Hi,<br><br>I finally succeeded to install pnetcdf-1.1.1 after changing &quot;--with-mpi=where/I/installed&quot; and can run a FLASH IO benchmark.<br>I appreciate all your help.<br><br>- Shawn<br><br><div class="gmail_quote">
On Wed, Feb 3, 2010 at 11:59 AM, Rob Latham <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:robl@mcs.anl.gov">robl@mcs.anl.gov</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
<div class="im">On Wed, Feb 03, 2010 at 11:40:37AM -0500, Shawn Kim wrote:<br>
&gt; Hi,<br>
&gt;<br>
&gt; I did autoreconf before &quot;configure&quot;. I attached the output from configure<br>
&gt; and macros.make.<br>
&gt; Thank you.<br>
&gt;<br>
&gt; - Shawn<br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt; $ ./configure<br>
&gt; --prefix=/home/mdl/yuazhang/IOTracing/benchmark/parallel-netcdf-1.1.1/install<br>
&gt; --with-mpi=/home/mdl/yuazhang/IOTracing/mpich2-1.0.8 --enable-fortran | &amp;<br>
<br>
</div>Is mpich2-1.0.8 the directory where you built mpich2, or is it the<br>
directory where you installed it?<br>
<div class="im"><br>
&gt; checking mpi C compiler ... configure: WARNING: mpicc either does not exist<br>
&gt; or is not executable: falling back to mpicc<br>
&gt; using mpicc<br>
&gt; checking mpi C++ compiler ... using<br>
&gt; /home/mdl/yuazhang/IOTracing/mpich2-1.0.8/bin/mpicxx<br>
&gt; checking mpi Fortran 77 compiler ... configure: WARNING: mpif77 either does<br>
&gt; not exist or is not executable: falling back to mpif77<br>
&gt; using mpif77<br>
&gt; checking mpi Fortran 90 compiler ... configure: WARNING: mpif90 either does<br>
&gt; not exist or is not executable: falling back to mpif77<br>
&gt; using mpif77<br>
<br>
</div>These lines all point to the former.<br>
<div><div></div><div class="h5"><br>
==rob<br>
<br>
--<br>
Rob Latham<br>
Mathematics and Computer Science Division<br>
Argonne National Lab, IL USA<br>
</div></div></blockquote></div><br>