<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">
</head>
<body dir="auto">
<style type="text/css" style="display:none;"><!-- P {margin-top:0;margin-bottom:0;} --></style>
<div id="divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:#000000;font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif;" dir="ltr">
<p><br>
</p>
<p>Hi All,</p>
<p><br>
</p>
<p>Genbox generates a tensor-product array of elements with layout:</p>
<p><br>
</p>
<p>   (ix , iy, iz)    (ix fastest moving, iy 2nd fastest, iz 3rd fastest)</p>
<p><br>
</p>
<p>If you want to have multiple boxes that continue in this ordering, you could</p>
<p>do the following, say:</p>
<p><br>
</p>
<p>box (1)</p>
<p>-5 -5 -5</p>
<p>-1 1 1.0</p>
<p>-1 1 1.0</p>
<p>0 2   1.0</p>
<p><br>
</p>
<p>box(2)</p>
<p>-5 -5 -10</p>
<p>-1 1 1</p>
<p>-1 1 1</p>
<p>1.0 9.0</p>
<p><br>
</p>
<p>etc</p>
<p><br>
</p>
<p>This would stack a 5x5x10 box on top of a 5x5x5 box</p>
<p><br>
</p>
<p>and topologically is the same as a 5x5 x (15) box</p>
<p><br>
</p>
<p>... i.e., things get concatenated in the z direction.</p>
<p><br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>Also, note that you can use custom distributions in each direction, e.g.,</p>
<p><br>
</p>
<p>box</p>
<p>3  3  -5</p>
<p>0 0.1 0.3  10</p>
<p>0  .9   22 33</p>
<p>-5  9  1.5</p>
<p><br>
</p>
<p>which would give spacing [ 0 .1 .3 10] in the x direction</p>
<p><br>
</p>
<p>[0 .9 22 33] in y</p>
<p><br>
</p>
<p>and geometric partition of 5 elements in z on [-5:9]</p>
<p>with size ratio 1.5 between each adjacent z level.</p>
<p><br>
</p>
<p>hth</p>
<p><br>
</p>
<p>Paul</p>
<p><br>
</p>
</div>
<hr style="display:inline-block;width:98%" tabindex="-1">
<div id="divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" style="font-size:11pt" color="#000000"><b>From:</b> Nek5000-users <nek5000-users-bounces@lists.mcs.anl.gov> on behalf of nek5000-users@lists.mcs.anl.gov <nek5000-users@lists.mcs.anl.gov><br>
<b>Sent:</b> Thursday, September 14, 2017 10:20:27 AM<br>
<b>To:</b> shivang agarwal<br>
<b>Subject:</b> Re: [Nek5000-users] Problems with post-processing multiple-boxes in MATLAB and Python</font>
<div> </div>
</div>
<div>
<div>Hi Daniel,</div>
<div id="AppleMailSignature"><br>
</div>
<div id="AppleMailSignature">I've had a similar problem before. Can you send your .box file so we can have a look? </div>
<div id="AppleMailSignature"><br>
</div>
<div id="AppleMailSignature">Best regards,</div>
<div id="AppleMailSignature"><br>
</div>
<div id="AppleMailSignature">Goran </div>
<div><br>
On Sep 14, 2017, at 11:13, "<a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.gov</a>" <<a href="mailto:nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">nek5000-users@lists.mcs.anl.gov</a>> wrote:<br>
<br>
</div>
<blockquote type="cite">
<div>
<div id="divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:#000000;font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif;" dir="ltr">
<p>Hi All,</p>
<p><br>
</p>
<p>I am using Nek5000 to simulate a buoyant plume rising from the centre of the floor of a square 2D domain.  I am trying to use MATLAB and/or Python to post-process my data.  Everything works fine when I post-process a simulation that was initialised with
 only one box in my .box file.  When, however, I run a simulation with multiple boxes (i.e. to cluster nodes), the local to global mapping of elements appears to go wrong and puts data into the wrong places.  When plotting a contour plot of coordinates for
 example, where I would expect a constantly changing colour gradient, I instead get back colour gradients in four quarters.</p>
<p><br>
</p>
<p>I haven't used this list before so if I need to provide examples of images or code I can do.  If anybody else has had this problem and has found a way to overcome it by finding the correct mapping some help would be very much appreciated.</p>
<p><br>
</p>
<p>Best regards,</p>
<p><br>
</p>
<p>Daniel Ward<br>
</p>
</div>
</div>
</blockquote>
<blockquote type="cite">
<div><span>_______________________________________________</span><br>
<span>Nek5000-users mailing list</span><br>
<span><a href="mailto:Nek5000-users@lists.mcs.anl.gov">Nek5000-users@lists.mcs.anl.gov</a></span><br>
<span><a href="https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/nek5000-users">https://lists.mcs.anl.gov/mailman/listinfo/nek5000-users</a></span><br>
</div>
</blockquote>
</div>
</body>
</html>