<html><head></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">Hello Mark,<div><br></div><div>I do have this error on malloc if np>1.</div><div><br></div><div><div><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: medium; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: medium; "><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">Best regards,</div></span></span>
</div><div><br class="webkit-block-placeholder"></div><div>Rebecca</div>
<br><div><div>On Jan 26, 2012, at 6:24 PM, Mark F. Adams wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><br><div><div>On Jan 26, 2012, at 8:06 PM, Jed Brown wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><div class="gmail_quote">On Thu, Jan 26, 2012 at 19:00, Mark F. Adams <span dir="ltr"><<a href="mailto:mark.adams@columbia.edu">mark.adams@columbia.edu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0.8ex; border-left-width: 1px; border-left-color: rgb(204, 204, 204); border-left-style: solid; padding-left: 1ex; position: static; z-index: auto; ">
I'm guessing that PETSc recently changed and now filters out 0.0 in MatSetValues ... is this true?<br></blockquote><div><br></div><div>Did the option MAT_IGNORE_ZERO_ENTRIES get set somehow?</div></div>
</blockquote></div><br><div>No, I can't imagine how, but there are several moving parts here.  I'm not sure about this issue.</div><div><br></div><div>I did start getting an error on a malloc in MatSetValues - this is new right?</div></div></blockquote></div><br></div></body></html>