<div dir="auto">Dear Jim,</div><div dir="auto"><br></div><div dir="auto">Good morning. It will really help. Is it possible to receive them?</div><div dir="auto"><br></div><div dir="auto">Thank you.</div><div dir="auto"><br></div><div dir="auto">Best regards,</div><div dir="auto"><br></div><div dir="auto">Alvin</div><div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Tue, Jan 25, 2022 at 7:22 Jim Edwards <<a href="mailto:jedwards@ucar.edu">jedwards@ucar.edu</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-style:solid;padding-left:1ex;border-left-color:rgb(204,204,204)"><div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:"comic sans ms",sans-serif;color:rgb(56,118,29)">Hi Alvin,</div><div class="gmail_default" style="font-family:"comic sans ms",sans-serif;color:rgb(56,118,29)"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:"comic sans ms",sans-serif;color:rgb(56,118,29)">I don't know if this will help but we use pnetcdf with mpt regularly without a problem.   I can send you build details if you like.<br></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Mon, Jan 24, 2022 at 3:07 PM Alvin Christopher Galang Varquez <<a href="mailto:varquez.a.aa@m.titech.ac.jp" target="_blank">varquez.a.aa@m.titech.ac.jp</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-style:solid;padding-left:1ex;border-left-color:rgb(204,204,204)"><div dir="ltr">Greetings,<div><br></div><div>I have been using intel-mpi with PnetCDF and would like to explore compiling it using SGI MPT.</div><div>When I run the make check and ptest in batch queue system, I got the following error in the src/utils/ncvalidator/test-suite.log :</div><div><br></div><div>===</div><div>==========================================================<br>   PnetCDF 1.12.2: src/utils/ncvalidator/test-suite.log<br>==========================================================<br><br># TOTAL: 2<br># PASS:  0<br># SKIP:  0<br># XFAIL: 1<br># FAIL:  1<br># XPASS: 0<br># ERROR: 0<br><br>.. contents:: :depth: 2<br><br>XFAIL: xfail_runs.sh<br>====================<br><br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>MPT ERROR: Failed to execute ./ncvalidator on host r1i5n3 (errno:2)<br>XFAIL xfail_runs.sh (exit status: 1)<br><br>FAIL: wrap_runs.sh<br>==================<br><br>MPT ERROR: Failed to execute ./tst_open on host r1i5n3 (errno:2)<br>FAIL wrap_runs.sh (exit status: 1)<br></div><div>===</div><div><br></div><div>Compilation settings:</div><div>===</div><div>module load cuda intel mpt cmake<br>export MPICC=mpicc <br>export MPIF77=mpif90<br>export MPIF90=mpif90<br>export MPICXX=mpicxx<br>export CFLAGS='-O3 -xHost -ip -no-prec-div -static-intel'<br>export CXXFLAGS='-O3 -xHost -ip -no-prec-div -static-intel'<br>export FFLAGS='-O3 -xHost -ip -no-prec-div -static-intel'<br>export FC=mpif90<br>export FF=mpif90<br>export CXX=mpicxx<br>export F77=mpif90<br>export F90=mpif90<br>export CC=mpicc</div><div>===</div><div><br></div><div>./configure --prefix=(full path)/pnetcdf-1.12.2 --enable-fortran --enable-large-file-test LIBS=-lmpi</div><div><br></div><div>The relevant error in the make check is,</div><div>===</div><div>make[5]: Entering directory '(full path)/pnetcdf-1.12.2/src/utils/ncvalidator'<br>XFAIL: xfail_runs.sh<br>FAIL: wrap_runs.sh<br>============================================================================<br>Testsuite summary for PnetCDF 1.12.2<br>============================================================================<br># TOTAL: 2<br># PASS:  0<br># SKIP:  0<br># XFAIL: 1<br># FAIL:  1<br># XPASS: 0<br># ERROR: 0<br>============================================================================<br>See src/utils/ncvalidator/test-suite.log<br>Please report to <a href="mailto:parallel-netcdf@mcs.anl.gov" target="_blank">parallel-netcdf@mcs.anl.gov</a><br>============================================================================<br>Makefile:950: recipe for target 'test-suite.log' failed<br></div><div>===</div><div><br></div><div>Thank you for your time.</div><div><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div><span style="font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif;font-size:small"><font style="font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif;color:rgb(0,0,0)"><br></font></span></div><div><span style="font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif;font-size:small"><font style="font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif;color:rgb(0,0,0)">Best regards,</font></span></div><div><span style="font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif;font-size:small"><font style="font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif;color:rgb(0,0,0)"><br></font></span></div><div><span style="font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif;font-size:small"><font style="font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif;color:rgb(0,0,0)">Alvin</font></span></div><div dir="ltr"><span style="font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif;font-size:small"><font style="font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif;color:rgb(153,153,153)"><br></font></span></div><div dir="ltr"><span style="font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif;font-size:small"><font style="font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif;color:rgb(153,153,153)">Varquez, Alvin Christopher Galang</font></span></div><div dir="ltr"><span style="font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif;font-size:small"><font style="font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif;color:rgb(153,153,153)">Associate Professor</font></span></div><div dir="ltr"><font face="HelveticaNeue-Light, Helvetica Neue Light, Helvetica Neue, Helvetica, Arial, Lucida Grande, sans-serif" style="font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif;color:rgb(153,153,153)">Department of Transdisciplinary Science and Engineering</font></div><div dir="ltr"><font face="HelveticaNeue-Light, Helvetica Neue Light, Helvetica Neue, Helvetica, Arial, Lucida Grande, sans-serif" style="font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif;color:rgb(153,153,153)">Global Scientists and Engineers Program<br></font><div><span style="font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif;font-size:small"><font style="font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif;color:rgb(153,153,153)">Tokyo Institute of Technology</font></span><div style="font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif;font-size:13px"><span style="font-size:small;font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif"><font style="font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif;color:rgb(153,153,153)"><br></font></span></div><div style="font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif;font-size:13px"><span style="font-size:small;font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif"><font style="font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif;color:rgb(153,153,153)">Ishikawadai Building 4 Rm. 403 (mailbox: I4-9)</font></span></div><div style="font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif;font-size:13px"><font style="font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif;color:rgb(153,153,153)"><span style="font-size:small;font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif"><a href="https://www.google.com/maps/search/2-12-1+Ookayama,+Meguro-ku,%C2%A0+Tokyo+152-8552,+Japan?entry=gmail&source=g" style="font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif">2-12-1 Ookayama, Meguro-ku, </a></span><span style="font-size:small;font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif"><a href="https://www.google.com/maps/search/2-12-1+Ookayama,+Meguro-ku,%C2%A0+Tokyo+152-8552,+Japan?entry=gmail&source=g" style="font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif">Tokyo 152-8552, Japan</a></span></font></div><div style="font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif;font-size:13px"><span style="font-size:small;font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif"><font style="font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif;color:rgb(153,153,153)">Tel/Fax: +81-3 5734-2462 or 2768 (local: 2462 or 2768)<br>E-mail: <a rel="nofollow" href="mailto:varquez.a.aa@m.titech.ac.jp" style="margin:0px;padding:0px;outline:currentcolor none medium;background-image:none;font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif;background-color:transparent;background-position:0% 0%;background-repeat:repeat repeat" target="_blank">varquez.a.aa@m.titech.ac.jp</a></font></span></div><div><font style="color:rgb(153,153,153)"><span style="font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif;font-size:small">Web: </span><font size="2" face="HelveticaNeue-Light, Helvetica Neue Light, Helvetica Neue, Helvetica, Arial, Lucida Grande, sans-serif" style="font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif;color:rgb(153,153,153)"><u style="font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif"><a href="http://educ.titech.ac.jp/tse/eng/faculty/" target="_blank" style="font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif">http://educ.titech.ac.jp/tse/eng/faculty/</a></u></font></font></div></div><div><div style="font-size:medium;border-style:none none solid;border-width:medium medium 1pt;padding:0cm 0cm 1pt;border-color:currentcolor currentcolor windowtext;color:rgb(0,0,0)"><p class="MsoNormal" style="margin:0cm 0cm 0.0001pt;font-size:12pt;font-family:Calibri,sans-serif;border:medium none;padding:0cm"> </p></div></div><div><font size="2" face="HelveticaNeue-Light, Helvetica Neue Light, Helvetica Neue, Helvetica, Arial, Lucida Grande, sans-serif" style="font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif;color:rgb(0,0,0)"><font style="font-family:HelveticaNeue-Light,"Helvetica Neue Light","Helvetica Neue",Helvetica,Arial,"Lucida Grande",sans-serif;color:rgb(68,68,68)">The content of this email is confidential and intended for the recipient specified in the message only. It is strictly forbidden to share any part of this message with any third party, without a written consent of the sender. If you received this message by mistake, please reply to this message and follow with its deletion, so that we can ensure such a mistake does not occur in the future.</font><br></font></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
</blockquote></div><br clear="all"><br>-- <br><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div><div><div>Jim Edwards<br><br></div><font size="1" style="color:rgb(0,0,0)">CESM Software Engineer<br></font></div><font size="1" style="color:rgb(0,0,0)">National Center for Atmospheric Research<br></font></div><font size="1" style="color:rgb(0,0,0)">Boulder, CO</font> <br></div></div>
</blockquote></div></div>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature">Varquez, Alvin Christopher Galang<br>Associate Professor<br>Department of Transdisciplinary Science and Engineering<br>Tokyo Institute of Technology<br><br>Ishikawadai Building 6 Rm. 207 (mailbox: I6-31)<br>2-12-1 Ookayama, Meguro-ku, Tokyo 152-8552, Japan<br>Tel/Fax: +81-3 5734-2462 (local: 2462)<br>E-mail: <a href="mailto:varquez.a.aa@m.titech.ac.jp">varquez.a.aa@m.titech.ac.jp</a><br>Web: <a href="http://educ.titech.ac.jp/tse/eng/faculty/">http://educ.titech.ac.jp/tse/eng/faculty/</a></div>