Thanks for the details, we should have identified the issue earlier. When VecDot changed from using custom code to BLAS xDOT, the conjugation definition was accidentally changed. If you pull after this patch, TFQMR will work for your problem again.<div>
<br></div><div><a href="http://petsc.cs.iit.edu/petsc/petsc-dev/rev/8f37c498b7b4">http://petsc.cs.iit.edu/petsc/petsc-dev/rev/8f37c498b7b4</a><br><br><div class="gmail_quote">On Wed, Apr 11, 2012 at 00:38, Alexander Grayver <span dir="ltr"><<a href="mailto:agrayver@gfz-potsdam.de">agrayver@gfz-potsdam.de</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><u></u>

  
    
  
  <div bgcolor="#ffffff" text="#000000"><div class="im">
    On 10.04.2012 14:19, Jed Brown wrote:
    <blockquote type="cite">
      <div class="gmail_quote"><br>
        <div>There is no space allocated at (44,44); note that counting
          is 0-based. This consistency check has been in PETSc for many
          years, so I don't know why you didn't trip it in earlier runs.
          Do you have some options in PETSC_OPTIONS or .petscrc?</div>
      </div>
    </blockquote>
    <br></div>
    Jed, <br>
    <br>
    This is not possible:<br>
    <br>
    >> A = PetscBinaryRead('A.dat','complex',true);<br>
    >> find(diag(A)==0)<br>
    ans =<br>
       Empty matrix: 0-by-1<br>
    <br>
    >> A(45,45)<br>
    ans =   (1,1)        7.999999999999997e+002 +6.316546778308559e-009i<br>
    <br>
    Sorry, I forgot to mention that this is double complex matrix and
    vector. Have you read it as real double?<div class="im"><br>
    <br>
    <blockquote type="cite">
      <div class="gmail_quote">
        <div> </div>
        <blockquote class="gmail_quote" style="margin:0pt 0pt 0pt 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
          <br>
          If it is of any help files are here:<br>
          <a href="http://dl.dropbox.com/u/60982984/A.dat" target="_blank">http://dl.dropbox.com/u/60982984/A.dat</a><br>
          <a href="http://dl.dropbox.com/u/60982984/RHS.dat" target="_blank">http://dl.dropbox.com/u/60982984/RHS.dat</a><br>
          <br>
          Is this possible to look up changes in one file only?</blockquote>
        <div><br>
        </div>
        <div>$ hg log src/ksp/ksp/impls/tfqmr/</div>
        <div><br>
        </div>
        <div>But the problem was clearly not in that file.</div>
      </div>
    </blockquote>
    <br>
    <br>
    </div><span class="HOEnZb"><font color="#888888"><pre cols="72">-- 
Regards,
Alexander</pre>
  </font></span></div>

</blockquote></div><br></div>