<div dir="ltr">Hong, do you do this for KNL?  -C knl</div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Thu, Feb 16, 2017 at 6:29 PM, Mark Adams <span dir="ltr"><<a href="mailto:mfadams@lbl.gov" target="_blank">mfadams@lbl.gov</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><br><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote"><span class="">On Thu, Feb 16, 2017 at 4:49 PM, Zhang, Hong <span dir="ltr"><<a href="mailto:hongzhang@anl.gov" target="_blank">hongzhang@anl.gov</a>></span> wrote:<br></span><span class=""><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">



<div style="word-wrap:break-word">
<div>On cori, I tried to compile PETSc on a compute node in the interactive mode, but it did not work. What worked for me is to do the following: </div>
<div><br>
</div>
<div>1. configure with --with-batch=1 to generate a binary</div>
<div>2. submit the binary to the queue: srun -n 1 -c 1 ./conftest-xxx</div>
<div>3. run the reconfigure-xxx script after the submitted job is done</div></div></blockquote><div><br></div></span><div>Humm, I tried this, 1 and 3 on the login node and 2 on a compute node, and I seem to get the same error. And I nuked the arch directory before I started.</div><span class=""><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div style="word-wrap:break-word">
<div><br>
</div>
<div>Hong (Mr.)</div><div><div class="m_-8285640152705472798h5">
<div><br>
</div>
<div>
<blockquote type="cite">
<div>On Feb 15, 2017, at 3:38 PM, Mark Adams <<a href="mailto:mfadams@lbl.gov" target="_blank">mfadams@lbl.gov</a>> wrote:</div>
<br class="m_-8285640152705472798m_6281896235692616672Apple-interchange-newline">
<div>
<div dir="ltr">Oh, this is because git does not work on KNL. Maybe I should do with-batch=1,
<div><br>
</div>
</div>
<div class="gmail_extra"><br>
<div class="gmail_quote">On Wed, Feb 15, 2017 at 4:36 PM, Mark Adams <span dir="ltr">
<<a href="mailto:mfadams@lbl.gov" target="_blank">mfadams@lbl.gov</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div dir="ltr">I get this error on the KNL partition at NERSC.  P4est works on the Haswell partition and other downloads seem to work on the KNL partition. Any ideas?</div>
</blockquote>
</div>
<br>
</div>
</div>
</blockquote>
</div>
<br>
</div></div></div>

</blockquote></span></div><br></div></div>
</blockquote></div><br></div>