<!DOCTYPE html>
<!-- BaNnErBlUrFlE-BoDy-start -->
<!-- Preheader Text : BEGIN -->
<div style="display:none !important;display:none;visibility:hidden;mso-hide:all;font-size:1px;color:#ffffff;line-height:1px;height:0px;max-height:0px;opacity:0;overflow:hidden;">
 hi again, On 1/03/24 3: 41 pm, Adrian Croucher wrote: > > I am still getting problems with redistribution of MINC (dual > porosity) meshes. The function DMPlexCheckPointSF() is now raising > errors like this: > > [0]PETSC ERROR: 
</div>
<!-- Preheader Text : END -->

<!-- Email Banner : BEGIN -->
<div style="display:none !important;display:none;visibility:hidden;mso-hide:all;font-size:1px;color:#ffffff;line-height:1px;height:0px;max-height:0px;opacity:0;overflow:hidden;">ZjQcmQRYFpfptBannerStart</div>

<!--[if ((ie)|(mso))]>
  <table border="0" cellspacing="0" cellpadding="0" width="100%" style="padding: 16px 0px 16px 0px; direction: ltr" ><tr><td>
    <table border="0" cellspacing="0" cellpadding="0" style="padding: 0px 10px 5px 6px; width: 100%; border-radius:4px; border-top:4px solid #90a4ae;background-color:#D0D8DC;"><tr><td valign="top">
      <table align="left" border="0" cellspacing="0" cellpadding="0" style="padding: 4px 8px 4px 8px">
        <tr><td style="color:#000000; font-family: 'Arial', sans-serif; font-weight:bold; font-size:14px; direction: ltr">
          This Message Is From an External Sender
        </td></tr>
        <tr><td style="color:#000000; font-weight:normal; font-family: 'Arial', sans-serif; font-size:12px; direction: ltr">
          This message came from outside your organization.
        </td></tr>

      </table>

    </td></tr></table>
  </td></tr></table>
<![endif]-->

<![if !((ie)|(mso))]>
  <div dir="ltr"  id="pfptBannerssiwvm7" style="all: revert !important; display:block !important; text-align: left !important; margin:16px 0px 16px 0px !important; padding:8px 16px 8px 16px !important; border-radius: 4px !important; min-width: 200px !important; background-color: #D0D8DC !important; background-color: #D0D8DC; border-top: 4px solid #90a4ae !important; border-top: 4px solid #90a4ae;">
    <div id="pfptBannerssiwvm7" style="all: unset !important; float:left !important; display:block !important; margin: 0px 0px 1px 0px !important; max-width: 600px !important;">
      <div id="pfptBannerssiwvm7" style="all: unset !important; display:block !important; visibility: visible !important; background-color: #D0D8DC !important; color:#000000 !important; color:#000000; font-family: 'Arial', sans-serif !important; font-family: 'Arial', sans-serif; font-weight:bold !important; font-weight:bold; font-size:14px !important; line-height:18px !important; line-height:18px">
        This Message Is From an External Sender
      </div>
      <div id="pfptBannerssiwvm7" style="all: unset !important; display:block !important; visibility: visible !important; background-color: #D0D8DC !important; color:#000000 !important; color:#000000; font-weight:normal; font-family: 'Arial', sans-serif !important; font-family: 'Arial', sans-serif; font-size:12px !important; line-height:18px !important; line-height:18px; margin-top:2px !important;">
This message came from outside your organization.
      </div>

    </div>

    <div style="clear: both !important; display: block !important; visibility: hidden !important; line-height: 0 !important; font-size: 0.01px !important; height: 0px"> </div>
  </div>
<![endif]>

<div style="display:none !important;display:none;visibility:hidden;mso-hide:all;font-size:1px;color:#ffffff;line-height:1px;height:0px;max-height:0px;opacity:0;overflow:hidden;">ZjQcmQRYFpfptBannerEnd</div>
<!-- Email Banner : END -->

<!-- BaNnErBlUrFlE-BoDy-end -->
<html>
<head><!-- BaNnErBlUrFlE-HeAdEr-start -->
<style>
  #pfptBannerssiwvm7 { all: revert !important; display: block !important; 
    visibility: visible !important; opacity: 1 !important; 
    background-color: #D0D8DC !important; 
    max-width: none !important; max-height: none !important }
  .pfptPrimaryButtonssiwvm7:hover, .pfptPrimaryButtonssiwvm7:focus {
    background-color: #b4c1c7 !important; }
  .pfptPrimaryButtonssiwvm7:active {
    background-color: #90a4ae !important; }
</style>

<!-- BaNnErBlUrFlE-HeAdEr-end -->
<meta charset="UTF-8"></head><body><pre style="font-family: sans-serif; font-size: 100%; white-space: pre-wrap; word-wrap: break-word">hi again,

On 1/03/24 3:41 pm, Adrian Croucher wrote:
>
> I am still getting problems with redistribution of MINC (dual 
> porosity) meshes. The function DMPlexCheckPointSF() is now raising 
> errors like this:
>
> [0]PETSC ERROR: Petsc has generated inconsistent data
> [0]PETSC ERROR: Point SF contains 25 which is a cell
>
> Looking in the PETSc code it appears some extra checks were added 
> about a year ago (commit 7726db96) including the bit commented "Check 
> there are no cells in interface", which is what is raising the error.
>
> My understanding of the point SF is a bit rusty now but I would have 
> thought that for finite volume meshes with overlap 1 (which is what I 
> have), there should be cells in the interface?
>
I just re-tested my code with this "no cells in the interface" check 
commented out of the PETSc code, and it appears to run fine. So I think 
I can confirm this check is causing the problem.

- Adrian

-- 
Dr Adrian Croucher
Senior Research Fellow
Department of Engineering Science
Waipapa Taumata Rau / University of Auckland, New Zealand
email: a.croucher@auckland.ac.nz
tel: +64 (0)9 923 4611

</pre></body></html>