<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:comic sans ms,sans-serif;color:#38761d">It's a cice configuration of the full cesm model, I have not been able to reduce the problem.</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Thu, Oct 26, 2017 at 8:17 PM, Wei-keng Liao <span dir="ltr"><<a href="mailto:wkliao@eecs.northwestern.edu" target="_blank">wkliao@eecs.northwestern.edu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi, Jim<br>
<br>
What is the test program?<br>
<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br>
Wei-keng<br>
</font></span><div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
On Oct 26, 2017, at 8:29 PM, Jim Edwards wrote:<br>
<br>
> I've run out of ideas on how to debug this, hope you can help.<br>
><br>
> I have a job that crashes at line 1000 in nonblocking.c of pnetcdf version 1.8.1<br>
><br>
> I started out managing my own requests but then switched to letting pnetcdf handle them internally, but it still crashes in the same spot.<br>
><br>
> I'm using intel 17.0.1 and mpt (sgi) 2.16<br>
><br>
> Here is a partial trace:<br>
><br>
> 73:MPT: #7  0x0000000001e77732 in ncmpii_del_mem_entry (buf=0x1ad4cc70) at malloc.c:174<br>
><br>
> 73:MPT: #8  0x0000000001e77a90 in NCI_Free_fn (ptr=0x1ad4cc70, lineno=1000,<br>
><br>
> 73:MPT:     func=0x23cda56 <__$U8> 'ncmpii_wait\000',<br>
><br>
> 73:MPT:     filename=0x23cd964 'nonblocking.c\000') at malloc.c:276<br>
><br>
> 73:MPT: #9  0x0000000001e70f6d in ncmpii_wait (ncp=0x1a97dbb0, io_method=1,<br>
><br>
> 73:MPT:     num_reqs=-1, req_ids=0x0, statuses=0x0) at nonblocking.c:1000<br>
><br>
> 73:MPT: #10 0x0000000001e6f10a in ncmpi_wait_all (ncid=7, num_reqs=-1, req_ids=0x0,<br>
><br>
> 73:MPT:     statuses=0x0) at nonblocking.c:494<br>
><br>
><br>
> --<br>
> Jim Edwards<br>
><br>
> CESM Software Engineer<br>
> National Center for Atmospheric Research<br>
> Boulder, CO<br>
<br>
</div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div><div>Jim Edwards<br><br></div><font size="1">CESM Software Engineer<br></font></div><font size="1">National Center for Atmospheric Research<br></font></div><font size="1">Boulder, CO</font> <br></div></div>
</div>