<div dir="ltr">I am trying to run on Titan and I am having problems running the tests. I get this output. It says it can not find a directory, but I do an ls in after the error and you can see that it is there.<div><br></div><div>I've attached the logs.<br><div><br></div><div>Any ideas?</div><div>Thanks,</div><div>Mark<br><div><br></div><div><div>adams@titan-login6:~/petsc> make PETSC_DIR=/ccs/proj/env003/petscv3.9-opt64-pgi PETSC_ARCH="" test</div><div>Running test examples to verify correct installation</div><div>Using PETSC_DIR=/ccs/proj/env003/petscv3.9-opt64-pgi and PETSC_ARCH=</div><div>*******************Error detected during compile or link!*******************</div><div>See <a href="http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html">http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html</a></div><div>/ccs/home/adams/petsc/src/snes/examples/tutorials ex19</div><div>*********************************************************************************</div><div>cc -o ex19.o -c -fast -mp   -I/ccs/proj/env003/petscv3.9-opt64-pgi/include -I/ccs/proj/env003/petscv3.9-opt64-pgi/include -I/ccs/proj/env003/petscv3.9-opt64-pgi/include    `pwd`/ex19.c</div><div>cc -fast -mp  -o ex19  ex19.o -L/ccs/proj/env003/petscv3.9-opt64-pgi/lib -Wl,-rpath,/ccs/proj/env003/petscv3.9-opt64-pgi/lib -L/ccs/proj/env003/petscv3.9-opt64-pgi/lib -lpetsc -lHYPRE -lflapack -lfblas -lparmetis -lmetis -lstdc++ -ldl</div><div>/ccs/proj/env003/petscv3.9-opt64-pgi/lib/libpetsc.a(dlimpl.o): In function `PetscDLOpen':</div><div>/autofs/nccs-svm1_home1/adams/petsc/src/sys/dll/dlimpl.c:53: warning: Using 'dlopen' in statically linked applications requires at runtime the shared libraries from the glibc version used for linking</div><div>/ccs/proj/env003/petscv3.9-opt64-pgi/lib/libpetsc.a(send.o): In function `PetscOpenSocket':</div><div>/autofs/nccs-svm1_home1/adams/petsc/src/sys/classes/viewer/impls/socket/send.c:101: warning: Using 'gethostbyname' in statically linked applications requires at runtime the shared libraries from the glibc version used for linking</div><div>/bin/rm -f ex19.o</div><div>Possible error running C/C++ src/snes/examples/tutorials/ex19 with 1 MPI process</div><div>See <a href="http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html">http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html</a></div><div>[NID 18525] 2018-06-28 18:25:39 Exec ./ex19 failed: chdir /autofs/nccs-svm1_home1/adams/petsc/src/snes/examples/tutorials No such file or directory</div><div>Possible error running C/C++ src/snes/examples/tutorials/ex19 with 2 MPI processes</div><div>See <a href="http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html">http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html</a></div><div>[NID 18525] 2018-06-28 18:25:46 Exec ./ex19 failed: chdir /autofs/nccs-svm1_home1/adams/petsc/src/snes/examples/tutorials No such file or directory</div><div>1,5c1</div><div>< lid velocity = 0.0016, prandtl # = 1., grashof # = 1.</div><div><   0 SNES Function norm 0.0406612 </div><div><   1 SNES Function norm 4.12227e-06 </div><div><   2 SNES Function norm 6.098e-11 </div><div>< Number of SNES iterations = 2</div><div>---</div><div>> [NID 18525] 2018-06-28 18:25:55 Exec ./ex19 failed: chdir /autofs/nccs-svm1_home1/adams/petsc/src/snes/examples/tutorials No such file or directory</div><div>/ccs/home/adams/petsc/src/snes/examples/tutorials</div><div>Possible problem with ex19_hypre, diffs above</div><div>=========================================</div><div>*******************Error detected during compile or link!*******************</div><div>See <a href="http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html">http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html</a></div><div>/ccs/home/adams/petsc/src/snes/examples/tutorials ex5f</div><div>*********************************************************</div><div>ftn -c -fast  -mp   -I/ccs/proj/env003/petscv3.9-opt64-pgi/include -I/ccs/proj/env003/petscv3.9-opt64-pgi/include -I/ccs/proj/env003/petscv3.9-opt64-pgi/include    -o ex5f.o ex5f.F90</div><div>PGF90-S-0155-Could not resolve generic procedure dmdacreate2d (ex5f.F90: 120)</div><div>PGF90-S-0450-Argument number 2 to snesgetiterationnumber: kind mismatch (ex5f.F90: 180)</div><div>  0 inform,   0 warnings,   2 severes, 0 fatal for main</div><div>PGF90-S-0155-Could not resolve generic procedure matsetvalueslocal (ex5f.F90: 464)</div><div>PGF90-S-0155-Could not resolve generic procedure matsetvalueslocal (ex5f.F90: 477)</div><div>  0 inform,   0 warnings,   2 severes, 0 fatal for formjacobianlocal</div><div>gmake[3]: [ex5f.o] Error 2 (ignored)</div><div>ftn -fast  -mp  -o ex5f ex5f.o -L/ccs/proj/env003/petscv3.9-opt64-pgi/lib -Wl,-rpath,/ccs/proj/env003/petscv3.9-opt64-pgi/lib -L/ccs/proj/env003/petscv3.9-opt64-pgi/lib -lpetsc -lHYPRE -lflapack -lfblas -lparmetis -lmetis -lstdc++ -ldl</div><div>/usr/bin/ld: cannot find ex5f.o: No such file or directory</div><div>/usr/bin/sha1sum: ex5f: No such file or directory</div><div>gmake[3]: [ex5f] Error 2 (ignored)</div><div>/bin/rm -f ex5f.o</div><div>Completed test examples</div><div>adams@titan-login6:~/petsc> ll /autofs/nccs-svm1_home1/adams/petsc/src/snes/examples/tutorials</div><div>total 1864</div><div>-rw-rw-r-- 1 adams adams  11134 May  3 14:26 ex1.c</div><div>drwxr-xr-x 3 adams adams   4096 May  3 14:26 ex10d</div><div>-rw-rw-r-- 1 adams adams  92615 May  3 14:26 ex12.c</div><div>-rw-r--r-- 1 adams adams  19324 Jun 21 17:59 ex13.c</div><div>-rw-rw-r-- 1 adams adams  20550 May  3 14:26 ex14.c</div></div><div><br></div></div></div></div>