<div dir="ltr">Does this error arise at the first assembly of the matrix or in a successive assembly?<div><br><div>In the second case, I guess the issue is with HYPRE, or the way we are passing the preallocation to HYPRE routines.</div><div>For some reasons that I'm not aware of, reassembling an HypreParCSR matrix may have issues.</div><div>My knowledge of the HYPRE code is not so deep to tell you why.</div></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">2017-10-04 1:03 GMT+03:00 Kong, Fande <span dir="ltr"><<a href="mailto:fande.kong@inl.gov" target="_blank">fande.kong@inl.gov</a>></span>:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hi ALL,<div><br></div><div>There is a new Mat type: HYPRE in PETSc. I would like to try it out because it may save the memory if use a hypre preconditioner. When use a native PETSc type such as MPIAIJ, we need to keep an extra copy of Jacobian matrix usually for the hypre preconditioner. </div><div><br></div><div>I was wondering if or not Mat HYPRE is complete. There are some errors when I am tring to use it. The code works fine with MPIAIJ.</div><div><br></div><div><div><br></div><div>[0]PETSC ERROR: --------------------- Error Message ------------------------------<wbr>------------------------------<wbr>-- [0]PETSC ERROR: Error in external library [0]PETSC ERROR: Error in HYPRE_IJMatrixAddToValues(): error code 1 [0]PETSC ERROR: See <a href="http://www.mcs.anl.gov/petsc/documentation/faq.html" target="_blank">http://www.mcs.anl.gov/petsc/<wbr>documentation/faq.html</a> for trouble shooting. [0]PETSC ERROR: Petsc Development GIT revision: v3.8-2-gd4ad237  GIT Date: 2017-10-03 12:37:25 -0600 [0]PETSC ERROR: ../../../moose_test-opt on a arch-darwin-c-debug-master named FN604208 by kongf Tue Oct  3 15:54:15 2017 [0]PETSC ERROR: Configure options --with-debugging=yes --with-shared-libraries=1 --with-mpi=1 --download-fblaslapack=1 --download-metis=1 --download-parmetis=1 --download-superlu_dist=1 --download-hypre=1 --download-mumps=1 --download-scalapack=1 PETSC_ARCH=arch-darwin-c-<wbr>debug-master [0]PETSC ERROR: #1 MatSetValues_HYPRE() line 1014 in /Users/kongf/projects/petsc/<wbr>src/mat/impls/hypre/mhypre.c [0]PETSC ERROR: #2 MatSetValues() line 1270 in /Users/kongf/projects/petsc/<wbr>src/mat/interface/matrix.c application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 0 [unset]: write_line error; fd=-1 buf=:cmd=abort exitcode=1 : system msg for write_line failure : Bad file descriptor</div></div><span class="HOEnZb"><font color="#888888"><div><br></div><div><br></div><div>Fande,</div></font></span></div>
</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature">Stefano</div>
</div>