<div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote">On Thu, Nov 2, 2017 at 12:08 PM, Vaclav Hapla <span dir="ltr"><<a href="mailto:vaclav.hapla@erdw.ethz.ch" target="_blank">vaclav.hapla@erdw.ethz.ch</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">It seems that DMPlexCreateMedFromFile leaves out some mesh elements. I found it out when investigating why ParMetis redistribution crashes.<br>
<br>
I attach the datafile $PETSC_DIR/share/petsc/<wbr>datafiles/meshes/<wbr>blockcylinder-50.exo converted to GMSH and MED format.<br>
The conversion EXO to GMSH was done by meshio (<a href="http://github.com/nschloe/meshio" rel="noreferrer" target="_blank">github.com/nschloe/meshio</a>), and GMSH to MED by GMSH itself.<br>
<br>
I did:<br>
<br>
cd $PETSC_DIR/src/dm/impls/plex/<wbr>examples/tutorials<br>
make ex5<br>
FILE=blockcylinder-50.exo && ./ex5 -filename $FILE -dm_view hdf5:$FILE.h5 && $PETSC_DIR/bin/petsc_gen_xdmf.<wbr>py $FILE.h5<br>
FILE=blockcylinder-50.msh && ./ex5 -filename $FILE -dm_view hdf5:$FILE.h5 && $PETSC_DIR/bin/petsc_gen_xdmf.<wbr>py $FILE.h5<br>
FILE=blockcylinder-50.med && ./ex5 -filename $FILE -dm_view hdf5:$FILE.h5 && $PETSC_DIR/bin/petsc_gen_xdmf.<wbr>py $FILE.h5<br>
<br>
While the output from blockcylinder-50.exo and blockcylinder-50.msh looks OK, that from blockcylinder-50.med is corrupted.<br></blockquote><div><br></div><div>Hi Vaclav,</div><div><br></div><div>You are right that something is wrong. Its easy to verify that the number of cells and vertices is the same in all meshes. Look at the difference</div><div>in Plex outputs, it appears that some cells are not correctly oriented:</div><div><br></div><div>







<p class="gmail-p1">knepley/feature-adaptor-plex *$:/PETSc3/petsc/petsc-dev/src/dm/impls/plex/examples/tutorials/vaclav$ ../ex5 -filename ./inputs/blockcylinder-50.exo -dm_view ::ascii_info_detail > err1</p>
<p class="gmail-p1">knepley/feature-adaptor-plex *$:/PETSc3/petsc/petsc-dev/src/dm/impls/plex/examples/tutorials/vaclav$ ../ex5 -filename ./inputs/blockcylinder-50.msh -dm_view ::ascii_info_detail > err2</p>
<p class="gmail-p1">knepley/feature-adaptor-plex *$:/PETSc3/petsc/petsc-dev/src/dm/impls/plex/examples/tutorials/vaclav$ diff err1 err2</p>
<p class="gmail-p1">1c1</p>
<p class="gmail-p1">< DM Object: cubit(blockcylinder-50.exo): 02/04/2013: 17:50:28 1 MPI processes</p>
<p class="gmail-p1">---</p>
<p class="gmail-p1">> DM Object: 1 MPI processes</p>
<p class="gmail-p1">3c3</p>
<p class="gmail-p1">< Mesh 'cubit(blockcylinder-50.exo): 02/04/2013: 17:50:28':</p>
<p class="gmail-p1">---</p>
<p class="gmail-p1">> Mesh 'DM_0x84000000_0':</p>
<p class="gmail-p1"><span class="gmail-Apple-converted-space"> </span>1knepley/feature-adaptor-plex *$:/PETSc3/petsc/petsc-dev/src/dm/impls/plex/examples/tutorials/vaclav$ ../ex5 -filename ./inputs/blockcylinder-50.med -dm_view ::ascii_info_detail > err3</p>
<p class="gmail-p1">knepley/feature-adaptor-plex *$:/PETSc3/petsc/petsc-dev/src/dm/impls/plex/examples/tutorials/vaclav$ diff err1 err3</p>
<p class="gmail-p1">1c1</p>
<p class="gmail-p1">< DM Object: cubit(blockcylinder-50.exo): 02/04/2013: 17:50:28 1 MPI processes</p>
<p class="gmail-p1">---</p>
<p class="gmail-p1">> DM Object: 1 MPI processes</p>
<p class="gmail-p1">3c3</p>
<p class="gmail-p1">< Mesh 'cubit(blockcylinder-50.exo): 02/04/2013: 17:50:28':</p>
<p class="gmail-p1">---</p>
<p class="gmail-p1">> Mesh 'DM_0x84000000_0':</p>
<p class="gmail-p1">461,462d460</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 0 <---- 61 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 0 <---- 62 (0)</p>
<p class="gmail-p1">463a462,463</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 0 <---- 62 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 0 <---- 61 (0)</p>
<p class="gmail-p1">469,470d468</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 1 <---- 61 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 1 <---- 66 (0)</p>
<p class="gmail-p1">471a470,471</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 1 <---- 66 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 1 <---- 61 (0)</p>
<p class="gmail-p1">477,478d476</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 2 <---- 70 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 2 <---- 71 (0)</p>
<p class="gmail-p1">479a478,479</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 2 <---- 71 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 2 <---- 70 (0)</p>
<p class="gmail-p1">485,486d484</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 3 <---- 74 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 3 <---- 75 (0)</p>
<p class="gmail-p1">487a486,487</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 3 <---- 75 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 3 <---- 74 (0)</p>
<p class="gmail-p1">493,494d492</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 4 <---- 78 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 4 <---- 79 (0)</p>
<p class="gmail-p1">495a494,495</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 4 <---- 79 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 4 <---- 78 (0)</p>
<p class="gmail-p1">501,502d500</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 5 <---- 79 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 5 <---- 82 (0)</p>
<p class="gmail-p1">503a502,503</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 5 <---- 82 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 5 <---- 79 (0)</p>
<p class="gmail-p1">509,510d508</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 6 <---- 78 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 6 <---- 85 (0)</p>
<p class="gmail-p1">511a510,511</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 6 <---- 85 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 6 <---- 78 (0)</p>
<p class="gmail-p1">517,518d516</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 7 <---- 88 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 7 <---- 89 (0)</p>
<p class="gmail-p1">519a518,519</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 7 <---- 89 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 7 <---- 88 (0)</p>
<p class="gmail-p1">525,526d524</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 8 <---- 92 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 8 <---- 93 (0)</p>
<p class="gmail-p1">527a526,527</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 8 <---- 93 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 8 <---- 92 (0)</p>
<p class="gmail-p1">533,534d532</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 9 <---- 99 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 9 <---- 100 (0)</p>
<p class="gmail-p1">535a534,535</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 9 <---- 100 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 9 <---- 99 (0)</p>
<p class="gmail-p1">541,542d540</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 10 <---- 93 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 10 <---- 92 (0)</p>
<p class="gmail-p1">543a542,543</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 10 <---- 92 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 10 <---- 93 (0)</p>
<p class="gmail-p1">549,550d548</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 11 <---- 71 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 11 <---- 75 (0)</p>
<p class="gmail-p1">551a550,551</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 11 <---- 75 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 11 <---- 71 (0)</p>
<p class="gmail-p1">557,558d556</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 12 <---- 105 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 12 <---- 67 (0)</p>
<p class="gmail-p1">559a558,559</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 12 <---- 67 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 12 <---- 105 (0)</p>
<p class="gmail-p1">565,566d564</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 13 <---- 100 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 13 <---- 85 (0)</p>
<p class="gmail-p1">567a566,567</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 13 <---- 85 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 13 <---- 100 (0)</p>
<p class="gmail-p1">573,574d572</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 14 <---- 57 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 14 <---- 58 (0)</p>
<p class="gmail-p1">575a574,575</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 14 <---- 58 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 14 <---- 57 (0)</p>
<p class="gmail-p1">581,582d580</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 15 <---- 57 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 15 <---- 64 (0)</p>
<p class="gmail-p1">583a582,583</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 15 <---- 64 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 15 <---- 57 (0)</p>
<p class="gmail-p1">589,590d588</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 16 <---- 68 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 16 <---- 69 (0)</p>
<p class="gmail-p1">591a590,591</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 16 <---- 69 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 16 <---- 68 (0)</p>
<p class="gmail-p1">597,598d596</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 17 <---- 72 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 17 <---- 73 (0)</p>
<p class="gmail-p1">599a598,599</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 17 <---- 73 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 17 <---- 72 (0)</p>
<p class="gmail-p1">605,606d604</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 18 <---- 76 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 18 <---- 77 (0)</p>
<p class="gmail-p1">607a606,607</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 18 <---- 77 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 18 <---- 76 (0)</p>
<p class="gmail-p1">613,614d612</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 19 <---- 77 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 19 <---- 80 (0)</p>
<p class="gmail-p1">615a614,615</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 19 <---- 80 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 19 <---- 77 (0)</p>
<p class="gmail-p1">621,622d620</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 20 <---- 76 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 20 <---- 84 (0)</p>
<p class="gmail-p1">623a622,623</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 20 <---- 84 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 20 <---- 76 (0)</p>
<p class="gmail-p1">629,630d628</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 21 <---- 86 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 21 <---- 87 (0)</p>
<p class="gmail-p1">631a630,631</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 21 <---- 87 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 21 <---- 86 (0)</p>
<p class="gmail-p1">637,638d636</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 22 <---- 90 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 22 <---- 91 (0)</p>
<p class="gmail-p1">639a638,639</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 22 <---- 91 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 22 <---- 90 (0)</p>
<p class="gmail-p1">645,646d644</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 23 <---- 95 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 23 <---- 96 (0)</p>
<p class="gmail-p1">647a646,647</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 23 <---- 96 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 23 <---- 95 (0)</p>
<p class="gmail-p1">653,654d652</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 24 <---- 91 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 24 <---- 90 (0)</p>
<p class="gmail-p1">655a654,655</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 24 <---- 90 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 24 <---- 91 (0)</p>
<p class="gmail-p1">661,662d660</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 25 <---- 69 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 25 <---- 73 (0)</p>
<p class="gmail-p1">663a662,663</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 25 <---- 73 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 25 <---- 69 (0)</p>
<p class="gmail-p1">669,670d668</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 26 <---- 104 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 26 <---- 65 (0)</p>
<p class="gmail-p1">671a670,671</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 26 <---- 65 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 26 <---- 104 (0)</p>
<p class="gmail-p1">677,678d676</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 27 <---- 96 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 27 <---- 84 (0)</p>
<p class="gmail-p1">679a678,679</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 27 <---- 84 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 27 <---- 96 (0)</p>
<p class="gmail-p1">685,686d684</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 28 <---- 107 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 28 <---- 108 (0)</p>
<p class="gmail-p1">687a686,687</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 28 <---- 108 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 28 <---- 107 (0)</p>
<p class="gmail-p1">693,694d692</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 29 <---- 107 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 29 <---- 110 (0)</p>
<p class="gmail-p1">695a694,695</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 29 <---- 110 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 29 <---- 107 (0)</p>
<p class="gmail-p1">701,702d700</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 30 <---- 112 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 30 <---- 113 (0)</p>
<p class="gmail-p1">703a702,703</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 30 <---- 113 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 30 <---- 112 (0)</p>
<p class="gmail-p1">709,710d708</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 31 <---- 114 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 31 <---- 115 (0)</p>
<p class="gmail-p1">711a710,711</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 31 <---- 115 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 31 <---- 114 (0)</p>
<p class="gmail-p1">717,718d716</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 32 <---- 116 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 32 <---- 117 (0)</p>
<p class="gmail-p1">719a718,719</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 32 <---- 117 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 32 <---- 116 (0)</p>
<p class="gmail-p1">725,726d724</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 33 <---- 117 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 33 <---- 118 (0)</p>
<p class="gmail-p1">727a726,727</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 33 <---- 118 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 33 <---- 117 (0)</p>
<p class="gmail-p1">733,734d732</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 34 <---- 116 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 34 <---- 120 (0)</p>
<p class="gmail-p1">735a734,735</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 34 <---- 120 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 34 <---- 116 (0)</p>
<p class="gmail-p1">741,742d740</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 35 <---- 121 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 35 <---- 122 (0)</p>
<p class="gmail-p1">743a742,743</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 35 <---- 122 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 35 <---- 121 (0)</p>
<p class="gmail-p1">749,750d748</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 36 <---- 123 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 36 <---- 124 (0)</p>
<p class="gmail-p1">751a750,751</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 36 <---- 124 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 36 <---- 123 (0)</p>
<p class="gmail-p1">757,758d756</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 37 <---- 126 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 37 <---- 127 (0)</p>
<p class="gmail-p1">759a758,759</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 37 <---- 127 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 37 <---- 126 (0)</p>
<p class="gmail-p1">765,766d764</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 38 <---- 124 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 38 <---- 123 (0)</p>
<p class="gmail-p1">767a766,767</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 38 <---- 123 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 38 <---- 124 (0)</p>
<p class="gmail-p1">773,774d772</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 39 <---- 113 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 39 <---- 115 (0)</p>
<p class="gmail-p1">775a774,775</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 39 <---- 115 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 39 <---- 113 (0)</p>
<p class="gmail-p1">781,782d780</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 40 <---- 130 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 40 <---- 111 (0)</p>
<p class="gmail-p1">783a782,783</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 40 <---- 111 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 40 <---- 130 (0)</p>
<p class="gmail-p1">789,790d788</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 41 <---- 127 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 41 <---- 120 (0)</p>
<p class="gmail-p1">791a790,791</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 41 <---- 120 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 41 <---- 127 (0)</p>
<p class="gmail-p1">797,798d796</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 42 <---- 132 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 42 <---- 133 (0)</p>
<p class="gmail-p1">799a798,799</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 42 <---- 133 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 42 <---- 132 (0)</p>
<p class="gmail-p1">805,806d804</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 43 <---- 132 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 43 <---- 135 (0)</p>
<p class="gmail-p1">807a806,807</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 43 <---- 135 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 43 <---- 132 (0)</p>
<p class="gmail-p1">813,814d812</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 44 <---- 137 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 44 <---- 138 (0)</p>
<p class="gmail-p1">815a814,815</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 44 <---- 138 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 44 <---- 137 (0)</p>
<p class="gmail-p1">821,822d820</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 45 <---- 139 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 45 <---- 140 (0)</p>
<p class="gmail-p1">823a822,823</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 45 <---- 140 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 45 <---- 139 (0)</p>
<p class="gmail-p1">829,830d828</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 46 <---- 141 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 46 <---- 142 (0)</p>
<p class="gmail-p1">831a830,831</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 46 <---- 142 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 46 <---- 141 (0)</p>
<p class="gmail-p1">837,838d836</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 47 <---- 142 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 47 <---- 143 (0)</p>
<p class="gmail-p1">839a838,839</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 47 <---- 143 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 47 <---- 142 (0)</p>
<p class="gmail-p1">845,846d844</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 48 <---- 141 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 48 <---- 145 (0)</p>
<p class="gmail-p1">847a846,847</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 48 <---- 145 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 48 <---- 141 (0)</p>
<p class="gmail-p1">853,854d852</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 49 <---- 146 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 49 <---- 147 (0)</p>
<p class="gmail-p1">855a854,855</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 49 <---- 147 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 49 <---- 146 (0)</p>
<p class="gmail-p1">861,862d860</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 50 <---- 148 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 50 <---- 149 (0)</p>
<p class="gmail-p1">863a862,863</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 50 <---- 149 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 50 <---- 148 (0)</p>
<p class="gmail-p1">869,870d868</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 51 <---- 151 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 51 <---- 152 (0)</p>
<p class="gmail-p1">871a870,871</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 51 <---- 152 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 51 <---- 151 (0)</p>
<p class="gmail-p1">877,878d876</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 52 <---- 149 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 52 <---- 148 (0)</p>
<p class="gmail-p1">879a878,879</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 52 <---- 148 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 52 <---- 149 (0)</p>
<p class="gmail-p1">885,886d884</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 53 <---- 138 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 53 <---- 140 (0)</p>
<p class="gmail-p1">887a886,887</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 53 <---- 140 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 53 <---- 138 (0)</p>
<p class="gmail-p1">893,894d892</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 54 <---- 155 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 54 <---- 136 (0)</p>
<p class="gmail-p1">895a894,895</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 54 <---- 136 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 54 <---- 155 (0)</p>
<p class="gmail-p1">901,902d900</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 55 <---- 152 (0)</p>
<p class="gmail-p1">< [0]: 55 <---- 145 (0)</p>
<p class="gmail-p1">903a902,903</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 55 <---- 145 (0)</p>
<p class="gmail-p1">> [0]: 55 <---- 152 (0)</p>
<p class="gmail-p1"><span class="gmail-Apple-converted-space"> </span>1knepley/feature-adaptor-plex *$:/PETSc3/petsc/petsc-dev/src/dm/impls/plex/examples/tutorials/vaclav$<span class="gmail-Apple-converted-space"> </span></p><p class="gmail-p1">I think this is a bug in GMsh as it appears to give us MED cells with wrong orientations. Let me see about checking</p><p class="gmail-p1">and correcting the orientations.</p><p class="gmail-p1"><br></p><p class="gmail-p1">  Thanks,</p><p class="gmail-p1"><br></p><p class="gmail-p1">      Matt</p></div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
I also attach my HDF5/XDMF outputs and screenshots from ParaView.<br>
<span class="gmail-HOEnZb"><font color="#888888"><br>
Vaclav<br>
<br>
</font></span><br><br>
<br>
<br>
<br>
<br></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div>What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>-- Norbert Wiener</div><div><br></div><div><a href="http://www.caam.rice.edu/~mk51/" target="_blank">https://www.cse.buffalo.edu/~knepley/</a><br></div></div></div></div></div>
</div></div>