapack
(python/BuildSystem/con*********************************************************************************<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;UNABLE to CONFIGURE with GIVEN OPTIONS&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;(see configure.log for<br>&gt; details):<br>&gt; ---------------------------------------------------------------------------------------
<br>&gt; Error downloading fblaslapack.tar.gz requested with -with-f-blas-lapack<br>&gt; option<br>&gt; *********************************************************************************<br>&gt;<br>&gt; How to tackle this situation?
<br>&gt;<br>&gt; At the moment I want to develop &amp; run PARALLEL codes on my FC6 Desktop<br>&gt; (single machine). Should I use the option --download-mpich=1 or<br>&gt; --download-mpich=0<br>&gt;<br>&gt; Regards to All.
<br>&gt; Amjad Ali.<br>&gt;<br>&gt; On 9/4/07, Matthew Knepley &lt;<a href="mailto:petsc-maint@mcs.anl.gov">petsc-maint@mcs.anl.gov</a>&gt; wrote:<br>&gt; &gt; On 9/4/07, amjad ali &lt;<a href="mailto:amjad11@gmail.com">amjad11@gmail.com
</a>&gt; wrote:<br>&gt; &gt; &gt; Hello Satish, hoping you will be fine and happy.<br>&gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; Is it necessary to have MPICH2 already installed (seaprately), before<br>&gt; &gt; &gt; installing/configuring PETSc.
<br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt; If this is Windows, yes it is necessary (if you want to run in<br>&gt; &gt; parallel). If not,<br>&gt; &gt; you can use --with-mpi=0.<br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; Do we need at all MPICH2 separately to wprk with PETSc or installing
<br>&gt; PETSc<br>&gt; &gt; &gt; will automatically have MPI implementation within that?<br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt; PETSc can automatically build MPI, but not on Windows unfortunately.<br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt;&nbsp;&nbsp; Thanks,<br>
&gt; &gt;<br>&gt; &gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;Matt<br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; regards,<br>&gt; &gt; &gt; Amjad Ali.<br>&gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; Also please answer my Yesterday&#39;s question:<br>&gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; What is your opinion about using PETSc for developing/running
<br>&gt; appliactions<br>&gt; &gt; &gt; on MS Windows (Compute Cluster server) based cluster?<br>&gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; Is it better/equal to Linux based system in performance?<br>&gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; regards,
<br>&gt; &gt; &gt; Amjad Ali.<br>&gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; On 8/21/07, amjad ali &lt;<a href="mailto:amjad11@gmail.com">amjad11@gmail.com</a>&gt; wrote:<br>&gt; &gt; &gt; &gt;<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; Hello Satish,<br>&gt; &gt; &gt; &gt; Thanks a lot for your kind answers. These are definitely helpful in<br>&gt; &gt; &gt; clearifying concepts.<br>&gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt; Regards,<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; Amjad Ali<br>&gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt; On 8/21/07, Satish Balay &lt;<a href="mailto:petsc-maint@mcs.anl.gov">petsc-maint@mcs.anl.gov</a> &gt; wrote:
<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; On Mon, 20 Aug 2007, amjad ali wrote:<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; Hello,<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; Thanks Balay for your kind reply.<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;
<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; As my system is:<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; Total cpu cores =4x4 = 16.&nbsp;&nbsp;And there are 2 memory banks per node,<br>&gt; so<br>&gt; &gt; &gt; total<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; = 8 memory banks for the complete cluster.
<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; Let me ask my question in a better way:<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; *Is this system is suffiently good (giving decent performance) to<br>&gt; RUN<br>
&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; my &quot;PETSc based Parallel CFD/FEM code&quot; on this system *?<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; it should be fine.<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; Can you please suggest any other *BETTER* PC-cluster for my PETSc
<br>&gt; &gt; &gt; code?<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; Inte Core Duos appear to have much higher mermory bandwidth - so<br>&gt; they<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; can potentially do better [this is unverified/speculation. Also the
<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; latencies are higher - so I&#39;m not sure if this hurts performance<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; much].<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; Also - we recommend doing the development on machines where its
<br>&gt; easy<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; to run debuggers [your desktop or laptop etc..] - and not a<br>&gt; parallel<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; machine - where such things are hard to do.<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt;
<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; How to install and use PETSc on desktop (single machine)? Is it<br>&gt; &gt; &gt; straight<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; &gt; forward?<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; Yes [assuming your desktop is linux] its straight forward. Just use
<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; the configure option --download-mpich=1. You&#39;ll be able to run<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; parallel codes on this machine [by default MPICH will use multiple<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; processes for the parallel run, and all these processes will run on
<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; your desktop].<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; When developing code - performance is not critical, so the above<br>&gt; model<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; will be more convinent than developing on a cluster.
<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt; Satish<br>&gt; &gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt; &gt;<br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt;<br>&gt; &gt; --<br>&gt; &gt; What most experimenters take for granted before they begin their
<br>&gt; &gt; experiments is infinitely more interesting than any results to which<br>&gt; &gt; their experiments lead.<br>&gt; &gt; -- Norbert Wiener<br>&gt; &gt;<br>&gt;<br>&gt;<br><br><br>--<br>What most experimenters take for granted before they begin their
<br>experiments is infinitely more interesting than any results to which<br>their experiments lead.<br>-- Norbert Wiener<br></blockquote></div><br>