<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:comic sans ms,sans-serif;color:#38761d">I think that you are correct I switched to pgi and got the same error -  I can try on another platform.</div><div class="gmail_default" style="font-family:comic sans ms,sans-serif;color:#38761d"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:comic sans ms,sans-serif;color:#38761d">The pgi config.log is attached...</div><div class="gmail_default" style="font-family:comic sans ms,sans-serif;color:#38761d"><br></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Mon, Jul 20, 2015 at 12:48 PM, Wei-keng Liao <span dir="ltr"><<a href="mailto:wkliao@eecs.northwestern.edu" target="_blank">wkliao@eecs.northwestern.edu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi, Jim<br>
<br>
I suspect it is caused by an old MPI.<br>
Can you send me your config.log file?<br>
<br>
Wei-keng<br>
<span class=""><br>
On Jul 20, 2015, at 12:36 PM, Jim Edwards wrote:<br>
<br>
> I am getting an error when trying to build with gnu/5.1.0<br>
> ​the traceback looks like:<br>
> #6  0x00000000014fb478 in ncmpii_in_swapn ()<br>
> #7  0x00000000014cd6be in ncmpii_getput_vars ()<br>
> #8  0x00000000014d9b64 in ncmpi_put_vara_int_all ()<br>
> #9  0x00000000014baf57 in nfmpi_put_vara_int_all_ ()<br>
> #10 0x00000000013f61e2 in __pionfput_mod_MOD_put_vara_1d_int ()<br>
><br>
> If I try to run the tests with this build I get a hang in the sequentiol tests:<br>
> poe  ./nc_test -v -d       .<br>
><br>
>    2:*** Testing test_ncmpi_strerror            ...   33 good comparisons. ok<br>
><br>
>    0:*** Testing test_ncmpi_strerror            ...   33 good comparisons. ok<br>
><br>
>    1:*** Testing test_ncmpi_strerror            ...   33 good comparisons. ok<br>
><br>
>    3:*** Testing test_ncmpi_strerror            ...   33 good comparisons. ok<br>
><br>
>    0:<br>
><br>
>    1:<br>
><br>
>    2:<br>
><br>
</span>>    2: FAILURE at line 149 of test_read.c: remove of ./<a href="http://scratch.nc" rel="noreferrer" target="_blank">scratch.nc</a> failed*** Testing test_ncmpi_open                ...<br>
<span class="">><br>
>    2: ### 1 FAILURES TESTING test_ncmpi_open! Stop ... ###<br>
><br>
>    0:*** TESTING C   ./nc_test for format CDF-1                         ------ failed<br>
><br>
>    0:<br>
><br>
</span>>    0: FAILURE at line 149 of test_read.c: remove of ./<a href="http://scratch.nc" rel="noreferrer" target="_blank">scratch.nc</a> failed*** Testing test_ncmpi_open                ...<br>
<span class="">><br>
>    0: ### 1 FAILURES TESTING test_ncmpi_open! Stop ... ###<br>
><br>
>    0:<br>
><br>
>    0:./nc_test: expects 0 failures ... Total number of failures: 1<br>
><br>
>    1:*** TESTING C   ./nc_test for format CDF-1                         ------ failed<br>
><br>
>    1:<br>
><br>
</span>>    1: FAILURE at line 149 of test_read.c: remove of ./<a href="http://scratch.nc" rel="noreferrer" target="_blank">scratch.nc</a> failed*** Testing test_ncmpi_open                ...<br>
<div class="HOEnZb"><div class="h5">><br>
>    1: ### 1 FAILURES TESTING test_ncmpi_open! Stop ... ###<br>
><br>
>    1:<br>
><br>
>    1:./nc_test: expects 0 failures ... Total number of failures: 1<br>
><br>
>    2:*** TESTING C   ./nc_test for format CDF-1                         ------ failed<br>
><br>
>    2:<br>
><br>
>    2:<br>
><br>
>    2:./nc_test: expects 0 failures ... Total number of failures: 1<br>
><br>
>    3:*** Testing test_ncmpi_open                ...    5 good comparisons. ok<br>
><br>
> and the parallel test fail in the build step with:<br>
><br>
> glade/apps/opt/modulefiles/ys/cmpwrappers/mpif90 -c -g  -O0 -I../../src/lib  -I../../src/libf -I../../src/libf90  mcoll_testf.f90<br>
><br>
> mcoll_testf.f90:257:22:<br>
><br>
><br>
><br>
>          t1 = MPI_Wtime ( )<br>
><br>
>                       1<br>
><br>
> Error: Name 'mpi_wtime' at (1) is an ambiguous reference to 'mpi_wtime' from module 'mpi_constants'<br>
><br>
> mcoll_testf.f90:292:22:<br>
><br>
><br>
><br>
>          t2 = MPI_Wtime ( )<br>
><br>
>                       1<br>
><br>
> Error: Name 'mpi_wtime' at (1) is an ambiguous reference to 'mpi_wtime' from module 'mpi_constants'<br>
><br>
> mcoll_testf.f90:313:20:<br>
><br>
><br>
><br>
>        t3 = MPI_Wtime ( )<br>
><br>
>                     1<br>
><br>
> Error: Name 'mpi_wtime' at (1) is an ambiguous reference to 'mpi_wtime' from module 'mpi_constants'<br>
><br>
> All with svn revision 2056​<br>
><br>
><br>
><br>
> --<br>
> Jim Edwards<br>
><br>
> CESM Software Engineer<br>
> National Center for Atmospheric Research<br>
> Boulder, CO<br>
<br>
</div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div><div>Jim Edwards<br><br></div><font size="1">CESM Software Engineer<br></font></div><font size="1">National Center for Atmospheric Research<br></font></div><font size="1">Boulder, CO</font> <br></div></div>
</div>