On Wed, Mar 24, 2010 at 5:04 PM, Barry Smith <span dir="ltr"><<a href="mailto:bsmith@mcs.anl.gov">bsmith@mcs.anl.gov</a>></span> wrote:<br><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">
<br>
  Sorry, I was so stunned when I saw that option I just automatically nuked it.<br>
<br>
  I have pushed 3.1 and dev with the option again.<br>
<br>
  Does your code support ghosted finite differences? With this option?</blockquote><div><br></div><div>I am cool with the nuking. It was not really being used. I can't even remember</div><div>exactly what I was working around. I would redo it if I get to this again.</div>
<div><br></div><div>   Matt </div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;"><font color="#888888"><br>
<br>
   Barry</font><div><div></div><div class="h5"><br>
<br>
On Mar 24, 2010, at 4:56 PM, Jed Brown wrote:<br>
<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
I know this was an absolutely horrendous API, but this patch completely<br>
removed the option which makes ex48 fail (and certainly some user code).<br>
Releaes-3.1 either needs to get a proper API for this, or the option<br>
needs to remain available.  DMMGFormFunctionGhost is currently<br>
unreachable.<br>
<br>
(I'll add some ex48 tests to get them run in the nightlies, I should<br>
have done this long ago.)<br>
<br>
Jed<br>
<br>
<br>
changeset:   15513:e8e19296a5dc<br>
parent:      15511:2cefbdbb44a8<br>
user:        Barry Smith <a href="mailto:bsmith@mcs.anl.gov" target="_blank">bsmith@mcs.anl.gov</a><br>
date:        Wed Mar 24 16:39:07 2010 -0500<br>
files:       src/snes/utils/damg.c src/snes/utils/damgsnes.c<br>
description:<br>
fixed bug in DMMGCreate() that it ALWAYS used ghosted coloring even when it would not work.<br>
<br>
<br>
diff --git a/src/snes/utils/damg.c b/src/snes/utils/damg.c<br>
--- a/src/snes/utils/damg.c<br>
+++ b/src/snes/utils/damg.c<br>
@@ -65,7 +65,7 @@<br>
    p[i]->user     = user;<br>
    p[i]->updatejacobianperiod = 1;<br>
    p[i]->updatejacobian       = PETSC_TRUE;<br>
-    p[i]->isctype  = IS_COLORING_GHOSTED;   /* default to faster version, requires DMMGSetSNESLocal() */<br>
+    p[i]->isctype  = IS_COLORING_GLOBAL;<br>
    ierr           = PetscStrallocpy(MATAIJ,&p[i]->mtype);CHKERRQ(ierr);<br>
  }<br>
  *dmmg = p;<br>
diff --git a/src/snes/utils/damgsnes.c b/src/snes/utils/damgsnes.c<br>
--- a/src/snes/utils/damgsnes.c<br>
+++ b/src/snes/utils/damgsnes.c<br>
@@ -942,16 +942,9 @@<br>
  CHKMEMQ;<br>
  ierr = PetscObjectGetCookie((PetscObject) dmmg[0]->dm,&cookie);CHKERRQ(ierr);<br>
  if (cookie == DM_COOKIE) {<br>
-    PetscTruth flag = PETSC_FALSE;<br>
-    /* it makes no sense to use an option to decide on ghost, it depends on whether the<br>
-       formfunctionlocal computes ghost values in F or not. */<br>
-    ierr = PetscOptionsGetTruth(PETSC_NULL, "-dmmg_form_function_ghost", &flag,PETSC_NULL);CHKERRQ(ierr);<br>
-    if (flag) {<br>
-      ierr = DMMGSetSNES(dmmg,DMMGFormFunctionGhost,computejacobian);CHKERRQ(ierr);<br>
-    } else {<br>
-      ierr = DMMGSetSNES(dmmg,DMMGFormFunction,computejacobian);CHKERRQ(ierr);<br>
-    }<br>
+    ierr = DMMGSetSNES(dmmg,DMMGFormFunction,computejacobian);CHKERRQ(ierr);<br>
    for (i=0; i<nlevels; i++) {<br>
+      dmmg[i]->isctype  = IS_COLORING_GHOSTED;   /* switch to faster version since have local function evaluation */<br>
      ierr = DASetLocalFunction((DA)dmmg[i]->dm,function);CHKERRQ(ierr);<br>
      dmmg[i]->lfj = (PetscErrorCode (*)(void))function;<br>
      ierr = DASetLocalJacobian((DA)dmmg[i]->dm,jacobian);CHKERRQ(ierr);<br>
</blockquote>
<br>
</div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>What most experimenters take for granted before they begin their experiments is infinitely more interesting than any results to which their experiments lead.<br>
-- Norbert Wiener<br>