<div dir="rtl"><div dir="rtl"><div dir="rtl"><div dir="ltr"><div dir="ltr">Hi again,</div><div dir="ltr">Sorry, I didn't say that, the version of openmpi is 3.0.2 and pnetcdf is 1.10.0. The installation was successfully completed but the include directory is not completed. The config.log files of openmpi and pnetcdf are attached.</div><div dir="ltr">the commands of install pnetcdf:</div><div dir="ltr"><div dir="ltr">export FC=/usr/bin/gfortran</div><div dir="ltr">export F90=/usr/bin/gfortran</div><div dir="ltr">export F77=/usr/bin/gfortran</div><div dir="ltr">export CC=/usr/bin/gcc</div><div dir="ltr">export CXX=/usr/bin/g++</div><div dir="ltr">export MPICC=/home/dream/CHIMERE/chimere_lib/openmpi/bin/mpicc</div><div dir="ltr">export MPICXX=/home/dream/CHIMERE/chimere_lib/openmpi/bin/mpicxx</div><div dir="ltr">export MPIF77=/home/dream/CHIMERE/chimere_lib/openmpi/bin/mpif77</div><div dir="ltr">export MPIF90=/home/dream/CHIMERE/chimere_lib/openmpi/bin/mpif90</div><div dir="ltr">export CFLAGS='-O -m64 -mcmodel=medium'</div><div dir="ltr">export CXXFLAGS='-O -m64 -mcmodel=medium'</div><div dir="ltr">export FFLAGS='-O -g -m64 -fno-second-underscore -mcmodel=medium'</div><div dir="ltr">export FCLAGS='-O -g -m64 -fno-second-underscore -mcmodel=medium'</div><div dir="ltr">export LDFLAGS='-O -g -m64 -fno-second-underscore -mcmodel=medium'</div><div dir="ltr">./configure --prefix=/home/dream/CHIMERE/chimere_lib/pnetcdf --disable-in-place-swap --enable-large-req --with-mpi=/home/dream/CHIMERE/chimere_lib/openmpi<br></div><div>make</div><div>make tests</div><div>make check</div><div>make ptest</div><div>make ptests</div><div>make install</div><div><br></div><div>Thank you in advance.</div><div>Best regards,</div><div>Zeinab</div></div></div></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="rtl">‫في السبت، 22 سبتمبر 2018 في 12:03 م تمت كتابة ما يلي بواسطة ‪Zeinab Salah‬‏ <‪<a href="mailto:zeinabsalah@gmail.com" target="_blank">zeinabsalah@gmail.com</a>‬‏>:‬<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="rtl"><div dir="rtl"><div dir="ltr"><div>Hello, </div><div>I want to install pnetcdf with openmpi with -fdefault-integer-8,  but I found the problem of offset, and it installed without error, some files in include directory are missing<br></div><div>my machine is little endian, and operating system is Fedora, and I changed many versions of openmpi  and pnetcdf, and give me the same error.</div><div>the commands used to install openmpi:</div><div dir="ltr">export F77=gfortran<br></div><div dir="ltr">export FC=gfortran</div><div dir="ltr">export CC=gcc</div><div dir="ltr">export CXX=g++</div><div dir="ltr">export CFLAGS=-m64</div><div dir="ltr">export CXXFLAGS=-m64</div><div dir="ltr"><div dir="ltr">export FFLAGS="-m64 -fdefault-integer-8"</div><div dir="ltr">export FCFLAGS="-m64 -fdefault-integer-8"</div></div><div dir="ltr">./configure --prefix=$HOME/openmpi --with-mpi-f90-size=medium</div><div dir="ltr">make all</div><div dir="ltr">make install</div><div>Thank you in advance,</div><div>Best regards</div><div>Zeinab<br></div><div><br></div></div></div></div>
</blockquote></div></div>