<html><head><meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=utf-8"></head><body dir="auto"><div dir="ltr"></div><div dir="ltr">What you see is not related to MAXNEL otherwise genmap would bail out with an error message. </div><div dir="ltr"><br>On 7 Nov 2018, at 19:01, nek5000-users--- via Nek5000-users <<a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.gov</a>> wrote:<br><br></div><blockquote type="cite"><div dir="ltr">
<div id="composeWebView_editable_content" data-mailruapp-compose-id="composeWebView_editable_content" style="text-align: left;"><div>Hi!</div><div><br></div><div>Maybe you should increase MAXNEL parameter in maketools script (Nek5000/tools)?</div><div><br></div><div>nek5000-users  <<a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.gov</a>>:<br></div>    <div id="composeWebView_previouse_content" data-mailruapp-compose-id="composeWebView_previouse_content"><blockquote id="mail-app-auto-quote" style="border-left-width: 1px; border-left-style: solid; border-left-color: rgb(0, 95, 249); margin: 10px 0px 10px 5px; padding: 0px 0px 0px 10px; display: inherit;"><div class="js-helper js-readmsg-msg">
        
        <div>
                <base target="_self" href="https://e.mail.ru/">
                
            <div id="style_15416071080000000174_BODY">Hello,<br>
I created a ".re2" mesh by converting an Exodus (".exo") mesh from Cubit <br>
15.0 using the "exo2nek" script. It's a relatively large mesh (780k <br>
elements) and I need to run it using parallel processing, and so I <br>
wanted to use the "genmap" script.<br>
<br>
However, I keep getting these errors, no matter what input mesh <br>
tolerance value I use, from 0.2 to 0.00001):<br>
<br>
genmap<br>
Input .rea / .re2 name:<br>
RCF_3D_FullSimple<br>
  reading RCF_3D_FullSimple.re2<br>
Input mesh tolerance (default 0.2):<br>
NOTE: smaller is better, but generous is more forgiving for bad meshes.<br>
0.00001<br>
  reading mesh data ...<br>
  start locglob_lexico:           8      775728     6205824 <br>
1.0000000000000001E-005<br>
  locglob:           1           1     6205824<br>
  locglob:           2       11290     6205824<br>
  locglob:           3       15413     6205824<br>
  locglob:           1      632909     6205824<br>
  locglob:           2      632909     6205824<br>
  locglob:           3      632909     6205824<br>
  locglob:           1      632909     6205824<br>
  locglob:           2      632909     6205824<br>
  locglob:           3      632909     6205824<br>
<br>
593741     2     4  Matrix:  SELF!!<br>
        1 SELF!!   313837   313837   313837   313837<br>
        2 SELF!!   313837   313837   313837   313837<br>
  cont: SELF!!      593741<br>
<br>
  ABORT: SELF-CHK            1           2      593741           0<br>
  Try to tighten the mesh tolerance!<br>
<br>
            0  quit<br>
<br>
<br>
Do you have any idea what this means? Just from the output, it looks <br>
like it's saying there are coincident vertices or elements? Is it a <br>
problem with my mesh or with running the script?<br>
<br>
Thanks,<br>
Matt<br>
_______________________________________________<br>
Nek5000-users mailing list<br>
<a href="mailto:Nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">Nek5000-users@lists.mcs.anl.gov</a><br>
<a href="https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/nek5000-users" target="_blank">https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/nek5000-users</a><br>
</div>
            
        
                <base target="_self" href="https://e.mail.ru/">
        </div>

        
</div></blockquote></div></div>
<pre>_______________________________________________<br>
Nek5000-users mailing list<br>
<a href="mailto:Nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">Nek5000-users@lists.mcs.anl.gov</a><br>
<a href="https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/nek5000-users">https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/nek5000-users</a><br>
</pre></div></blockquote></body></html>