<div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote">On Fri, Feb 10, 2017 at 2:33 PM, Jeff Hammond <span dir="ltr"><<a href="mailto:jeff.science@gmail.com" target="_blank">jeff.science@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">See <a href="https://github.com/elemental/Elemental/issues/200" target="_blank">https://github.com/<wbr>elemental/Elemental/issues/200</a><wbr>.</div></blockquote><div><br></div><div>Excellent find Jeff.</div><div><br></div><div>  Matt</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div>Jeff</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Fri, Feb 10, 2017 at 12:05 PM, Barry Smith <span dir="ltr"><<a href="mailto:bsmith@mcs.anl.gov" target="_blank">bsmith@mcs.anl.gov</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><br>
  I am using MPICH 3.2 with 8.2.1 and typically run the entire PETSc test suite. Have not observed problems. Maybe upgrade Xcode first?<br>
<div class="m_4007655020802796645HOEnZb"><div class="m_4007655020802796645h5"><br>
<br>
> On Feb 10, 2017, at 1:59 PM, Brad Aagaard <<a href="mailto:baagaard@usgs.gov" target="_blank">baagaard@usgs.gov</a>> wrote:<br>
><br>
> Are there any known issues with mpich3.2 and clang (Apple LLVM 8.0.0, clang 800.0.42.1)? I am getting segfaults in MPI routines within PETSc.<br>
> The error is: write_line error; fd=-1 buf=:cmd=abort exitcode=59, which appears to be similar to the recent DMPlexCreateExodusFromFile() does not work on macOS Sierra thread<br>
> <a href="https://lists.mcs.anl.gov/mailman/htdig/petsc-users/2017-January/031463.html" rel="noreferrer" target="_blank">https://lists.mcs.anl.gov/mail<wbr>man/htdig/petsc-users/2017-<wbr>January/031463.html</a><br>
><br>
> However, I am not using any Darwin packaging system like homebrew. I am building PETSc via the PyLith installer which builds mpich, NetCDF, HDF5, etc from scratch using the Apple's clang. If I swap mpich3.2 for mpich3.1.3, these segfaults go away, so I am inclined to blame mpich3.2.<br>
><br>
> If this is a unknown or undiagnosed issue, I will try a standalone PETSc install to try to reproduce it.<br>
><br>
> Thanks,<br>
> Brad<br>
><br>
><br>
<br><span class="HOEnZb"><font color="#888888">
</font></span></div></div></blockquote></div><span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="m_4007655020802796645gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature">Jeff Hammond<br><a href="mailto:jeff.science@gmail.com" target="_blank">jeff.science@gmail.com</a><br><a href="http://jeffhammond.github.io/" target="_blank">http://jeffhammond.github.io/</a></div>
</font></span></div>
</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature">What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>-- Norbert Wiener</div>
</div></div>