<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:comic sans ms,sans-serif;color:#38761d">We are having a lot of problems with darshan on our system - I'm working with the darshan developers to resolve.</div><div class="gmail_default" style="font-family:comic sans ms,sans-serif;color:#38761d"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:comic sans ms,sans-serif;color:#38761d">I am setting MPIIO hints - but I see that there are some hints specific to pnetcdf - do you have any recommendations?<br></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Thu, Aug 10, 2023 at 10:15 AM Wei-Keng Liao <<a href="mailto:wkliao@northwestern.edu">wkliao@northwestern.edu</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">



<div>
Hi, Jim
<div><br>
</div>
<div>FYI. Darshan now can capture the I/O activities of PnetCDF,</div>
<div>in addition to the already MPI-IO and POSIX-IO.</div>
<div><br>
<div>Wei-keng </div>
<div><br>
<blockquote type="cite">
<div>On Aug 9, 2023, at 6:22 PM, Wei-Keng Liao <<a href="mailto:wkliao@northwestern.edu" target="_blank">wkliao@northwestern.edu</a>> wrote:</div>
<br>
<div>
<div>
In that case, I have the E3SM-IO benchmark that has a fairly complicate I/O
<div>partitioning pattern. It used the decomposition maps generated from PIO.</div>
<div><a href="https://urldefense.com/v3/__https://github.com/Parallel-NetCDF/E3SM-IO__;!!Dq0X2DkFhyF93HkjWTBQKhk!UJAnknjDPQWY43szbAutlokjDrSHyBOcTlhEOChqYtThxnr812hxwvb8aSmHcEPiNOxNdOUHZi9Z2fyXbg2j6JH1HTo$" target="_blank">https://github.com/Parallel-NetCDF/E3SM-IO</a><br>
<div><br>
<div>Wei-keng </div>
<div><br>
<blockquote type="cite">
<div>On Aug 9, 2023, at 6:17 PM, Jim Edwards <<a href="mailto:jedwards@ucar.edu" target="_blank">jedwards@ucar.edu</a>> wrote:</div>
<br>
<div>
<div dir="ltr">
<div class="gmail_default" style="font-family:comic sans ms,sans-serif;color:rgb(56,118,29)">
I think that your example case is too simple - it's doing a simple block decomposition.</div>
<div class="gmail_default" style="font-family:comic sans ms,sans-serif;color:rgb(56,118,29)">
In order to get the performance difference I am observing I need to do a more complicated</div>
<div class="gmail_default" style="font-family:comic sans ms,sans-serif;color:rgb(56,118,29)">
mapping.   I will work on a program that reproduces the problem without pio but it may take a
<br>
</div>
<div class="gmail_default" style="font-family:comic sans ms,sans-serif;color:rgb(56,118,29)">
while.  <br>
</div>
</div>
<br>
</div>
</blockquote>
</div>
<br>
</div>
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
</div>
<br>
</div>
</div>

</blockquote></div><br clear="all"><br><span class="gmail_signature_prefix">-- </span><br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div><div>Jim Edwards<br><br></div><font size="1">CESM Software Engineer<br></font></div><font size="1">National Center for Atmospheric Research<br></font></div><font size="1">Boulder, CO</font> <br></div></div>