<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif">Dear All,</div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif">I am trying to compile parallel-netcdf-1.6.1 on a linux cluster. I have a preinstalled Intel MPI library and thus I have intel compilers wrapped as mpiicc, mpiicpc and mpiifort in the directory /opt/intel/impi/<a href="http://4.1.0.024/intel64/bin-">4.1.0.024/intel64/bin-</a></div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif">I have successfully installed the HDF5 library using the above compilers and I wish to build the netcdf-4.3.3.1 with parallel support. Before doing that as I came to know that I need to install the pnetcdf library so tried I with the following configure options-</div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif"><br></div><div class="gmail_default"><font face="georgia, serif">./configure CC=mpiicc CXX=mpiicpc FC=mpiifort --prefix=/export/home/dkumar/RLIB CPPFLAGS=-I/export/home/dkumar/RLIB/include LDFLAGS=-L/export/home/dkumar/RLIB/lib</font><br></div><div class="gmail_default"><font face="georgia, serif"><br></font></div><div class="gmail_default"><font face="georgia, serif">and I am getting the following error:</font></div><div class="gmail_default"><font face="georgia, serif"><div class="gmail_default" style="color:rgb(111,168,220)">checking for mpicc... /opt/intel/impi/<a href="http://4.1.0.024/intel64/bin/mpicc">4.1.0.024/intel64/bin/mpicc</a></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(111,168,220)">checking for gcc... /opt/intel/impi/<a href="http://4.1.0.024/intel64/bin/mpicc">4.1.0.024/intel64/bin/mpicc</a></div><div class="gmail_default" style="color:rgb(111,168,220)">checking whether the C compiler works... no</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(111,168,220)">configure: error: in `/home/dkumar/RLIB/parallel-netcdf-1.6.1':</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(111,168,220)">configure: error: C compiler cannot create executables</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(111,168,220)">See `config.log' for more details</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(111,168,220)">configure: WARNING: cache variable ac_cv_env_FCFLAGS_value contains a newline</div><div class="gmail_default" style="color:rgb(111,168,220)"><br></div><div class="gmail_default"><font color="#000000">I am not able to figure out what went wrong, but I think the configure script could not identify the mpicc (i.e. mpiicc is not being used for compiling).</font></div><div class="gmail_default"><font color="#000000"><br></font></div><div class="gmail_default"><font color="#000000">Any help would be appreciated. I am attaching the config.log file for the reference.</font></div><div class="gmail_default"><font color="#000000"><br></font></div><div class="gmail_default"><font color="#000000">Regards</font></div><div class="gmail_default"><font color="#000000">Dhirendra Kumar</font></div></font></div><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr">========================================</div><div dir="ltr">Dhirendra Kumar<div>UGC-JRF <br></div><div>School of Environmental Sciences, JNU<br></div><div>New Delhi (India)</div><div>Contact: <font face="comic sans ms, sans-serif">+91 9910778043</font></div><div>Alternate email: <a href="mailto:dhirendra.cub@outlook.com" target="_blank">dhirendra.cub@outlook.com</a></div><div>=========================================</div></div></div></div></div></div></div></div></div>
</div>