<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
<div class="">On cori, I tried to compile PETSc on a compute node in the interactive mode, but it did not work. What worked for me is to do the following: </div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">1. configure with --with-batch=1 to generate a binary</div>
<div class="">2. submit the binary to the queue: srun -n 1 -c 1 ./conftest-xxx</div>
<div class="">3. run the reconfigure-xxx script after the submitted job is done</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Hong (Mr.)</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div>
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On Feb 15, 2017, at 3:38 PM, Mark Adams <<a href="mailto:mfadams@lbl.gov" class="">mfadams@lbl.gov</a>> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div dir="ltr" class="">Oh, this is because git does not work on KNL. Maybe I should do with-batch=1,
<div class=""><br class="">
</div>
</div>
<div class="gmail_extra"><br class="">
<div class="gmail_quote">On Wed, Feb 15, 2017 at 4:36 PM, Mark Adams <span dir="ltr" class="">
<<a href="mailto:mfadams@lbl.gov" target="_blank" class="">mfadams@lbl.gov</a>></span> wrote:<br class="">
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div dir="ltr" class="">I get this error on the KNL partition at NERSC.  P4est works on the Haswell partition and other downloads seem to work on the KNL partition. Any ideas?</div>
</blockquote>
</div>
<br class="">
</div>
</div>
</blockquote>
</div>
<br class="">
</body>
</html>